NAAT менен ПТРдин негизги айырмасы NAAT бул генетикалык материалды бир нече ыкмалар менен күчөтүүчү, анын ичинде полимераздык чынжыр реакциясы, жиптин жылышуусу же транскрипциянын ортомчулугу менен күчөтүлгөн, ал эми PCR генетикалык материалды бир гана колдонуу менен күчөтүүчү ыкма. термикалык велосипед тебүү.
Патогендер негизинен алардын генетикалык материалдарынын күчөшү менен аныкталат. Бул чөйрөдөгү ыкмалардын көбү реалдуу убакытта конкреттүү ырааттуулукту күчөтүү аркылуу патогендин генетикалык материалын аныктоого багытталган. Ошондуктан, натыйжалар диагностикалык контекстте абдан тез өндүрүлөт. NAAT, ПТР, биосенсор жана LCR лабораторияларда патогендин генетикалык материалын күчөтүү үчүн колдонулган бир нече ыкмалар болуп саналат.
NAAT деген эмне?
Нуклеин кислотасын күчөтүү тести (NAAT) молекулалык биологиядагы метод, ал генетикалык материалды полимераздык чынжыр реакциясы, жиптин жылышын күчөтүү же транскрипция аркылуу күчөтүү сыяктуу бир нече ыкмаларды колдонуу менен күчөтөт. Генетикалык материалды күчөтүү NAAT процедурасында байламталуу чынжыр реакциясы жана тармакталган ДНК реакциясы (квантиплекс б ДНК) сыяктуу ыкмалар аркылуу да жүргүзүлүшү мүмкүн. NAAT Watson-Crick базалык жупташуу өзгөчөлүгүн колдонот. NAAT процедурасында бир саптуу зонд же праймер молекуласы максаттуу ДНК же РНК молекуласы менен гибридделет. Демек, зонд жипинин дизайны аныктоонун сезгичтигин жана өзгөчөлүгүн жогорулатуу үчүн абдан маанилүү. Андан кийин, NAAT кийинки кадамы генетикалык материалды аныктоо үчүн анын көптөгөн көчүрмөлөрүн жасап, аны күчөтөт.
01-сүрөт: NAAT
NAAT учурда Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis жана SARS-COV2 сыяктуу бир нече козгогучтарды аныктоо үчүн колдонулат. Мындан тышкары, NAAT тести терезе мөөнөтүн кыскартуу үчүн иштелип чыккан. Терезе мезгили - бул оорулууга инфекция жуккандан жана антитело тесттери оң деп табылганга чейинки убакыт аралыгы. Андан тышкары, NAAT скрининг ыкмасы биринчи жолу 1999-жылы FDA тарабынан бекитилген. NAAT көптөгөн артыкчылыктарга ээ, анын ичинде ДНКнын же РНКнын төмөн деңгээлин аныктоо, жогорку сезгичтик жана жогорку өзгөчөлүк.
ПЦР деген эмне?
ПТР молекулалык биологиядагы бир гана жылуулук циклин колдонуу менен генетикалык материалды күчөтүүчү ыкма. ПТР полимераздык чынжыр реакциясын билдирет. Бул бактериялар, козу карындар жана вирустар сыяктуу белгилүү бир организмдин генетикалык материалын аныктоочу тест. Ооруну диагностикалоодо, ПЦР изилдөө учурунда адамда патоген бар болсо, патогендин бар экендигин аныктайт. Ооруну диагностикалоодо ПТР протоколу бир нече кадамдарды камтыйт, анын ичинде үлгүлөрдү чогултуу, ДНКны алуу, ПТР жана секвенирлөө. Патогендерди текшерүүдө чогултулган үлгү генетикалык материалды (ДНК же РНК) алуу үчүн колдонулат. ПТР процедурасы термикалык цикл деп аталган ПТР машинасынын ичинде генетикалык материалдын миллиондогон көчүрмөсүн өндүрүү үчүн атайын химиялык заттарды, праймерлерди жана ферменттерди талап кылат. ПЦР продуктусунан күчөгөндөн кийин патогенди аныктоого болот. Илимпоздор натыйжаларды чечмелөө үчүн атайын программаны колдонушат.
02-сүрөт: PCR
Андан тышкары, учурда изилдөөдө колдонулган ПТРдин ар кандай түрлөрү бар. Алардын арасында RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD жана Nested PCR бар. ПТР өзгөчө фарингитти (Стрептококк фарингит), атиптик пневмонияны (Chlymidia pneumoniae), кызамыкты (Morbillivirus), гепатитти (HBV) жана урук-жыныс органдарынын жаралуу инфекциясын (Haemophilus ducreyi) аныктоодо пайдалуу.
NAAT менен ПТРдин кандай окшоштуктары бар?
- NAAT жана ПТР - генетикалык материалды көбөйтүү үчүн колдонулган эки маанилүү молекулярдык биологиялык ыкма.
- Нуклеиндик кислоталар (ДНК же РНК) эки ыкма менен тең күчөтүлөт.
- Алар тез жана тез техникалар.
- Учурда эки ыкма тең ооруну аныктоо үчүн колдонулат.
- Алар кадимки ыкмаларга караганда кымбат.
NAAT менен ПТРдин ортосунда кандай айырма бар?
NAAT бир нече ыкмаларды колдонуу менен генетикалык материалды күчөтүүчү молекулярдык биологиядагы метод, ал эми ПТР молекулалык биологиядагы генетикалык материалды жылуулук циклин гана күчөтүүчү ыкма. NAAT полимераздык чынжыр реакциясы, катардын жылышын күчөтүү, транскрипция аркылуу күчөтүү, лигация чынжыр реакциясы жана тармакталган ДНК реакциясы (квантиплекс б ДНК) сыяктуу генетикалык материалдарды күчөтүү ыкмаларын колдонот. Башка жагынан алганда, ПТР RT-PCR сыяктуу генетикалык материалдарды күчөтүү ыкмаларын колдонот. Multiplex ПТР, RAPD, Nested PCR. Демек, бул NAAT менен PCRдин ортосундагы негизги айырма.
Төмөнкү инфографикада NAAT менен ПТРдин ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – NAAT vs PCR
Лабораторияларда генетикалык материалдарды күчөтүү үчүн колдонулган ар кандай молекулярдык биологиялык аспаптар бар. NAAT, ПТР, биосенсор жана LCR - бул бир нече ыкмалар. NAAT бул полимераздык чынжыр реакциясы, жиптин жылышуусу же транскрипция аркылуу күчтөндүрүү сыяктуу бир нече ыкмаларды колдонуу менен генетикалык материалды күчөтүүчү молекулярдык биологиялык ыкма. ПТР - молекулалык биологиядагы жылуулук циклин колдонуу менен генетикалык материалды күчөтүүчү ыкма. Ошентип, бул NAAT менен ПТРдин ортосундагы негизги айырма.
