Консенсус ПТР менен Пан ПТРдин негизги айырмасы - консенсус ПТР дайыма консервацияланган аймактарды бутага алат, ал эми Пан ПТР топтун ар кандай штаммдарын аныктоо үчүн өзгөрүлмө аймактарды бутага алат
Полимераздык чынжыр реакциясы (ПТР) – денатурация, күйдүрүү жана узартуу сыяктуу үч негизги кадамдан турган генди күчөтүү ыкмасы. Бул диагностикада жана молекулярдык идентификацияда кеңири колдонулат. Консенсус ПТР жана Пан ПТР ыкмалары ар бир ПТР түрү колдонгон праймер максаттарына негизделген.
Консенсус ПТР деген эмне?
Консенсус ПТР – бул белгилүү бир түр же тукум үчүн сакталган аймакка багытталган ПТР ыкмасы. Ошондуктан, күчөтүү үчүн өтө сакталган аймактар тандалат. Бул ыкма аркылуу организмдерди алардын консенсусунун негизинде аныктоого жана айырмалоого болот. Бул ыкма белгилүү бир түр үчүн сакталган аймакты аныктайт. Мисалы, бактериялардын 16s рРНК аймагы бактериялар арасында сакталган аймак бойдон калууда. Ошондуктан, күчөтүү үчүн бир гана праймер топтому талап кылынат. Көпчүлүк учурларда, сакталган аймак үчүн универсалдуу праймер колдонулушу мүмкүн.
01-сүрөт: ПТР техникасы
Консенсустук ПТР ыкмасын колдонуу менен түрлөрдүн мүнөздөмөсү жана эволюциялык мамилелерди чыгарууга болот. Белгилүү бир үлгүдөгү организмдин күчөтүү эффективдүүлүгүнүн негизинде организмдин топко карата консенсусу да чыгарылышы мүмкүн. Мындан тышкары, консенсус ПТР жүргүзүү филогенетикалык изилдөөлөр үчүн абдан маанилүү болуп саналат. Ал түрдү аныктоого мүмкүндүк берет жана белгилүү бир организмдин четтөөсүн жалпы ата теги боюнча чечмелейт.
Pan PCR деген эмне?
Пан ПТР – ПТРдин мультиплекстөө режими. Бул техникада, ар кандай штаммдар ар кандай праймер буталары менен күчөтүлөт. Бирок, максаттар штамм топтору үчүн жалпы максаттар болушу мүмкүн. Ошентип, Пан ПТРде бир эле учурда экиден ашык праймер топтомун колдонсо болот. Ал бир түтүк реакциясы методунда же көп түтүктүү реакция ыкмасы катары болушу мүмкүн. Пан ПТР консенсустук ПТРге салыштырмалуу көбүрөөк убакытты талап кылат жана татаалыраак. Ушундан улам Пан ПТРде ПТР натыйжаларын чечмелөө дагы татаалыраак болушу мүмкүн.
Пан ПТРдин негизги колдонулушу молекулярдык диагностикада. Бул максаттуу күчөтүү аркылуу түрдүн ар кандай штаммдарын айырмалоого мүмкүндүк берет. Пан ПТР - бул ооруну пайда кылган бир түрдүн ар кандай штаммдарын аныктоо үчүн идеалдуу ыкма. Көпчүлүк учурларда, ар кандай ден соолук шарттары үчүн Пан ПТР ыкмаларын автоматташтыруу абдан маанилүү жана ишенимдүү жана жогорку эффективдүү техника болуп саналат.
Consensus PCR жана Pan PCR ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Консенсус ПТР жана Пан ПТР – ПТР ыкмаларынын эки түрү.
- Эки жол-жобо тең жалпы үч этаптуу процедураны аткарат – денатурация, күйдүрүү жана узартуу.
- Алар максаттуу праймерлерди колдонушат.
- Эки реакция тең термикалык циклдерде ишке ашат.
- Бул реакцияларды автоматташтырса болот.
- Экөө тең молекулярдык диагностикада жана идентификацияда колдонулушу мүмкүн; бирок тактык ар кандай.
- Бул процедуралар текшерүүнү талап кылат.
Консенсус ПТР менен Пан ПТРдин ортосунда кандай айырма бар?
Консенсус да, Пан ПТР да бирдей күнүмдүк процедураны аткарышат. Бирок, консенсус ПТР менен Пан ПТРдин ортосундагы негизги айырма ар бир процедура колдонгон праймер максаттарына негизделген. Консенсус ПТР ар дайым сакталган аймактарды бутага алса, Пан ПТР топтун ар кандай штаммдарын аныктоо үчүн өзгөрүлмө аймактарды бутага алат. Бул айырмадан улам, праймерди иштеп чыгуу протоколдору, колдонулган праймер топтомдорунун саны жана конкреттүү колдонмолор ар кандай болот.
Төмөнкү инфографика Consensus PCR жана Pan PCR ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача маалымат – Консенсус ПТР жана Пан ПТР
ПТР, Мулли тарабынан киргизилген, молекулярдык биология колдонмолорунда маанилүү революциялык ролду ойнойт. Консенсус жана Пан ПТР алардын негизги максаттуу аймактарына негизделген ПТРдин эки түрү. Консенсус ПТР консервацияланган аймактарды бутага алса, Пан ПТР өзгөрүлмө аймактарды бутага алат жана штаммдарды аныктоодо маанилүү ролду ойнойт. Консенсус ПТР менен Пан ПТРдин ортосундагы негизги айырмачылыктан улам, ПТРдин ар бир түрүнүн өзгөчө функциялары филогенетикалык анализден молекулярдык мүнөздөмөдөн молекулярдык диагностикага чейин өзгөрөт.
