Консервацияланган жана консенсус ырааттуулугунун ортосундагы негизги айырма, сакталган ырааттуулук нуклеиндик кислоталардын же аминокислоталардын окшош ырааттуулугун билдирет, ал эми консенсус ырааттуулугу көбүнчө кездешкен нуклеотиддердин ырааттуулугу же табылган аминокислота ырааттуулугу болуп саналат. ДНКнын же РНКнын же белоктун жогорку деңгээлде сакталган аймагында.
Организмдер окшош жана башка мүнөздөмөлөрдү бөлүшөт. Организмдердин ортосундагы мамилелерди изилдөөдө жана аларды классификациялоодо организмдердин геному же генетикалык түзүлүшү абдан маанилүү. Ар кандай организмдердин арасында кеңири таралган кээ бир нуклеотиддер же аминокислота тизмеги бар. Консервацияланган ырааттуулук - бул түрлөрдүн арасында шайкеш келген нуклеин кислотасы же аминокислота тизмеги. Ошондуктан, алар филогенетикалык дарактарды пайда кылууда филогенетикалык жактан маанилүү. Консервацияланган ырааттуулукта көбүрөөк кездешкен спецификалык нуклеотид тизмектери бар. Алар консенсус ырааттуулугу катары белгилүү.
Сакталган ырааттуулук деген эмне?
Сакталган ырааттуулук - бул нуклеин кислотасынын ырааттуулугу же түрлөр арасында окшош аминокислота тизмеги. Демек, ал эволюция бою түр боюнча ырааттуу. Негизинен бул тизмектер табигый тандалуу аркылуу сакталат. Алар филогенетикалык даракка чейин өзгөрүүсүз бойдон калууда. Демек, сакталган тизмектер филогенетикалык дарактарды курууда маанилүү. Жогорку сакталган тизмектер көбүнчө маанилүү функционалдык мааниге ээ деп эсептелет. Алар генетикалык ооруларды аныктоодо да пайдалуу. Бирок, сакталган ырааттуулук коддоочу же коддолбогон нуклеиндик кислота тизмектери болушу мүмкүн. Мындан тышкары, сакталган тизмектер мутациянын жайыраак ылдамдыгын көрсөтөт. Демек, алар курамында өтө аз өзгөрүүлөрдү көрсөтөт; кээде, алар бардык муундарда өзгөрүүлөрдү көрсөтпөйт.
01-сүрөт: Сакталган ырааттуулук
Рибосомалардын РНК компоненттери жашоонун бардык чөйрөлөрүндө бар, эукариоттордогу гомеобокс тизмектери жана бактериялардагы tmRNA жогорку деңгээлде сакталган тизмектердин бир нече мисалы болуп саналат. Биоинформатика усулдары, өзгөчө ырааттуулукту тегиздөө куралы колдонулганда сакталган ырааттуулуктарды аныктоо оңой. Мындан тышкары, бир нече ырааттуулукту тегиздөө сакталган тизмектердин визуализациясын жеңилдетет.
Консенсус ырааттуулугу деген эмне?
Консенсус ырааттуулугу – адатта ДНКнын же РНКнын берилген сакталган аймагында табылган ырааттуулук. Бул абдан өзгөчө нуклеотиддердин тизмеги. Мисал катары, E. coli промоторлорунда TATAAT (Pribnow куту) катары -10до консенсус ырааттуулугу бар, алар жогорку деңгээлде сакталган тизмектер. Ошо сыяктуу эле, дагы бир консенсус ырааттуулугу бар: E. coli промоутерлеринде TTGACA да -35те. Консенсус тизмеги "кутулар" деп да белгилүү.
02-сүрөт: Консенсус ырааттуулугу
ДНК жана РНКдан тышкары белоктор да аминокислоталардын консенсус тизмегине ээ. Протеинди байланыштырган жерлер көбүнчө консенсус ырааттуулугу менен көрсөтүлөт. Чектөө ферменттеринин консенсус ырааттуулугу да бар. Мындан тышкары, бириктирүү сайттары да консенсус ырааттуулугу болуп саналат. Консервацияланган ырааттуулуктарга окшоп, консенсус тизмектерин биоинформатика куралдары менен эсептеп, көрүүгө болот.
Сакталган жана Консенсус ырааттуулугу ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Сакталган жана консенсус тизмектери - бул нуклеин кислотасы же аминокислота тизмеги, алар бардык түрлөрдө кеңири таралган.
- Сакталган жана консенсус тизмектерин биоинформатика куралдары аркылуу көрүүгө болот.
- Алар молекулярдык биологияда кеңири колдонулат.
Сакталган жана Консенсус ырааттуулугунун ортосунда кандай айырма бар?
Консервацияланган ырааттуулук - бул нуклеиндик кислота же аминокислота тизмеги, ал түрлөр арасында шайкеш келет, ал эми консенсус тизмектери абдан спецификалык жана белгилүү бир сакталган аймакта жалпы табылган негиздер же аминокислоталар. Ошентип, бул сакталган жана консенсус ырааттуулугун ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, консервацияланган ырааттуулук менен консенсус ырааттуулугунун дагы бир айырмасы - консервацияланган ырааттуулуктар филогенетикалык жактан маанилүү, ал эми консенсус тизмектери көбүнчө протеинди байланыштыруучу жерлер, биригүү жерлери, чектөө ферменттерин кесүү жерлери ж.б. болуп саналат.
Корытынды – Консервацияланган жана Консенсус ырааттуулугу
Сакталган ырааттуулук - тирүү түрлөрдүн арасында окшош болгон нуклеиндик кислоталардын же белоктордун ырааттуулугу. Промотор, рибосоманы байланыштыруучу жер, репликациянын келип чыгышы жана гистон протеининин аминокислота ырааттуулугу сакталган тизмектердин бир нече мисалы болуп саналат. Ал эми, консенсус тизмектери белгилүү бир сакталган тизмекте көбүрөөк кездешкен белгилүү негиздер же аминокислоталар. -10 куту, -35 куту E. coli промоутору, протеинди байланыштыруучу сайттар, сплайс сайттары жана сайттарды таануучу чектөө ферменттери консенсус тизмегинин бир нече мисалы болуп саналат. Ошентип, бул сакталган жана консенсус ырааттуулугунун ортосундагы айырманын корутундусу.
