Синтения менен коллинеардуулуктун ортосундагы негизги айырма – синтения – бул түрдөгү бир хромосомадагы генетикалык локустун физикалык ко-локализациясы, ал эми коллинеардуулук – ар кандай түрдөгү бир хромосомадагы генетикалык локустун физикалык ко-локализациясы. ошол эле тартип.
Синтения жана коллинеардуулук геномикада бири-бирин алмаштырган эки термин. Эки термин тең ар кандай түрдөгү хромосомалардагы гендердин локализациясынын үлгүлөрүн сүрөттөйт. Таксондор арасындагы бул байланышкан ген түзүлүштөрү гендердин жалпы ата-тегин чыгарууда баалуу маалымат болуп саналат. Синтения түрдөгү бир хромосомадагы генетикалык локустардын физикалык ко-локализациясын билдирет. Коллинеардуулук бир хромосомадагы генетикалык локустардын физикалык ко-локализациясын, ар кандай түрдөгү бирдей тартипти сактоону билдирет. Демек, бул синтениянын бир түрү.
Синтени деген эмне?
Ар кандай түрлөрдө бир хромосомада жайгашкан гендердин жыйындысы болот. Жана, ар кандай түрдөгү бир хромосомадагы гендердин физикалык ко-локализациясы синтения деп аталат. Ошондой эле, бул гендер бир хромосома боюнча бири-бирине абдан жакын кездешет. Гендердин тартиби сөзсүз эле бирдей болушу мүмкүн эмес. Бирок, бир хромосома боюнча бири-бирине жакын гендердин локализациясы синтенияда ишке ашат. Демек, синтения негизинен хромосомадагы гендердин таралышын сүрөттөйт. Гендердин ко-локализациясынын бул моделдери ар кандай түрлөрдүн ортосундагы мамилелерди жана алардын эволюциясын көрсөтөт. Бирок, транслокациялар, инверсия жана хромосомалардын биригүү сыяктуу хромосомалардын кайра түзүлүшү, ж.б. кайталануу, жоготуу жана бирдей эмес гомологдук рекомбинация сыяктуу синтения бузулушу мүмкүн.
01-сүрөт: Synteny
Бардык байланышкан гендер синтеникалык деп эсептелет. Бирок, бардык синтеникалык гендер сөзсүз түрдө байланышкан эмес. Алар жалпы хромосома тизмегине ээ. Адамдардын башка сүт эмүүчүлөр менен көптөгөн синтеникалык гендери бар. Андан тышкары, көптөгөн дан өсүмдүктөрүнүн синтендик гендери бар.
Коллинеардуулук деген эмне?
Коллинеардуулук – гендердин жыйындысы ар кандай түрлөрдүн бир хромосомасында ата-теги түрдөгүдөй тартипте жайгашкан синтениянын өзгөчө түрү. Демек, эгерде коллинеардуулуктан четтөө болсо, ал ишенимдүү филогенетикалык мүнөзгө ээ болот, анткени коллинеарлуулук гендердин жалпы ата-тегин түшүндүрөт.
02-сүрөт: Коллинеардуулук
Көп тараптуу коллинеардуулук анализи тектеш түрлөр жана алардын филогениясы жөнүндө алда канча ишенимдүү маалымат берет.
Синтениянын жана коллинеардуулуктун кандай окшоштуктары бар?
- Синтенияда да, коллинеардуулукта да эки башка түрдөгү локустардын жыйындысы бир хромосомада жайгашкан.
- Бул терминдер бир хромосомадагы генетикалык локустардын физикалык ко-локализациясын сүрөттөйт.
- Коллинеардык синтениянын өзгөчө түрү.
- Кээде эки термин тең геномикада синоним катары колдонулат.
- Эгер эки аймакта коллинеарлык болсо, алар синтенус экени анык.
- Алар филогенияны чыгарууда пайдалуу.
Синтения менен коллинеардуулуктун ортосунда кандай айырма бар?
Синтения жана коллинеардуулук геномикада бири-бирин алмаштырган эки термин. Синтения ар кандай түрдөгү бир хромосомадагы гендердин жыйындысынын физикалык ко-локализациясын билдирет. Коллинеардуулук – гендердин жыйындысы ар кандай түрлөрдүн арасында бирдей тартипте чогуу локализацияланган синтениянын бир түрү. Демек, бул синтения менен коллинеардуулуктун ортосундагы негизги айырма.
Кыскача – Синтени жана Коллинеардуулук
Синтения жана коллинеардуулук терминдери ар кандай түрдөгү бир хромосомада жайгашкан гендердин жыйындысын билдирет. Чындыгында, бул гендер ар кандай түрдөгү бир хромосомада ко-локализацияланган. Синтения бир эле хромосомадагы топтолгон гендердин ар кандай түрдөгү физикалык ко-локализациясын сүрөттөйт, ал эми коллинеарлуулук гендердин жыйындысы бирдей тартипте биргелешип локализацияланган синтениянын өзгөчө формасы. Ошентип, бул синтения менен коллинеардуулуктун ортосундагы айырманы жыйынтыктайт.
