Протеин суббирдиги менен домендин ортосундагы негизги айырма - бул белоктун өзүнчө полипептиддик чынжырчасы, ал башка полипептиддик чынжырлар менен белок комплексин түзүү үчүн чогулуп, протеин домени полипептиддик чынжырдын чектеш аймагы болуп саналат. тез-тезден өз алдынча компакт, жергиликтүү жана жарым көз карандысыз бирдикке айланган белоктун.
Белок суббирдиги жана домен мультимерикалык белоктун абдан маанилүү бөлүктөрү. Белоктор - полипептиддерден жасалган полимерлер. Ар бир полипептиддик чынжыр аминокислота деп аталган мономерден түзүлөт. Татаал протеин өзүнчө структуралык бирдиктерди камтыйт, мисалы суббирдиктер, домендер, мотив жана бүктөм. Татаал белоктун бул структуралык бирдиктери анын түзүлүшү жана акыр аягында функциясы үчүн өтө маанилүү.
Белок суббирдиги деген эмне?
Белок суббирдиги – белок комплексин түзүү үчүн башка полипептиддик чынжырлар менен чогулган белоктун өзүнчө полипептиддик чынжырчасы. Структуралык биологияда белок суббирдиги башка белок молекулалары менен биргелешип белок комплексин пайда кылган бир белок молекуласы. Табигый протеиндер гемоглобин жана ДНК полимераза сыяктуу салыштырмалуу аз сандагы суббирдиктерге ээ. Ошондуктан, алар олигомердик деп аталат. Башка белоктор көп сандагы суббирдиктерден турат, ошондуктан алар мультимерикалык деп сыпатталат. Мисалы, микротүтүкчөлөр жана башка цитоскелет белоктору мультимердүү. Мультимердик протеиндин суббирдиктери окшош (гомологиялык) же таптакыр окшош эмес (гетерологиялык) болушу мүмкүн.
Сүрөт 01: Протеин суббирдиги
Кээ бир мультимердик белоктордо бир суббирдик каталитикалык суббирдик болушу мүмкүн. Башка жагынан алганда, экинчиси - жөнгө салуучу бөлүм. Каталитикалык суббирдиктин функциясы ферменттик реакцияны катализдөө, ал эми жөнгө салуучу бөлүмчөнүн функциясы анын активдүүлүгүн жеңилдетүү же бөгөт коюу болуп саналат. Чогулган кезде каталитикалык жана жөнгө салуучу бөлүмчөлөрдөн турган фермент, адатта, холофермент деп аталат. Мисалы, I класстагы фосфоинозитид 3-киназа ферментинин p110 каталитикалык суббирдиги жана p85 жөнгө салуучу суббирдиги бар. Болгондо да, бир протеин ар бир бөлүмчө үчүн бир генге ээ болушу керек. Себеби суббирдик бир коддоочу гени бар өзүнчө полипептиддик чынжырдан турат.
Белок домени деген эмне?
Белок домени - бул белоктун полипептиддик чынжырынын чектеш аймагы, ал көп учурда өз алдынча компакт, жергиликтүү жана жарым көз карандысыз бирдиктерге бүктөлгөн. Белоктун домени ошондой эле белоктун полипептиддик чынжырынын өзүн-өзү турукташтыруучу жана калгандарынан көз карандысыз бүктөлүүчү аймагы катары белгилүү. Алар белоктун өзүнчө структуралык жана функционалдуу бирдиги. Адатта, домендер белгилүү бир функцияга же протеиндин жалпы ролуна салым кошкон өз ара аракеттенүүгө жооптуу. Мисалы, SH3 домени 50 аминокислота калдыктарынан турат. Алар белоктордун ар түрдүү диапазондорунда, анын ичинде адаптер белокторунда, фофатидилозит3-киназаларда, фосфолипазаларда жана миозиндерде кездешет. Бул SH3 домендери белок-белок өз ара аракеттенүүсүнө катышат.
02-сүрөт: Протеиндик домендер
Домендердин узундугу 50 аминокислотадан 250 аминокислотага чейин өзгөрөт. Цинк манжасы сыяктуу эң кыска домендер металл иондору жана дисульфиддик көпүрөлөр менен турукташтырылган. Домен көбүнчө калмодулиндин кальцийди байланыштырган EF-кол домени сыяктуу функционалдык бирдиктерди чыгарат. Андан тышкары, домендерди генетикалык инженерия аркылуу бир протеиндин ортосунда башка протеинге алмаштырса болот.
Белок суббирдиги менен домендин кандай окшоштуктары бар?
- Протеин суббирдиги жана домени мультимердик протеиндин структуралык бирдиктери.
- Экөө тең аминокислоталардан турат.
- Алар "полипептиддик чынжыр" термини менен байланышкан.
- Андан тышкары, экөө тең протеиндин жалпы иштеши үчүн өтө маанилүү.
Белок суббирдиги менен домендин ортосунда кандай айырма бар?
Белок суббирдиги – белок комплексин түзүү үчүн башка полипептиддик чынжырлар менен чогулган белоктун өзүнчө полипептиддик чынжырчасы. Башка жагынан алганда, протеин домени - бул белоктун полипептиддик чынжырынын чектеш аймагы, ал көп учурда өз алдынча компакт, жергиликтүү жана жарым көз карандысыз бирдиктерге бүктөлгөн. Ошентип, бул протеин суббирдиги менен домендин ортосундагы негизги айырма. Болгондо да, протеиндик суббирдиги белок доменинен чоңураак.
Төмөнкү таблица белок суббирдиги менен таблица түрүндө домендин ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача маалымат – Протеин суббирдигине каршы домен
Белоктордун курулуш материалы – аминокислоталар. Белоктор аминокислоталардын конденсацияланышынан пайда болот. Протеин структураларынын көлөмү ондогондон бир нече миң аминокислоталарга чейин өзгөрөт. Белоктун структурасы коваленттүү эмес өз ара аракеттешүү, мисалы, суутек байланыштары, иондук байланыштар, Ван-дер-Ваальс күчтөрү, гидрофобдук байланыштар жана дисульфиддик байланыштар сыяктуу коваленттик өз ара аракеттенүүлөр аркылуу турукташтырылган. Татаал протеин өзүнчө структуралык бирдиктерди камтыйт, мисалы суббирдиктер, домендер, мотив жана бүктөм. Белок суббирдиги – белок комплексин пайда кылуу үчүн башка полипептиддик чынжырлар менен чогулган белоктун өзүнчө полипептиддик чынжырчасы. Башка жагынан алганда, протеин домени белоктун полипептиддик чынжырынын өзүн-өзү стабилдештирүүчү жана калгандарынан көз карандысыз бүктөлүүчү аймагы болуп саналат. Ошентип, бул белок суббирдиги менен домендин ортосундагы айырманын корутундусу.
