ДНК менен протеин микроэлементинин ортосундагы негизги айырма - бул ДНК микроаррайы - бул айнек слайд сыяктуу катуу бетке жабышкан микроскопиялык ДНК тактарынын жыйындысы, ал эми белок микроаррейи - бул айнек сыяктуу катуу беттеги тазаланган протеиндердин тизилиши. слайд.
Microarray - чип (LOC) түзмөгүндөгү лаборатория. Бул миниатюралык, мультиплекстүү, параллелдүү иштетүү жана аныктоочу түзүлүш. Бул ошондой эле айнек слайд же кремний жука пленка клеткасы сыяктуу катуу беттеги эки өлчөмдүү массив. Микроаррей жогорку өтүмдүү скринингди колдонуу менен көп сандагы биологиялык материалды анализдейт. Биринчи микроаррей 1983-жылы Цэ Вен Чанг тарабынан киргизилген антитело чип болгон. Биринчи ген чип 1995-жылы Стэнфорд университетинде Рон Дэвис жана Пэт Браун тарабынан киргизилген. Демек, ДНК жана протеин микроаррейи микроаррей түзмөктөрүнүн эки түрү болуп саналат.
ДНК микроаррей деген эмне?
ДНК микроаррейи – бул айнек слайд сыяктуу катуу бетке жабышкан микроскопиялык ДНК тактарынын жыйындысы. Окумуштуулар бир эле учурда көп сандагы гендердин экспрессиясын өлчөө үчүн ДНК микроаррейин колдонушат. Ошондой эле геномдун бир нече аймактарын генотиптөө үчүн колдонулат. ДНК микроаррей роботтук машиналарды колдонуу менен даярдалат. Бул машиналар жүздөгөн же миңдеген ген ырааттуулугун (зонддорду) бир микроскопиялык слайдга жайгаштырышат.
01-сүрөт: ДНК микроаррей
ДНК микроэлементиндеги ар бир ДНК такы белгилүү ДНК ырааттуулугунун пикомолдорун (10−12 моль) камтыйт. Бул ДНК тизмектери зонддор же кабарчылар катары да белгилүү. Бул зонддор гендин же башка ДНК элементинин ДНКсынын кыска сегменти болуп саналат. Алар жогорку катаал шарттарда үлгүдөгү cDNA же CRNA менен гибриддештире алышат. Зонддор менен байланышкан флуоресценттик белгиленген үлгү тизмеги температура сыяктуу гибриддештирүү шарттарына көз каранды сигналдарды жаратат. Ошондуктан, бул ыкма үлгүдөгү нуклеиндик кислота тизмегинин салыштырмалуу көптүгүн аныктоо үчүн колдонулушу мүмкүн. Мындан тышкары, ДНК микроаррей ыкмасы ген экспрессиясын изилдөөдө, салыштырма геномдук изилдөөдө, тамак-аштын же клетка маданиятынын патогендер менен булганышын текшерүүдө, ген мутацияларын баалоодо, дары-дармекке талапкерлерди аныктоодо, генетикалык байланышты анализдөөдө ж.б. кеңири колдонулат.
Protein Microarray деген эмне?
Протеин микромасиви – бул айнек слайд сыяктуу катуу беттеги тазаланган протеиндердин тизилиши. Бул белоктордун өз ара аракеттенүүсүн жана активдүүлүгүн аныктоо үчүн колдонулган ыкма. Ал ошондой эле белоктордун функцияларын чоң масштабда аныктоо үчүн колдонулат. Протеин микроаррайынын негизги артыкчылыгы - көп сандагы протеиндерди параллелдүү байкоого болот. Протеин микроаррайы - бул айнек слайд, нитроцеллюлоза мембранасы, мончок же микротитр плитасы сыяктуу колдоо бетинен турган чип. Кармап алуу белоктору (антителолор, антигендер) бул катуу бетке байланат. Адатта флуоресценттик боёк менен белгиленген зонд молекулалары массивге кийинчерээк кошулат. Зонд менен иммобилизацияланган белоктордун ортосундагы гибриддештирүү лазердик сканер тарабынан аныктала турган флуоресценттик сигналды чыгарат.
02-сүрөт: Протеин микромасиви
Биринчи протеин массиви 1983-жылы киргизилген антителолордун микроматрицасы (антитело матрицасы). Протеин микроматрицтери тез, автоматташтырылган, өтө сезгич жана үнөмдүү. Алар ошондой эле үлгүлөрдү жана реагенттерди аз гана өлчөмдө керектешет. Мындан тышкары, протеиндик микроаррейлер ооруну аныктоодо, белоктун функционалдуу анализинде, антителолордун мүнөздөмөсүндө жана дарылоону иштеп чыгууда кеңири колдонулат.
ДНК менен протеин микроаррейинин кандай окшоштуктары бар?
- ДНК жана протеин микроаррейи микроаррей түзмөктөрүнүн эки түрү.
- Эки түзмөк тең гибриддештирүү принцибине негизделген.
- Эки түзмөк тең зонддорду пайдаланат.
- Алар гибриддештирүү үчүн флуоресценттик сигналдарды да колдонушат.
- Алар экөө тең медицинада ооруларды аныктоодо абдан пайдалуу.
ДНК менен протеин микроаррейинин ортосунда кандай айырма бар?
ДНК микроаррейи – бул айнек слайд сыяктуу катуу бетке жабышкан микроскопиялык ДНК тактарынын жыйындысы. Ал эми протеин микроаррейи - бул айнек слайд сыяктуу катуу беттеги тазаланган протеиндердин тизилиши. Ошентип, бул ДНК менен протеин микроаррайынын ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, ДНК микроаррайында үлгү жана зонд ДНК ырааттуулугу болуп саналат. Башка жагынан алганда, протеиндин микроаррайында үлгү жана зонд белоктор болуп саналат.
Төмөнкү инфографикада ДНК менен протеин микроэлементинин ортосундагы айырмачылыктар таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – ДНК протеиндик микроаррей
Микромассив – бул жогорку өткөрүү жөндөмдүүлүгү жана чиптеги мультиплекс лабораториясы. Ал гибриддештирүү принцибинин негизинде жасалган. ДНК жана протеин микроаррей микроаррей аппараттарынын эки түрү болуп саналат. ДНК микроаррайы – бул айнек слайд сыяктуу катуу бетке бекитилген микроскопиялык ДНК тактарынын жыйындысы. Башка жагынан алганда, протеин микроаррайы - бул айнек слайд сыяктуу катуу беттеги тазаланган протеиндердин тизилиши. Ошентип, бул ДНК менен протеин микроэлементинин ортосундагы айырманын корутундусу.
