Геномдук ДНК менен плазмиддик ДНКны изоляциялоонун негизги айырмасы геномдук ДНК изоляциясы геномдук ДНКны экстракциялоого багытталган, ал эми плазмиддик ДНК изоляциясы бактериялардын плазмиддик ДНКсын экстракциялоого багытталган.
ДНК изоляциясы – бул ар кандай түрлөрдөн же ар кандай үлгүлөрдөн ДНКны бөлүп алуу үчүн колдонулган химиялык процесс. ДНК изоляциясы гел электрофорези, полимераздык чынжыр реакциясы жана ДНК секвенирлөө ыкмалары сыяктуу молекулярдык биологиянын төмөнкү ыкмаларында маанилүү. Ошондуктан, ДНКны изоляциялоо молекулярдык биологиялык изилдөөлөрдөгү маанилүү химиялык процесс болуп саналат. Изилдөөнүн максатынын негизинде кээде геномдук ДНКны бөлүп алуу зарыл. Мындан тышкары, кээ бир изилдөөлөр бактериялардан плазмиддик ДНКны бөлүп алууга багытталган. Геномдук ДНК изоляциясы - прокариоттук же эукариоттук үлгүдөн геномдук ДНКны бөлүп алуу процесси. Изоляция этаптары ДНК обочолонуп жаткан клетканын түрүнө жараша айырмаланат. Плазмиддик ДНКны изоляциялоо – бул бактериялык клеткадан плазмиддик ДНКны бөлүп алуу процесси. ДНКнын геномдук изоляциясына салыштырмалуу плазмиддик ДНКны изоляциялоодо жалпы процесс татаал.
Геномдук ДНК изоляциясы деген эмне?
Геномдук ДНКны изоляциялоо – бул организмдин бүт геномдук ДНКсын алуу процесси. Бул өзгөчө процесс үч негизги окуяны камтыйт. Алар, клетка лизиси же ядролук лизиси, белоктун бузулушу же протеолиз жана геномдук ДНКнын преципитациясы. Лизис кадамы клетканын түрүнө жараша ар кандай болушу мүмкүн. Прокариоттордо пептидогликан клетка дубалы бар болгондуктан, биринчи кадам клетка дубалынын бузулушу болушу керек. Башка жагынан алганда, эукариоттордо лизис кадамы ДНКны сыртка чыгаруу үчүн плазмалык мембрананын жана ядролук мембрананын бузулушун камтыйт. Ал эми өсүмдүктүн жана козу карындын клеткасынын дубалдарын лиздөө үчүн атайын кадамдарды жасоо зарыл.
01-сүрөт: Геномдук ДНК изоляциясы
Демек, лизис баскычы аяктагандан кийин, акыры ДНК супернатантка келет. Ошол эле учурда протеиназанын К кошулушунан улам эритмеде белоктун бузулушу да ишке ашат. Кийинки кадам геномдук ДНКны жана бузулган белокторду бири-биринен бөлүп алуу болуп саналат. Демек, бузулган белоктор геномдук ДНКнын супернатантта калышына жол ачат. Белоктордун преципитациясынан кийин геномдук ДНКны преципитациялоого жана эксперимент үчүн талап кылынмайынча ылайыктуу буферге кайра суспензиялоого болот.
Геномдук ДНК, бул сызыктуу ДНК организмдин бардык генетикалык маалыматын камтыйт. Башка сөз менен айтканда, геном клетканын бардык структуралык жана функционалдык иш-аракеттери үчүн жооптуу тирүү организмдин тукум куучулук материал болуп саналат. Ал коддоочу жана коддолбогон ДНК тизмегинен турат. Геномдук ДНКны бөлүп алууда ал организмдин бүт геномун камтыйт.
Пласмиддик ДНК изоляциясы деген эмне?
Плазмиддик ДНКны изоляциялоо – бул ДНКны изоляциялоонун өзгөчө жана татаал процесси. Плазмиддер - көпчүлүк бактериялык клеткаларда бар экстрахромосомалык ДНК. Алар катаал экологиялык шарттарда бактериялардын аман калышын колдогон уктоочу тегерек ДНК. Плазмиддик ДНК бактерияларга антибиотиктерге туруктуулук, вируленттүүлүк жана уулуу касиеттер сыяктуу кошумча артыкчылыктарды камсыз кылган атайын туруктуу гендерден турат.
02-сүрөт: Плазмиддик ДНК изоляциясы
Пласмиддик ДНК изоляциясы да үч негизги процессти камтыйт; клетка лизиси, протеинолиз жана ДНКнын преципитациясы. Изоляциянын биохимиялык механизми геномдук ДНК изоляциясына окшош болсо да, процесс ага караганда татаалыраак. Клетка лизис процесси бул процедурадагы эң маанилүү процесс. Эң негизгиси, геномдук ДНК жана плазмиддик ДНК бири-бири менен аралашпашы керек. Демек, бир кыйла жумшак лизис процесси плазмиддик ДНКны изоляциялоо процедурасына кирет. Демек, көпчүлүк плазмиддик ДНК изоляция жол-жоболорунда жуугуч каражатты колдонушат; клетка лизиси үчүн натрий додецил сульфаты.
Геномдук ДНК менен плазмиддик ДНК изоляциясынын кандай окшоштуктары бар?
- Геномдук ДНК жана Плазмиддик ДНК изоляциясы организмдин ДНКсын экстракциялоого багытталган.
- Ошондой эле экөө тең бирдей жалпы процессти аткарышат, анын ичинде клетка лизиси, белоктун деградациясы жана ДНКнын преципитациясы.
- Андан тышкары, эки процесстин тең ДНКсы төмөнкү процесстер үчүн маанилүү.
- Мындан тышкары, эки изоляция процесси ДНКны белгилүү сактоо шарттарында тазалоо жана сактоо кадамдарын камтыйт.
- Мындан тышкары, протеиназа К протеиндерди деградациялоо үчүн эки ыкмада тең колдонулат.
Геномдук ДНК менен плазмиддик ДНК изоляциясынын ортосунда кандай айырма бар?
Геномдук ДНК изоляциясы максаттуу организмдин бүт геномдук ДНКсын бөлүп алууга багытталган, ал эми плазмиддик ДНК изоляциясы белгилүү бир бактерия түрлөрүнөн плазмиддик ДНКны гана бөлүп алууга багытталган. Ошондуктан, бул геномдук ДНК менен плазмиддик ДНК изоляциясынын ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, геномдук ДНК менен плазмиддик ДНК изоляциясынын дагы бир айырмасы процедурада. Геномдук ДНК изоляциясы плазмиддик ДНК изоляциясына салыштырмалуу азыраак татаал процедура. Демек, плазмиддик ДНКны изоляциялоодо геномдук жана плазмиддик ДНКнын бири-бири менен аралашуусуна жол бербөө үчүн чараларды көрүү зарыл.
Төмөнкү инфограохикада геномдук ДНК менен плазмиддик ДНКнын изоляциясынын ортосундагы айырмачылык жөнүндө кошумча маалымат берилген.
Кыскача – Геномдук ДНКга каршы Плазмиддик ДНК изоляциясы
ДНК изоляциясы молекулярдык биология техникасындагы маанилүү процесс. ДНКнын эки түрү бар, атап айтканда геномдук ДНК жана плазмиддик ДНК (экстра-хромосомалык ДНК). Талаптын негизинде, кээ бир процедуралар геномдук ДНКны изоляциялоо үчүн жүргүзүлөт, ал эми кээ бир процедуралар бактериялардан плазмиддик ДНКны гана бөлүп алууга багытталган. Демек, эки процесске катышкан кадамдар бири-биринен бир аз айырмаланат. Бирок, жалпы процесс эки изоляцияда бирдей. Эки процесстин обочолонгон ДНКсы клондоштуруу, гель электрофорези жана полимераздык чынжыр реакциялары сыяктуу төмөнкү процесстерде кеңири колдонулат. Геномдук ДНКны изоляциялоо протоколунун аягында организмдин бүт геномдук ДНКсын акыркы продукт катары бөлүп алууга болот, ал эми плазмиддик ДНКны изоляциялоо протоколунун аягында тиешелүү бактериянын плазмиддик ДНКсын акыркы продукт катары бөлүп алууга болот. Демек, бул геномдук ДНК менен плазмиддик ДНК изоляциясынын ортосундагы айырма.
