Пептид vs Протеин
Аминокислоталар, пептиддер жана протеиндер көбүнчө окшош терминдер деп аталат, бирок алар өзгөчөлүктөрү боюнча айырмаланат. Аминокислоталар пептиддердин жана протеиндердин курулуш материалы болуп саналат. Аминокислота – бул борбордук көмүртек атому менен байланышкан, кошумча суутек жана каптал чынжыр (R-топ). Бул каптал чынжыр бардык аминокислоталар арасында өзгөрөт; демек, ал ар бир аминокислотанын уникалдуу белгилерин жана химиясын аныктайт. Белгилүү ген тизмеги пептиддерде жана белоктордо аминокислота ырааттуулугун аныктоо үчүн колдонулат.
Пептид
Пептиддер пептиддик байланыштар менен байланышкан эки же андан көп аминокислоталардан турат жана сызыктуу чынжырлар түрүндө болот. Пептиддин узундугу андагы аминокислоталардын саны менен аныкталат. Адатта пептиддин узундугу болжол менен 100 аминокислотадан аз болот.
Префикстер жалпы терминологияда пептиддердин түрүн сүрөттөө үчүн колдонулат. Мисалы, пептид эки аминокислотадан жасалганда, ал дипептид деп аталат. Ушул сыяктуу үч аминокислота биригип трипептиддерди, төрт аминокислота биригип тетрапептиддерди, ж. 100дөн ашык). Пептиддердин эң маанилүү мүнөздөмөлөрү аминокислоталардын саны жана ырааттуулугу менен аныкталат.
Көпчүлүк пептиддердин негизги милдети – биохимиялык билдирүүлөрдү организмдеги бир жерден экинчи жерге жеткирүү менен эффективдүү байланышты камсыз кылуу.
Белок
Белоктар биологиялык макромолекулалардын эң ар түрдүү тобу болуп саналат. Белок полипептиддер деп аталган бир же бир нече узун бутаксыз чынжырлардан турат, бирок белоктордун курулуш материалы аминокислоталар болуп саналат. Амино-кислоталардын ырааттуулугу белоктун негизги мүнөздөмөлөрүн аныктайт, ал эми бул аминокислота ырааттуулугу белгилүү бир ген ырааттуулугу менен аныкталат.
Адатта белоктор туруктуу үч өлчөмдүү түзүлүшкө ээ. Бул түзүмдөрдү төрт деңгээлдеги иерархия боюнча талкуулоого болот; баштапкы, орто, үчүнчү жана төртүнчү. Негизги түзүлүш - бул белоктун аминокислота тизмеги. Экинчилик структура жакын жердеги эки аминокислотанын ортосунда суутек байланыштарын түзүү аркылуу өндүрүлөт, натыйжада β-капталган барактар деп аталган структуралар жана α-спиралдары деп аталат. Экинчи структуранын аймактары протеиндин акыркы үч өлчөмдүү түзүлүштөрүн түзүү үчүн мейкиндикте андан ары бүктөлөт. Көптөгөн полипептиддердин мейкиндикте жайгашуусу белоктун төртүнчү түзүлүшүн пайда кылат.
Белоктордун негизги функциялары – ферменттик катализ, коргонуу, ташуу, колдоо, кыймыл, жөнгө салуу жана сактоо.
Пептид менен протеиндин ортосунда кандай айырма бар?
• Пептиддер аминокислоталардын кыска сызыктуу чынжырлары, ал эми белоктор аминокислоталардын өтө узун чынжырлары.
• Бир нече аминокислота пептиддик байланыш аркылуу пептидди түзүү үчүн бири-бирине туташат, ал эми бир нече пептиддер протеин молекулаларын түзүү үчүн бири-бирине байланышкан.
• Адатта, белоктор туруктуу үч өлчөмдүү түзүлүшкө ээ. Ал эми пептиддер туруктуу үч өлчөмдүү түзүлүштө уюшулган эмес.
• Пептиддин узундугу болжол менен 100 аминокислотадан аз, ал эми белок 100 аминокислотадан ашат. (Өзгөчө учурлар бар; Ошентип, айырмачылыктар алардын өлчөмүнө эмес, молекулалардын функциясына көбүрөөк көз каранды)
• Пептиддерден айырмаланып, белоктор макромолекулалар катары каралат.
• Пептиддерде аминокислоталардын каптал чынжырлары гана суутек байланыштарын түзөт. Ал эми белоктордо каптал чынжырлар гана эмес, пептиддик топтор да суутек байланыштарын түзүшөт. Бул суутек байланыштары суу менен же башка пептиддик топтор менен болушу мүмкүн.
• Бардык пептиддер сызыктуу чынжырлар түрүндө болот, ал эми белоктор биринчилик, экинчилик, үчүнчү жана төртүнчүлүк катары болушу мүмкүн.
