Фермент протеин
Протеиндер жана ферменттер сызыктуу чынжырчалар менен байланышкан көптөгөн аминокислоталардан турган биологиялык макромолекулалар. Амин кислотасы бул макромолекулалардын негизги структуралык жана функциялык бирдиги болуп саналат. Бир аминокислота молекуласы төрт негизги топтон турат; атап айтканда, борбордук көмүртек атому менен байланышкан амин тобу, каптал чынжыр (R- топ), карбоксил тобу жана суутек атому. Негизинен табигый түрдө пайда болгон жыйырма аминокислота бар жана алар каптал чынжыр (R-тобу) менен гана айырмаланат. Аминокислоталардын тартиби белок менен ферменттердин түзүлүшүн жана функцияларын аныктайт.
Ферменттер
Ферменттер организмдердеги химиялык реакцияларды катализдөө жана жөнгө салуу үчүн биологиялык молекулалардын ролун аткара алган атайын үч өлчөмдүү глобулярдык белоктор. Бир клеткада миңдеген түрдүү ферменттер бар. Себеби клеткадагы дээрлик ар бир реакция өзүнө тиешелүү ферментти талап кылат. Адатта ферменттер клеткадагы реакцияларды катализдебеген реакцияларга караганда миллион эсе тезирээк ишке ашырышат. Ферменттин бетиндеги активдүү жерлер алардын өзгөчөлүгүн аныктайт. Ферменттердин өзгөчөлүгүнүн түрлөрүнө абсолюттук өзгөчөлүк, стереохимиялык өзгөчөлүк, топтук өзгөчөлүк жана байланыш өзгөчөлүгү кирет. Активдүү участоктор - үчүнчү даражадагы түзүлүштүн пайда болушунан улам фермент бетиндеги жаракалар же көңдөйлөр. Кээ бир активдүү сайттар бир гана белгилүү бир кошулманы байланыштырат, ал эми башкалары бири-бири менен тыгыз байланышта болот. Ферменттер катализдеген реакцияга эч кандай таасир этпейт. Ферменттин активдүүлүгүнө төрт фактор таасир этет, атап айтканда; температура, рН, субстрат концентрациясы жана фермент концентрациясы.
Белоктар
Белоктар функционалдуу жана структуралык жактан эң ар түрдүү биологиялык макромолекулалар. Алар аминокислоталардын полимерлери. Аминокислоталардын ырааттуулугу алардын негизги түзүлүшүн жана функциясын аныктайт. Белоктордун негизги функциялары - ферменттик катализ, коргонуу, ташуу, колдоо, кыймыл, жөнгө салуу жана сактоо. Белоктордун түзүлүшү төрт деңгээлдеги иерархия менен туюнтса болот; баштапкы, орто, үчүнчү жана төртүнчү. Амино-кислота ырааттуулугу белоктун негизги түзүлүшү болуп саналат. Экинчилик структуранын пайда болушу пептиддик омурткадагы топтордун суутек байланыштарынын пайда болушу менен үзгүлтүксүз өз ара аракеттенүүсү менен шартталган. Бул эки түрдүү түзүлүштү пайда кылат, атап айтканда; бета (β) – бүктөлгөн барактар, ал эми альфа (α) – спиральдар же катушкалар. Белок молекуласынын бүктөлүшү жана шилтемелери акыры анын үчүнчү даражалуу түзүлүш деп аталган 3-D формасын түзөт. Бир нече полипептиддери бар белоктор төртүнчү түзүлүштү пайда кылат.
Фермент менен протеиндин ортосунда кандай айырма бар?
• Бардык ферменттер глобулярдык белоктор, бирок бардык белоктор глобулярдуу эмес. Кээ бир белоктор шар формасында болсо, кээ бирлери андай эмес (булалуу бөлүктөрү узун ичке түзүлүшкө ээ).
• Башка белоктордон айырмаланып, ферменттер биологиялык реакцияларды катализдөө жана жөнгө салуу үчүн катализатор катары иштей алат.
• Ферменттер функционалдык белоктор, ал эми белоктор функционалдык же структуралык болушу мүмкүн.
• Башка белоктордон айырмаланып, ферменттер өтө субстраттык өзгөчө молекулалар.
• Протеиндер ферменттер (протеазалар) тарабынан сиңирилип же ыдытылат.