shRNA vs siRNA
РНК интерференциясы (RNAi) процессинде максаттуу гендин экспрессиясы жогорку өзгөчөлүк жана тандалмачылык менен талкаланат. RNAi табигый процесс жана ал кичинекей интерференциялуу РНКны (siRNA) жана кыска чачтуу РНКны (shRNA) жана би-функционалдык shRNA'ны камтыйт. Азыркы учурда, RNAi жекелештирилген рак терапиясы үчүн курал катары кеңири колдонулат. RNAi тиркемелери негизинен химиялык синтезделген кош тилкелүү siRNA жана вектордук shRNA молекулалары менен жасалат. Бул эки молекуланын иш натыйжалары окшош болгону менен, түзүлүшү жагынан айырмаланат; Ошентип, бул эки молекуланын аракетинин молекулярдык механизмдери, РНК жолдору жана максаттан тышкаркы таасирлери да айырмаланат.
shRNA
shRNA – бул RNAi учурунда максаттуу ген экспрессиясын басуу үчүн колдонула турган катуу чач кычкасын жасаган кичинекей РНК молекуласынын ырааттуулугу. ШРНКнын экспрессиясына вирус же бактерия болушу мүмкүн болгон вектор же плазмидаларды жеткирүү аркылуу ишке ашат. Алар клеткалардын ядросунда синтезделет жана андан аркы процесстер үчүн цитоплазмага ташылат. Бул молекулалар миРНКнын окшош жетилүү жолдоруна ээ; Ошентип, miRNA синтези shRNA синтезин түшүнүү үчүн негиз түздү. РНК полимераза II же III РНК полимераза II же III промоторлору аркылуу shRNAны транскрипциялай алат. shRNAларды колдонуунун артыкчылыгы алардын деградациясынын жана жүгүртүүнүн салыштырмалуу төмөн көрсөткүчүнө ээ. Кемчилиги - ага экспрессия вектору керек, ал кээ бир коопсуздук маселелерин жаратышы мүмкүн.
siRNA
siRNA'лар узундугу 20-25 жуп базалык жуптан турган кош тизмектүү РНК молекулалары. Булар RNAi жолунда комплементарлык нуклеотид ырааттуулугу менен кандайдыр бир гендин үнүн басуу аркылуу генди басуу үчүн колдонулат. СиРНКны трансфекциялоо аркылуу генди нокаунт кылуу убактылуу эффектке байланыштуу көп учурда ийгиликсиз болот; өзгөчө тез бөлүнүүчү клеткаларда жана басуу узакка созулбайт. Бул маселени чечүү үчүн, siRNA кыска чач түзүмүн киргизүү жолу менен өзгөртүлгөн. Бул өзгөртүлгөн молекула кийин shRNA деп аталат. shRNA кадимки ишин улантуу үчүн Dicer тарабынан siRNAга айландырылышы керек.
shRNA менен siRNAнын ортосунда кандай айырма бар?
• siRNAдан айырмаланып, shRNA кошумча чачтуу түзүлүшкө ээ. shRNA - siRNAнын өзгөртүлгөн версиясы.
• shRNA экспрессия векторун талап кылат, ал эми siRNA талап кылбайт.
• shRNA узак мөөнөттүү нокдаун үчүн, ал эми siRNA гендердин кыска мөөнөттүү нокаунту үчүн гана колдонулушу мүмкүн.
• siRNAнын гендин басылышынан айырмаланып, shRNAнын басылышы узакка созулат жана эгер ал тийиштүү вирустук вектор аркылуу киргизилсе, ал туруктуу генди басуу эффекттерин жаратышы мүмкүн.
• Дисер кадимки функцияларын аткаруу үчүн shRNAны кайра siRNA молекуласына айландыруу үчүн талап кылынат.
