FISH менен CGH ортосундагы негизги айырма - FISH флуоресценттик белги коюлган зонддордун жардамы менен хромосомадагы белгилүү ДНК ырааттуулугун аныктаган молекулярдык техника, ал эми CGH геномдук ДНКдагы өзгөрүүлөрдү аныктаган дагы бир молекулярдык цитогенетикалык ыкма.
Цитогенетикалык анализ медицинада аневлоидиялар, делециялар, дубликациялар жана кайра түзүлүштөр сыяктуу хромосомалык аномалияларды аныктоодо маанилүү роль ойнойт. Хромосомалык аномалиялар акыры рак, тукумсуздук, Даун синдрому, Клайнфельнер синдрому сыяктуу генетикалык ооруларга алып келет. синдром, лейкоз ж.б. жогоруда айтылган кемчиликтерди жана ооруларды аныктоо үчүн ар кандай молекулярдык цитогенетикалык методдор бар. Алардын ичинен FISH (fluorescent in situ гибриддештирүү) жана CGH (салыштырмалуу геномдук гибриддештирүү) эки күчтүү гибриддештирүү ыкмалары болуп саналат. Бирок, эки ыкманын тең жакшы жана жаман жактары бар.
БАЛЫК деген эмне?
FISH – бул нуклеиндик кислотаны гибриддештирүү ыкмасы ткандын бир бөлүгүндө же бөлүмүндө, бүт кыртышта же клеткаларда аткарылат. Бул изилдөөгө негизделген ыкма. Техника Уотсон Криктин толуктоочу база жупташтыруу теориясына көз каранды, натыйжада ДНК – ДНК гибриддери же ДНК – РНК гибриддери пайда болот, алар мутацияланган гендерди аныктай алат же кызыккан генди аныктай алат. Андан ары, бул ыкма кызыккан ген ырааттуулугун толуктоочу зонддор катары ник котормосун колдонуу менен даярдалган бир тизмектүү ДНК ырааттуулугун, эки саптуу ДНК ырааттуулугун, бир саптуу РНК ырааттуулугун же синтетикалык олигонуклеотидди колдонот. Мындан тышкары, бул техниканын эң маанилүү өзгөчөлүгү - пробдорду флуоресценттик боёктор менен белгилөө. Ошентип, зонддор хромосоманын кошумча бөлүктөрү менен байланышып, аны аныктоону жеңилдетет.
Андан тышкары, FISH өтө сезимтал жана өзгөчө ыкма. Демек, бул гематологиялык залалдуу жана катуу шишиктерди изилдөөдө жана диагностикалоодо кеңири таралган ыкма. Бирок, FISH төмөн токтомду көрсөтөт. Ал ошондой эле зонд ырааттуулугун иштеп чыгуу үчүн максаттуу аномалияны алдын ала билүүнү талап кылат.
01-сүрөт: БАЛЫК
БАЛЫКтын көптөгөн колдонмолору бар, негизинен жугуштуу оорулардын молекулярдык диагностикасында козгогучтардын бар экендигин аныктоо жана молекулярдык диагностика аркылуу козгогучту тастыктоо. Мындан тышкары, FISH өнүгүү биологиясы, кариотиптөө жана филогенетикалык анализ жана хромосомалардын физикалык картасын түзүү тармактарында кеңири колдонулган ыкма.
CGH деген эмне?
Салыштырмалуу геномдук гибриддештирүү (CGH) геномдук ДНК тизмегинин өзгөрүшүн аныктай ала турган ДНКга негизделген дагы бир молекулярдык цитогенетикалык ыкма. Метод геномдук ДНК тизмегиндеги өзгөрүүлөрдү же өзгөрүүлөрдү аныктоо үчүн хромосомаларды жана ген модификацияларын талдай ала турган өнүккөн ыкма. Андан ары, CGH эксперименталдык үлгүдөн жана маалымдама үлгүсүнөн ДНКны бөлүп алууну жана фрагментациялоону талап кылат. Андан кийин, үлгүлөр эки түрдүү флуоресценттик боёкторду (көбүнчө кызыл жана жашыл) колдонуу менен белгилениши керек. Кийинчерээк эки үлгү тең аралаштырылып, атаандаштыкка жөндөмдүү гибриддештирүүгө уруксат берилет. Акыркы кадам - гендин копияланышы, гендин жоголушу ж.б. сыяктуу ДНКдагы өзгөрүүлөрдүн анализи. Айрыкча, ал тест үлгүсү менен контролдук үлгүнүн ортосундагы ДНК көчүрмөсүнүн санынын айырмасын өлчөйт.
02-сүрөт: CGH
CGHдин башка версиясы азыр жеткиликтүү; бул кадимки CGH караганда алда канча өнүккөн ыкма болуп саналат. Бул массивге негизделген CGH же aCGH деп аталган техника. aCGH бир экспериментте генди же ырааттуулукту жок кылууну миңдеген ырааттуулукта так аныктоого мүмкүндүк берет.
FISH жана CGH ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- FISH жана CGH эки молекулярдык ыкма.
- FISH жана CGH экөө тең нуклеиндик кислотанын гибриддешүүсүнө таянышат.
- Ошондой эле эки техника тең белгилүү ДНК буталарды аныктоо үчүн иштелип чыккан зонддорду талап кылат.
- Биз аларды генетикалык оорулардын төрөткө чейинки жана төрөттөн кийинки диагностикасы үчүн колдонобуз.
- Андан тышкары, FISH жана CGH экөө тең геномдук өзгөрүүлөрдү изилдөө үчүн абдан күчтүү куралдар.
- Алар зонддорду белгилөө үчүн флуоресценттик боёкторду колдонушат.
FISH жана CGH ортосунда кандай айырма бар?
FISH - бул белгилүү ДНК ырааттуулугун аныктоо үчүн флуоресценттүү зонддорду колдонгон in situ гибриддөө процедурасы, ал эми CGH - геномдук ДНК тизмегинин өзгөрүшүн аныктаган молекулалык гибриддештирүү ыкмасы. Демек, бул FISH менен CGH ортосундагы негизги айырма.
Мындан тышкары, FISH зонд ырааттуулугун иштеп чыгуу үчүн максаттуу аномалияны алдын ала билүүнү талап кылат, ал эми CGH алдын ала билимди талап кылбайт. Ошондой эле, FISH менен CGH ортосундагы дагы бир айырмачылык, FISH чектелген чечмедүүлүктү көрсөтөт, ал эми aCGH жогорку чечмелдиктерди көрсөтөт.
Төмөнкү инфографика FISH менен CGH ортосундагы айырманы жалпылайт.
Корытынды – FISH vs CGH
FISH жана CGH эки молекулярдык цитогенетикалык ыкмалар, алар кызыккан ген тизмегин аныктоого жардам берет. FISH флуоресценттик белгиленген зонддорду колдонуу менен хромосомадагы белгилүү ДНК ырааттуулугун аныктоого жардам берет, ал эми CGH геномдук ДНКдагы өзгөрүүлөрдү аныктоого көмөктөшөт. Демек, бул FISH менен CGH ортосундагы негизги айырма.
