Негизги айырмасы – Негизги экзизияны оңдоо менен нуклеотиддик эксцизиялык оңдоо
ДНК ар кандай ички жана тышкы факторлордон улам көп бузулууга дуушар болот. Бирок клетканы оңдоочу системалар бузулууларды мутацияга айлана электе же кийинки муундарга өтө электе дароо жана тынымсыз оңдоп турушат. Клеткаларда эксцизиялык оңдоо системаларынын үч түрү бар: нуклеотиддик эксцизиялык оңдоо (NER), базалык эксцизиялык оңдоо (BER) жана ДНКнын дал келбестигин оңдоо (MMR). Негизги эксциздик оңдоо менен нуклеотиддерди эксциздик оңдоонун ортосундагы негизги айырма - бул базалык кесүү оңдоо - бул клеткаларда эндогендик жол менен келип чыккан бир нуклеотиддик зыянды оңдоо үчүн иштеген жөнөкөй оңдоо тутуму, ал эми нуклеотиддерди эксциздик оңдоо - бул клеткаларда салыштырмалуу оңдоо үчүн иштеген татаал оңдоо системасы. ири, бузулган аймактар экзогендик себеп.
Базалык эксцизиялык оңдоо деген эмне?
Базалык кесүү оңдоо клеткалардагы ДНКны оңдоо системасынын эң жөнөкөй версиясы. Ал ДНКдагы майда зыяндарды оңдоо үчүн колдонулат. ДНК негиздери дезаминденүү же алкилдөөдөн улам өзгөртүлөт. Негизги бузулуулар болгондо, ДНК гликозилаза базалык эксциздик оңдоо системасын таанып, иштетет жана AP эндонуклеаза, ДНК полимераза жана ДНК лигаза ферменттеринин жардамы менен аны калыбына келтирет. BER тутумунда төмөнкү кадамдар аткарылат.
- Абаздик аймакты түзүү үчүн туура эмес же бузулган базаны ДНК гликозилазасы тарабынан таануу жана алып салуу (базаны жоготуу жерлери – апиурикалык же апиримидиндик участоктор).
- Апуриндик/апиримидиндик эндонуклеаза менен абазикалык жерди кесүү
- Калган кант фрагментин лиаза же фосфодиэстераза менен алып салуу
- ДНК-полимераза менен боштуктарды толтуруу
- Никтин ДНК лигазасы менен жабылышы
01-сүрөт: Негизги экзизияны оңдоо жолу
Нуклеотиддик экзизияны оңдоо деген эмне?
Нуклеотиддик экзизияны оңдоо (NER) клеткалардагы ДНКнын экзизиясын оңдоонун маанилүү системасы. Ал узундугу 30 базага чейин бузулган аймактарды оңдоого жана алмаштырууга жөндөмдүү жана бузулбаган шаблон жип менен багытталат. Жалпы ДНК бузулушу ультра кызгылт көк нурлануунун натыйжасында пайда болот жана NER мутацияга айланып, келечек муунга өтүп же ооруларды пайда кылганга чейин дароо калыбына келтирип, ДНКны коргойт. NER өзгөчө экологиялык жана химиялык канцерогендер сыяктуу экзогендик факторлордон кыйыр түрдө пайда болгон мутациялардан коргоону камсыз кылат. NER дээрлик бардык организмдерде кездешет жана ал ДНК спиралында олуттуу бурмалоого алып келген зыяндарды тааныйт.
NER процесси XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB ж.б. сыяктуу көптөгөн протеиндердин аракетин камтыйт жана бир нече кесүү жана паста сыяктуу механизмдер аркылуу жүрөт. Бул протеиндер оңдоо процессин аяктоо үчүн абдан маанилүү жана NER белокторунун биринин кемчилиги өтө маанилүү жана сейрек кездешүүчү рецессивдүү синдромдорду: пигмент ксеродерма (XP), Кокайн синдрому (CS) жана морт чачтын фотосезгич түрүн пайда кылышы мүмкүн. трихотиодистрофия (ТТД).
02-сүрөт: Нуклеотиддик эксциздик оңдоо
Базаны алып салуу оңдоосу менен нуклеотиддик эксциздик оңдоонун ортосунда кандай айырма бар?
Базалык эксцизияны оңдоо жана нуклеотиддерди алып салууну оңдоо |
|
| Базалык эксцизиялык оңдоо (BER) бул клеткаларда пайда болгон ДНКны оңдоо системасы. | Нуклеотиддерди кесүү оңдоо (NER) – клеткаларда табылган ДНКны оңдоо системасынын дагы бир түрү. |
| ДНК кошулмаларын таануу | |
| BER кичинекей ДНК кошулмаларынын бузулушун калыбына келтирет. | NER чоң ДНК кошулмаларын оңдойт. |
| ДНК зыяндары | |
| BER ДНК спиралын олуттуу бурмалоого алып келбеген зыяндарды тааныйт. | NER ДНК спиралын олуттуу бурмалоого алып келген зыяндарды тааныйт. |
| ДНКнын бузулушунун себептери | |
| BER эндогендик мутагендер келтирген зыяндарды оңдойт. | NER экзогендик мутагендер келтирген зыяндарды оңдойт. |
| Татаалдуулук | |
| BER эң татаал оңдоо системасы | Бул BERге караганда татаалыраак. |
| Белоктарга муктаждык | |
| BER башка белокторду талап кылбайт. | NER бир нече ген продуктыларын, айрыкча белокторду, бузулган жана бузулбаган аймактарды ажыратууну талап кылат. |
| Жарык | |
| BER жалгыз базалык зыяндарды оңдоого ылайыктуу. | NER бузулган аймактарды алмаштырууга ылайыктуу. |
Кыскача маалымат – Негизги эксцизиялык оңдоо жана нуклеотиддик эксцизиялык оңдоо
NER жана BER - клеткаларда табылган ДНКны эксциздик оңдоо процесстеринин эки түрү. BER эндогендик жол менен келтирилген кичинекей зыяндарды калыбына келтире алат, ал эми NER көбүнчө экзогендик жол менен пайда болгон 30 базалык жуп узундугуна чейинки зыяндуу аймактарды оңдой алат. BER NERден таанылган субстраттардын түрлөрү боюнча жана алгачкы бөлүнүү окуясы боюнча айырмаланат. BER ошондой эле ДНК спиралындагы олуттуу бурмалоолор менен шартталбаган зыяндарды тааный алат, ал эми NER ДНК спиралынын олуттуу бурмалоолорун тааныйт. Бул нуклеотиддерди алып салуу менен базанын кесилишинин ортосундагы айырма.
