Протеомика менен метаболомиканын негизги айырмасы протеомика организмдин бардык белокторун изилдөө, ал эми метаболомика организмдин бардык метаболиттерин изилдөө болуп саналат.
Геномика – организмдин генетикалык түзүлүшүн изилдөө. Протеомика жана метаболомика геномика менен байланышкан эки омикалык илим. Протеом клеткадагы же организмдеги бардык белокторду билдирет. Метаболома, экинчи жагынан, организмдин бардык метаболиттерин билдирет. Ошентип, протеомду изилдөө протеомика, ал эми метаболоманы изилдөө метаболомика. Протеомика жана метаболомика экөө тең ооруну диагностикалоодо жана организмдердин мүнөздөмөсүндө жана скринингинде маанилүү. Мындан тышкары, экөө тең клетка биологиясынын көптөгөн аспектилери менен байланышкан, өзгөчө клетка сигнализациясында, белоктун бузулушунда жана генерациясында жана трансляциядан кийинки модификацияда.
Протеомика деген эмне?
Протеом – бул клеткадагы, ткандагы же организмдеги жалпы белок толуктоосу. Демек, протеомика организмдин протеомасын изилдөө болуп саналат. Протеомикада белоктордун ар кандай мүнөздөмөлөрү талданат. Ошондуктан, протеомика негизинен белоктордун түзүлүшү, багыты, функциялары, протеиндердин өз ара аракеттешүүсү, модификациялары, колдонулушу жана маанисине басым жасайт. Ошондуктан учурда протеомика жаатында көптөгөн изилдөө долбоорлору жүргүзүлүүдө.
Биринчи протеомикалык изилдөөлөр ичеги таякчасындагы белоктун мазмунун аныктоо үчүн жасалган. Жалпы белоктун мазмунун карта эки өлчөмдүү (2D) гелдерди колдонуу менен жасалган. Бул долбоордун ийгилигинен кийин, илимпоздор гвинея чочколору жана чычкандар сыяктуу жаныбарлардын жалпы белоктун мазмунун мүнөздөөгө өтүштү. Учурда адам протеининин картасы 2D гелдик электрофорездин жардамы менен жасалууда.
Протеомиканы изилдөөнүн көптөгөн артыкчылыктары бар, анткени белоктор белоктордун катализатордук касиетинен улам көпчүлүк активдүүлүктүн башкаруучу молекулалары болуп саналат. Ошентип, бүт белокторду изилдөө организмдин ден соолук абалы жөнүндө маалымат бере алат. Мындан тышкары, протеомиканын геномду аннотациялоодо, ооруларды аныктоодо жана диагностикада, эксперимент учурунда белоктун экспрессиясын изилдөөдө жана протеинди модификациялоодо жана өз ара аракеттенүүнү изилдөөдө ж.б. көптөгөн колдонмолор бар.
01-сүрөт: Протеомика
Протеомикада ар кандай ыкмалар бар, анын ичинде жалпы протеинди экстракциялоо, аларды 2D гелдик электрофорез аркылуу бөлүү, Эдмунддун секвенирлөө ыкмасы же масс-спектрометрия сыяктуу ыкмаларды колдонуу менен алынган протеиндерди секвенирлөө жана структуралык жана функционалдык анализ компьютердик программалык камсыздоону жана биоинформатика куралдарын колдонуу менен белоктун касиеттери.
Метаболомика деген эмне?
Метаболомика – бул клеткадагы, ткандагы же организмдеги бардык метаболиттерди изилдөө. Бул ар кандай өркүндөтүлгөн аналитикалык жана статистикалык куралдарды колдонуу менен уюлдук метаболиттерди аныктоону жана санын аныктоону камтыйт. Метаболомика маанилүү изилдөө, анткени ал организмдин метаболизмине байланыштуу маалыматты ачып берет.
02-сүрөт: Метаболомика
Субстраттарды жана зат алмашуу реакцияларынын продуктуларын изилдөө үчүн метаболомика аналитикалык платформа катары масс-спектрометрияны колдонот. Масс-спектрометрия натыйжасында метаболиттер жана алардын концентрациясы клеткалардын же ткандардын чыныгы биохимиялык абалын чагылдырат. Демек, метаболомиканы организмдин молекулярдык фенотипинин эң мыкты өкүлү катары кароого болот. Булардан тышкары метаболомиканы протеомиканын уландысы катары кароого болот, анткени метаболиттердин көбү белоктор болгон ферменттердин активдүүлүгүнөн улам пайда болот.
Протеомика менен метаболомиканын кандай окшоштуктары бар?
- Протеомика жана метаболомика геномикага байланыштуу эки омикалык илим.
- Метаболомиканы протеомиканын уландысы катары кароого болот.
- Протеом жана метаболом көптөгөн изилдөөлөр менен тыгыз байланышта.
Протеомика менен метаболомиканын ортосунда кандай айырма бар?
Протеомика - бул клетканын же организмдин ичиндеги протеиндердин түзүлүшүн жана функциясын кеңири масштабдуу изилдөө. Ошол эле учурда, метаболомика - бул белгилүү бир шарттарда клеткадагы, ткандагы же организмдеги метаболиттердин профилдерин изилдөө. Ошентип, бул протеомика менен метаболомиканын негизги айырмасы. Мындан тышкары, протеомика негизинен протеиндердин толук комплексине тиешелүү, ал эми метаболомика негизинен метаболиттердин толук комплексине, анын ичинде пептиддер, углеводдор, липиддер, нуклеозиддер жана экзогендик кошулмалардын катаболикалык продуктулары сыяктуу майда молекулалардын ар түрдүү массивине тиешелүү. Демек, бул протеомика менен метаболомиканын дагы бир айырмасы.
Төмөнкү инфографика протеомика менен метаболомиканын айырмасын жалпылайт.
Кыскача – Протеомика жана Метаболомика
Тирүү организмдерди алардын геному, белоктору жана метаболиттери аркылуу изилдөөгө болот. Геномика, протеомика жана метаболомика - тиешелүүлүгүнө жараша клетканын же организмдин генетикалык түзүлүшүн, белокторун жана метаболиттерин изилдеген үч тармак. Протеомика маанилүү, анткени ал гендердин жана айлана-чөйрөнүн динамикалык чагылышы. Метаболомика абдан маанилүү, анткени ал клеткалардын биохимиялык реакциясынын учурдагы абалын же организмдин зат алмашуу абалын түздөн-түз чагылдырат. Ошентип, бул протеомика менен метаболомика ортосундагы айырманы жалпылайт.
