Шайн Далгарно менен Козак ырааттуулугунун негизги айырмасы - Shine Dalgarno ырааттуулугу бактериялык жана археалдык кабарчы РНКдагы рибосомалык байланыш сайты, ал эми Козак ырааттуулугу көпчүлүк эукариоттук кабарчы РНКларда белок которууну баштоо сайты болуп саналат.
Shine Dalgarno жана Kozak ырааттуулугу которууну баштоо үчүн абдан маанилүү болгон эки консенсус ырааттуулугу. Молекулярдык биологияда транскрипция – бул транскрипция процессинен кийин цитоплазмадагы рибосомалардын белокторду синтездөө процесси. Котормодо мРНК (кабарчы РНК) ядронун сыртында белгилүү бир аминокислота чынжырын өндүрүү үчүн рибосомада чечмеленет. Адатта, рибосома mRNA кодондоруна комплементардык тРНК антикодон тизмегинин байланышын жеңилдетүү аркылуу декоддоо процессин индукциялайт. Которуу үч этапта жүрөт: баштоо, узартуу жана токтотуу.
Shine Dalgarno Sequence деген эмне?
Shine Dalgarno ырааттуулугу бактериялык жана археалдык кабарчы РНКдагы рибосомалык байланыштыруучу участок. Ал жалпысынан AUG старт кодонунан 8 базанын тегерегинде жайгашкан. Бул РНК ырааттуулугу рибосоманы mRNA башталгыч кодону менен тегиздөө аркылуу кабарчы РНКга рибосомаларды тартууга жардам берет. Ошентип, ал белок синтезин баштайт. Жумушка алынгандан кийин, тРНК mRNA кодондорунун буйругу боюнча аминокислоталарды ырааттуулук менен кошо алат. Бул өзгөчө ырааттуулук бактерияларда кеңири таралган, бирок археада сейрек кездешет. Мындан тышкары, ал хлоропласт жана митохондриялык транскрипттерде да бар. Shine Dalgarno ырааттуулугун биринчи жолу австралиялык окумуштуулар Жон Шайн жана Линн Далгарно сунуштаган. Алты базалык консенсус ырааттуулугу AGGAGG болуп саналат. Мисалы, ичеги таякчасында ырааттуулук AGGAGGU болуп саналат.
01-сүрөт: Shine Dalgarno Sequence
Инициациялоочу жерди тандоо (AUG) рибосоманын 30S суббирдиги менен мРНК шаблонунун ортосундагы өз ара аракеттенүүгө көз каранды. 30S суббирдигинин 16srRNA компонентиндеги пиримидинге бай аймак мРНКдагы AUG демилге кодонунун жогору жагындагы Shine Dalgarno ырааттуулугу деп аталган пуринге бай аймак менен байланышат. Мындан тышкары, инициация комплексинин пайда болушу учурунда бул толуктоочу нуклеотид тизмектери жупташып, эки тилкелүү РНК түзүлүшүн пайда кылышат. Бул иРНКнын рибосома менен байланышын жеңилдетет, инициация кодону рибосоманын P жерине жайгаштырылат.
Козак ырааты деген эмне?
Козак ырааттуулугу эукариоттук мРНКнын көпчүлүгүндө белок которуунун башталгыч жери. Бул ырааттуулук Козак консенсус тизмеги деп да аталат. Козак ырааттуулугу - эукариоттордогу которууну баштоо үчүн оптималдуу ырааттуулук. Бул ырааттуулук белок жөнгө салуу ажырагыс аспект болуп саналат. Бул жалпы клеткалык ден соолук үчүн да абдан маанилүү. Ал рибосомалардын жыйындысын жана которуунун башталышын ортомчулук кылып, генетикалык билдирүүлөрдөн белоктун котормосун оңдоого жардам берет.
02-сүрөт: Козак ырааттуулугу
Бул тизмек аны ачкан илимпоз Мэрилин Козактын атынан аталып калган. Ал ДНКнын геномдук тизмегин деталдуу талдоо аркылуу ачкан. Козак ырааттуулугу 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Чоң тамгалар сакталган негиздерди, ал эми кичине тамгалар жалпы өзгөрмө негиздерин көрсөтөт. R дайыма ушул жерде жайгашкан пуринди (аденин же гуанин) көрсөтөт.
Shine Dalgarno жана Kozak Sequence ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Shine Dalgarno жана Kozak ырааттуулугу котормонун башталышында абдан маанилүү болгон эки консенсус ырааттуулугу.
- Экөө тең РНК тизмеги.
- Рибосоманын кичирээк суббирдиги эки катарга тең байланышат.
- Эки ырааттуулук тең рибосомалардын туура чогулушуна жана которуунун башталышына ортомчулук кылат.
- Алар белокту жөнгө салуунун жана жалпы клеткалык ден соолуктун ажырагыс аспектилери.
Shine Dalgarno жана Kozak Sequence ортосунда кандай айырма бар?
Shine Dalgarno ырааттуулугу бактериялык жана археалдык кабарчы РНКда табылган рибосомалык байланыш сайты, ал эми Козак ырааттуулугу көпчүлүк эукариоттук кабарчы РНКда табылган белок которууну баштоо сайты. Демек, бул Shine Dalgarno жана Kozak ырааттуулугун ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, Shine Dalgarno ырааттуулугу 5'AGGAGGU3', ал эми Козак ырааты 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Төмөнкү инфографикада Shine Dalgarno менен Козак ырааттуулугунун ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача маалымат – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno жана Kozak ырааттуулугу эки консенсус РНК ырааттуулугу болуп саналат, алар рибосомалардын жыйындысы жана которуунун башталышы үчүн абдан маанилүү. Shine Dalgarno ырааттуулугу бактериялык жана археалдык кабарчы РНКдагы рибосомалык байланыштыруучу участок болуп саналат, ал эми Козак ырааттуулугу көпчүлүк эукариоттук кабарчы РНКда протеин которууну баштоо сайты. Ошентип, бул Shine Dalgarno менен Козак ырааттуулугунун ортосундагы айырманы жыйынтыктайт.
