T4 ДНК лигаза менен E. coli ДНК лигазасынын ортосундагы негизги айырма T4 ДНК лигаза T4 бактериофагынан бөлүнүп алынган фермент, ал эми E. coli ДНК лигазасы E. coli бактериясынан бөлүнүп алынган фермент..
ДНК лигаза - фосфодиэстер байланышын түзүү аркылуу ДНК тилкелеринин биригишине көмөктөшүүчү ферменттин белгилүү бир түрү. Ал тирүү организмдердин ДНКсындагы бир жипчелүү жана кош тилкелүү үзүлүштөрдү оңдоо менен маанилүү роль ойнойт. Мындан тышкары, ДНК лигазасы ДНКны оңдоодо жана ДНК репликациясында колдонулат. Жогорудагы колдонуулардан тышкары, ДНК лигазасы рекомбинанттык ДНК технологиясы сыяктуу молекулярдык биология эксперименттеринде да кеңири колдонулат. T4 ДНК лигаза жана E. coli ДНК лигаза ДНК лигаза ферменттеринин эки түрү болуп саналат.
T4 DNA Ligase деген эмне?
T4 лигаза - T4 бактериофагынан бөлүнүп алынган ДНКны бириктирүүчү фермент. T4 бактериофаг - ичеги таякчасын жугузуучу вирус. T4 лигаза энзим молекулярдык биологиялык лабораториялык изилдөөдө көбүнчө колдонулган ДНК лигаза болуп саналат. Адатта, T4 лигаза кош тилкелүү ДНКнын 5' фосфат жана чектеш нуклеотиддердин 3' гидроксил топторунун ортосундагы эки бириккен же туюк аягы бар тилкелердин кошулушун катализдейт. Ал ошондой эле РНКнын дуплекстүү молекуладагы ДНК же РНК тилкесине кошулушун катализдей алат. Бирок бул фермент бир нуклеиндик кислоталарга кошулбайт. Мындан тышкары, ал E. coli ДНК лигазасына караганда бир топ натыйжалуулугу менен туңгуюк ДНКны байлайт.
01-сүрөт: T4 ДНК лигаза
Бул фермент кофактор катары АТФти талап кылат. Кээ бир генетикалык инженерия изилдөө эксперименттери жапайы типтеги T4 ДНК лигазага караганда активдүү ДНК лигаза ферменттерин өндүргөн. ыкмалардын биринде, алар P50 же NF-kB молекуласына да T4 ДНК лигазды тароо менен биригүү энзим молекуласын жараткан. Бул жаңы T4 лигаза ферменти жапайы типтеги T4 ДНК лигазага караганда клондоштуруу үчүн туңгуюк лигацияларда 160% активдүү болгон. Андан тышкары, Т4 ДНК лигазасынын лигация реакциясын катализдөө үчүн оптималдуу температурасы 16 °C.
E Coli ДНК лигасы деген эмне?
E. coli ДНК лигаза E. coli бактерияларынан бөлүнүп алынган фермент. E. coli ДНК лигазасын жасоо үчүн жооптуу ген lig гени болуп саналат. E. coli ДНКсы, лигаза жана прокариоттордун көпчүлүк ДНК лигазалары фосфодиэстер байланышын түзүү үчүн NAD (никотинамид аденин динуклеотид) алган энергияны колдонушат.
Сүрөт 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli ДНК лигазасы - 5' фосфаттык жана 3' гидроксил терминалдарын камтыган кош тилкелүү ДНК фрагменттеринин ортосунда фосфодиэфир байланыштарын түзүүнү катализдөө жолу менен ДНК фрагменттерин бириктире алган лигаза ферменти. Мындан тышкары, ал полиэтилен гликол менен молекулярдык толтуруу сыяктуу өзгөчө шарттарды кошпогондо, туюк ДНКны байлабайт. Ошондой эле РНКны ДНКга эффективдүү кошула албайт. Андан тышкары, E. coli ДНК лигазынын активдүүлүгүн ДНК-полимераза 1 туура концентрацияда болушу менен жогорулатууга болот. Бирок, ДНК-полимераза 1 ферментинин концентрациясы жогору болгондо, ал E. coli ДНК лигазынын активдүүлүгүнө терс таасирин тийгизет.
T4 DNA Ligase жана E Coli DNA Ligase менен кандай окшоштуктар бар?
- T4 ДНК лигаза жана E-coli ДНК лигаза ДНК лигаза ферменттеринин эки түрү болуп саналат.
- Экөө тең аминокислоталардан турган белоктор.
- Бул ферменттер дуплекстүү ДНКдагы 5' фосфат менен 3' гидроксил терминалдарынын ортосунда фосфодиэстер байланышын түзүүнү катализдейт.
- Алар рекомбинантты ДНК технологиясы сыяктуу молекулярдык биология эксперименттеринде кеңири колдонулат.
T4 DNA Ligase жана E Coli DNA Ligase ортосунда кандай айырма бар?
T4 ДНК лигаза T4 бактериофагынан бөлүнүп алынган фермент, ал эми E. coli ДНК лигазасы E. coli бактерияларынан бөлүнүп алынган фермент. Ошентип, бул T4 ДНК лигаза жана E. coli ДНК лигаза ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, T4 ДНК лигаза үчүн энергия булагы ATP болуп саналат. Башка жагынан алганда, E. coli ДНК лигазасы үчүн энергия булагы NAD болуп саналат.
Төмөнкү инфографикада T4 ДНК лигаза менен E coli ДНК лигасынын ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 ДНК лигаза жана E. coli ДНК лигазасы дуплекстүү ДНКдагы 5' фосфат жана 3' гидроксил терминалынын ортосунда фосфодиэфир байланышын түзүүнү катализдеген эки фермент. T4 лигаза T4 бактериофагынан бөлүнүп алынган фермент, ал эми E. coli ДНК лигазасы E. coli бактерияларынан бөлүнүп алынган фермент. Демек, бул T4 ДНК лигаза менен E coli ДНК лигазынын ортосундагы негизги айырма.
