Ксилол цианол менен бромофенол көктүн негизги айырмасы 1% агароз гелинде ксилол цианол жайыраак, ал эми бромофенол көк тезирээк миграцияда.
Ксилен цианол жана бромофенол көк агароздук гел электрофорез жана полиакриламиддик гел электрофорез процессине мониторинг жүргүзүү үчүн колдонула турган түс маркерлери катары маанилүү.
Ксилен цианол деген эмне?
Ксилен цианол – бул электрофоретикалык түс маркер же байкоочу боёк. Бул агароз гел электрофорез жана полиакриламид гел электрофорез процессине мониторинг жүргүзүү үчүн пайдалуу. Бул зат үлгү менен аралашканда, бул заттын концентрациясы адатта 0гө айланат.005%тен 0,03%ке чейин. Ксилен цианол үчүн колдоно турган кээ бир синонимдерге Acid Blue 147, ксилол цианол, ксилол цианол FF, ксилол цианол FF ж.б. кирет.
Бул кошулманын химиялык формуласы: C25H27N2NaO 6S2 Ксилол цианолдун молярдык массасы 538,61 г/моль. Бул зат 1% агароздук гелдерде 4-5 килобаза жуп ДНК фрагменттеринин ылдамдыгы менен көчүп кете алат. Бирок, бул биз колдонгон буферден көз каранды. Адатта, 6% полиакриламиддик гелдеги ксилол цианол болжол менен 140 база жуп ДНК фрагменттеринин ылдамдыгы менен көчүп кете алат. Башка жагынан алганда, ал 20% денатурациялоочу полиакриламиддик гел электрофорезинде 25 базалык олигонуклеотиддин ылдамдыгы менен өтүшү мүмкүн.
Ксилол цианолунун суутек байланышынын донорлорунун саны 2м, ал эми суутек байланышынын акцепторунун саны 8. Бул кошулманын айлануучу байланыштарынын саны 7 деп берилиши мүмкүн. Ксилол цианолунун татаалдыгын 1120 градус деп айтууга болот. Анын аныкталган байланыш стереоборборунун саны 1.
Бромфенол көк деген эмне?
Бромфенол көк - электрофоретикалык түс маркер жана боёк катары пайдалуу рНнын пайдалуу көрсөткүчү. Бул химиялык аты бар 3', 3", 5', 5" tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. Бул кошулманын химиялык формуласы C19H10Br4O5 S. Бул кошулманын молярдык массасы 669,96 г/моль. Бул жытсыз жана анын тыгыздыгы 2,2 г/мл катары берилиши мүмкүн. Анын эрүү температурасы Цельсий боюнча 273 градус, кайноо температурасы 279 градус. Биз аны мөңгү уксус кислотасындагы фенолсульфонфталеиндин ысык эритмесине ашыкча бромду акырындап кошуп даярдай алабыз.
Бромфенол көк рН 3,0дан 4,6га чейинки диапазондо кислота-база индикатору катары пайдалуу. Ал рН 3.0 боюнча сарыдан рН 4.6га чейин өзгөрө алат. Анын үстүнө, бул кайра кайтарылуучу реакция. Структурасы боюнча бромофенол көк фенолфталеинге окшош.
Мындан тышкары, биз аны агароздук гел электрофорез жана полиакриламиддик гел электрофорез процессин көзөмөлдөө үчүн түстүү маркер катары колдоно алабыз. Бул зат орточо рНда терс зарядды көтөрө алат, ал жерде гелдеги ДНК же белок сыяктуу бир багытта көчүп кете алат. Миграция ылдамдыгы гелдин тыгыздыгына жана буфердик курамына жараша өзгөрүшү мүмкүн. Бирок, 1 жолку TAE буфериндеги же TBE буфериндеги типтүү 1% агароз гелинде бул зат болжол менен 300 негизги жуптан турган ДНК фрагменти менен бирдей ылдамдыкта миграцияланат.
Ксилен цианол менен бромофенол көктүн ортосунда кандай айырма бар?
Ксилен цианол жана бромофенол көк маанилүү түс маркерлери. Ксилен цианол менен бромофенол көктүн негизги айырмасы 1% агароз гелинде ксилол цианол жайыраак, ал эми бромофенол көк тезирээк миграцияда.
Төмөндө ксилен цианол менен бромофенол көктүн ортосундагы айырманын корутундусу жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача маалымат – Ксилен цианол жана Бромфенол Көк
Ксилен цианол жана бромофенол көк агароздук гел электрофорез жана полиакриламиддик гел электрофорез процессине мониторинг жүргүзүүдө колдонулган түс маркерлери катары маанилүү. Ксилол цианол менен бромофенол көктүн ортосундагы негизги айырма 1% агароз гелинде ксилол цианол жайыраак, ал эми бромофенол көк тезирээк миграцияда.
