Негизги айырмасы – Жогорку агым менен Төмөнкү ДНК
Жогорку жана ылдый агымдагы ДНКнын айырмасын түшүнүү үчүн ДНКнын курамы жана түзүлүшү жөнүндө жалпы билимге ээ болуу маанилүү. ДНК полинуклеотиддик чынжырлардан турат. Нуклеотиддер полинуклеотиддик чынжырларды түзүүчү курулуш материалы болуп саналат жана ар бир нуклеотид үч компоненттен турат: беш көмүртектүү кант, азоттуу база жана фосфаттык топ. Нуклеотиддеги кант молекуласынын 5' позициясындагы көмүртек жана 3' позициядагы көмүртектерге фосфат тобу жана OH тобу тиркелет. Нуклеотиддер бир нуклеотиддин 5' фосфат тобу менен чектеш нуклеотиддин 3' OH тобунун ортосунда пайда болгон фосфодиэстер байланыштары аркылуу биригет. Эгерде полинуклеотиддик чынжырда бош 5' фосфат тобу бар болсо, ал 5' учу катары дайындалат; ал бош 3' OH тобуна ээ болсо, ал 3' учу катары дайындалат. Ошондуктан, ДНК тилкелери, адатта, полинуклеотиддик чынжырлардын акыркы орундарына ылайык 5' жана 3' учтары бар. ДНК да кош тилкелүү форма катары бар. Эки жип бири-бирине антипараллель. Демек, ДНКда 5'тен 3'ге чейин жана 3'ден 5'ге чейинки багытты көздөй чуркап эки тилке бар. Жогорку жана ылдый агымдагы ДНК 5'тен 3'ге чейинки мРНК тилкесинин транскрипциясына жана синтезине шилтеме менен айтылат. Эгерде ДНКны транскрипциянын башталышынан коддоочу жиптин 5 учуна карай карай турган болсок, ал ДНКнын өйдө агымы деп аталат. Эгерде ДНК транскрипциянын башталышынан коддоо тилкесинин 3' учуна карай каралса, ылдыйкы ДНК деп аталат. Бул жогорку жана төмөнкү ДНКнын ортосундагы негизги айырма.
Жогорку ДНК деген эмне?
Ген – организмдин ДНКсында жайгашкан структуралык жана функциялык бирдик тукум куучулук. Ал протеинди куруу үчүн көрсөтмөлөр менен сакталат. Ген ДНК молекуласынын белгилүү бир аймагына ээ. Керек болгондо, ал транскрипциялап, мРНК тилкесин синтездөө аркылуу протеинге айланат. Адатта гендин коддоо тилкеси 5'тен 3' багытка чейин иштейт. Ал транскрипцияланганда, ал 5'тен 3'ге чейин бирдей багытта мРНК тилкесин пайда кылат. Транскрипция учурунда 3'тен 5'ге чейинки антисенстик тилке шаблондук жип катары кызмат кылат жана мРНК синтезин баштайт. Генде транскрипцияны баштоочу жер бар. Транскрипциянын башталгыч жерине шилтеме жасоо менен, коддоочу катардын 5' учуна карай ДНК аймагы жогорку агымдагы ДНК деп аталат. Гендин промоутору, адатта, ДНКнын жогорку агымында жайгашкан. Эукариоттук гендерде TATA кутучалары, промотордук проксималдык элементтер жана генге чейинки агымда күчөтүүчүлөр бар. Гендин жогорку агымы терс сандар менен аталат. Гендин жогорудагы ДНКсы транскрипция үчүн өтө маанилүү.
Төмөнкү ДНК деген эмне?
Транскрипцияны баштоо сайты гендин +1 чекити катары белгилүү. +1 чекиттен баштап коддоо тилкесинин 3' учуна чейинки ДНК аймагы ылдыйкы ДНК деп аталат. Башка сөз менен айтканда, гендин ылдый агымы транскрипциянын башталгыч жеринен шаблон жипчесинин 5' учуна чейин болот. Демек, ген аймагынын ылдыйкы ДНКсы транскрипция бирдигин жана терминатор ырааттуулугу сыяктуу башка ырааттуулуктарды камтыйт. Промотор гендин ылдый агымына таасир этиши мүмкүн. Гендин төмөнкү бөлүгү оң сандар менен аталат. Гендин ылдыйкы ДНКсы протеин продуктуну берген чыныгы аймак.
01-сүрөт: Жогорку жана ылдый агымдагы ДНК
Жогорку агым менен Төмөнкү ДНКнын ортосунда кандай айырма бар?
Жогорку агым менен Төмөнкү ДНК |
|
| Транскрипция башталган жерден коддоо ырааттуулугунун 5' учуна карай ДНК аймагы жогорку агымдагы ДНК деп аталат. | Транскрипция башталган жерден коддоочу жиптин 3' учуна карай ДНК аймагы ылдый агым ДНК деп аталат. |
| Элементтер | |
| Промоторлор жана күчөткүчтөр жогорку агымдагы ДНКда жайгашкан | Транскрипция бирдиги жана терминатор ырааттуулугу ылдыйкы ДНКда жайгашкан. |
| Номерлөө | |
| Жогорку агымдагы нуклеотиддер терс сандар менен белгиленет | Нуклеотиддер оң сандар менен белгиленет. |
| Функция | |
| Бул аймакта транскрипцияны жөнгө салуу жана баштоо үчүн керектүү элементтер камтылган | Бул аймакта белок өндүрүү жана транскрипцияны токтотуу нускамасы камтылган |
Корытынды – Жогору агым менен Төмөнкү ДНК
РНК тизмегинин агымынын өйдө жана төмөн жагын аныктоо оңой. Шилтеме сайтына келсек, РНК тилкесинин 5' учуна чейинки аймак агымдагы РНК деп аталат, ал эми 3' учуна карай аймак ылдыйкы РНК деп аталат. Бирок, ДНКда эки багытта 5'тен 3'ге чейин жана 3'тен 5'ге чейинки эки жип бар. Демек, агымдагы жана ылдыйкы ДНКнын ортосундагы айырма татаал. Ошондуктан, ал гендин транскрипциясына карата дифференцияланат. Транскрипция башталган жерден сезүү тилкесинин 5 учуна чейин ДНК аймагы жогорку агым ДНКсы деп аталат, ал эми транскрипциянын башталгыч жеринен сезүү тилкесинин 3' учуна карай ылдый агым ДНКсы деп аталат. Бул ДНКнын өйдө жана ылдый агымынын ортосундагы айырма.
