Негизги айырма – YAC менен BAC векторлору
Векторлор молекулярдык клондоштурууда колдонулат. Вектор башка клеткага бөтөн генетикалык материалды алып өтүү үчүн транспорт каражаты катары иш алып барган ДНК молекуласы катары аныкталышы мүмкүн. Чет элдик ДНКны камтыган вектор рекомбинантты ДНК деп аталат жана аны кабыл алуучу организмдин ичинде репликациялоо жана экспрессиялоо мүмкүнчүлүгүнө ээ болушу керек. Ачыткы жасалма хромосома (YAC) жана бактериялык жасалма хромосома (BAC) клондоштурууга катышкан векторлордун эки түрү болуп саналат. YAC менен BAC ортосундагы негизги айырма, YAC ачыткы клеткаларына генетикалык материалдардын чоң сегменттерин киргизүү үчүн ачыткы хромосомасынын белгилүү бир аймагын колдонгон жасалма жол менен курулган вектордук система, ал эми BAC E. белгилүү бир аймагын колдонуу менен жасалма жол менен курулган вектордук система.coli хромосомасы ДНКнын чоң сегменттерин E. coli клеткаларына киргизүү үчүн.
YAC векторлору деген эмне?
YAC (ачыткы жасалма хромосома) – жасалма жол менен курулган хромосома, ал чет элдик ДНКнын чоң сегментин алып жүрүү жана ачыткы клеткаларынын ичинде репликациялоо жөндөмүнө ээ. Анын центромерасы, теломерлери, ошондой эле репликация жана туруктуулук үчүн маанилүү болгон автономдуу репликацияланган тизмектери бар. YAC ошондой эле клондоштуруунун эффективдүү вектору болушу үчүн тандалма маркерди же маркерлерди жана чектөө сайттарын камтышы керек. 1000 кбдан 2000 кбга чейинки чоң ырааттуулукту YACга киргизип, ачыткыга өткөрсө болот. YAC трансформациясынын натыйжалуулугу өтө төмөн.
01-сүрөт: YAC Vector
BAC векторлору деген эмне?
Бактериялык жасалма хромосома (BAC) - молекулярдык клондоо үчүн жасалма жол менен курулган хромосома. Анын E. coli F плазмидинин белгилүү бир аймактары бар жана ал тегерек жана супер ийилген. BAC ДНК фрагменттерин бактерияларга, айрыкча E. coliге клондоо үчүн иштелип чыккан. Ал 300 кб чейин өлчөмдөгү ДНК фрагменттерин көтөрө алат. YAC менен салыштырганда, BAC клондоочу кыстармалар өлчөмү боюнча кичине. BACs 1992-жылы иштелип чыккан жана ал туруктуулугуна жана курулуштун жөнөкөйлүгүнө байланыштуу дагы деле популярдуу. BACs вакциналарды иштеп чыгууда да пайдалуу.
02-сүрөт: Молекулярдык клондоодо BAC вектору
YAC менен BAC векторлорунун ортосунда кандай айырма бар?
YAC vs BAC векторлору |
|
| YAC – клондоо максатында ачыткы ДНКсы колдонулган генетикалык инженерияланган хромосома. | BAC – клондоо максатында E. coli ДНКсын колдонгон генетикалык инженерияланган ДНК молекуласы. |
| Жынысы | |
| YACлар геномдук ДНКнын чоң фрагменттерин ачыткыга клондоо үчүн иштелип чыккан. | BACs чоң геномдук фрагменттерди Escherichia coliге клондоо үчүн иштелип чыккан. |
| Кыстаруу узундугу | |
| YAC'лар мегабаза өлчөмүндөгү геномдук кошумчаларды камтышы мүмкүн.(1000 кб – 2000 кб). | BAC'лар 200–300 кб же андан аз кыстармаларды көтөрө алат. |
| Курулуш | |
| YAC ДНКсын бүтүн бойдон тазалоо кыйын жана YAC вектордук системасын түзүү үчүн жогорку концентрацияны талап кылат. | BAC бүтүн бойдон тазалоо оңой жана оңой түзүлөт. |
| Химеризм | |
| YACлар көбүнчө химерикалык. | BAC'лар сейрек химерикалык болот. |
| Туруктуулук | |
| YAC туруксуз. | BAC туруктуу. |
| Модификациялар | |
| Ачыткы рекомбинациясы абдан мүмкүн жана ар дайым активдүү бойдон калууда. Демек, ал YACда жок кылууларды жана башка кайра уюштурууларды жаратышы мүмкүн. | E. coli рекомбинациясынын алдын алат жана керек болгондо күйгүзүлөт. Демек, ал BAC'лардагы керексиз кайра уюштурууларды азайтат. |
| Техникалык тейлөө | |
| Рекомбинантты YACтарды манипуляциялоо, адатта, кийинки манипуляция үчүн YACды E. coliге өткөрүп берүүнү талап кылат. Демек, бул оор процесс. | BAC модификациясы түздөн-түз E. coliде пайда болот. Демек, ДНК трансферинин кереги жок. Демек, процесс оор эмес. |
Кыскача маалымат – YAC жана BAC векторлору
YAC кабыл алуучу организмге ДНКнын чоң фрагменттерин клондоо жөндөмдүүлүгүнөн улам клондоо процесстеринде маанилүү изилдөө куралы болуп калды. Бирок, YACs бир нече кемчиликтери бар, мисалы, курулуш кыйынчылыктар, химеризм, туруксуздук, ж.б. сыяктуу векторлор. Ошондуктан бул көйгөйлөрдү чечүү үчүн, окумуштуулар BAC векторлорун иштеп чыгышкан. BAC E. coli хромосомасынын белгилүү аймактарын колдонуу менен курулган. Бул туруктуу вектор жана оңой түзүлүшү мүмкүн. Бирок, BAC иштей ала турган ДНКнын узундугу YACга караганда 20 эсеге аз. Бул YAC жана BAC вектордук системаларынын ортосундагы айырма. Учурда лабораторияларда YACга караганда BAC көбүрөөк тандалат.
