Рестрикциялык эндонуклеаза менен экзонуклеазанын негизги айырмасы – бул рестрикциялык эндонуклеаза белгилүү бир ДНК ырааттуулугун тааныган жана ДНКны ошол ырааттуулуктун ичинде же ага жанаша бөлгөн нуклеаза ферменти, ал эми экзонуклеаза бул нуклеотиддерди нуклеотиддерди ажыратуучу нуклеаза ферменти. полинуклеотиддер 5' учунан же 3' учунан бирден.
Нуклеазалар нуклеин кислоталарынын нуклеотиддери ортосундагы фосфодиэстер байланыштарын ажыратуучу ферменттер. Тирүү организмдерде алар клеткадагы ДНКны оңдоонун көптөгөн аспектилери үчүн маанилүү курал болуп саналат. Бул ферменттердин кемчиликтери генетикалык туруксуздукка жана иммундук жетишсиздикке алып келиши мүмкүн. Чектөөчү нуклеазалар – иштеши белгилүү бир нуклеотиддердин ырааттуулугуна көз каранды болгон өзгөчө нуклеазалар. Мисалы, чектөө эндонуклеазасы. Эндонуклеаза жана экзонуклеаза сыяктуу активдүүлүк локусуна негизделген нуклеазалардын негизги классификациясы бар. Эндонуклеаза максаттуу ДНК молекуласынын ортосундагы аймактарды сиңирет. Экзонуклеаза нуклеин кислоталарын учунан сиңирет. Демек, чектөө эндонуклеаза жана экзонуклеаза нуклеаза ферменттеринин эки түрү болуп саналат.
Чектөөчү эндонуклеаза деген эмне?
Рестрикциялык эндонуклеаза – бул белгилүү бир ДНК ырааттуулугун тааныган жана ДНКны ошол ырааттуулуктун ичинде же ага жанаша бөлгөн нуклеаза ферменти. Белгилүү ДНК ырааттуулугу чектөө сайты деп аталат. Ал ошондой эле чектөө ферменти же рестритаза деп аталат. чектөө эндонуклеаза абдан өзгөчө бир фермент болуп саналат. Бул энзимдердин кененирээк эндонуклеаза тобунун бир классы. Чектөө эндонуклеазалары көбүнчө беш түргө бөлүнөт, алар түзүлүшү жана таануу жеринде ДНК субстратын кесүү жөндөмү боюнча айырмаланат. Беш түрү: I түрү, II түрү, III түрү, IV түрү жана V түрү.
01-сүрөт: Чектөөчү эндонуклеаза
Чектөөчү эндонуклеазалар көбүнчө бактерияларда жана археада кездешет. Алар бактерияларды вирустарга каршы коргоо механизмин камсыз кылат. 3600дөн ашык чектөөчү эндонуклеазалар белгилүү. Алар 250дөн ашык ар кандай өзгөчөлүктөрдү билдирет. Алардын 3000ден ашууну деталдуу изилденген. Мындан тышкары, алардын 800дөн ашыгы коммерциялык жактан жеткиликтүү.
Эксонуклеаза деген эмне?
Экзонуклеаза - полинуклеотиддеги нуклеотиддерди 5' учунан же 3' учунан бирден ажыратуучу нуклеаза ферменти. Бул аягында нуклеотиддердин ортосундагы фосфодиэстер байланыштарын үзүүчү гидролиздөө реакциясы аркылуу болот. Эукариоттор жана прокариоттор экзонуклеазанын үч түрү бар. Бул экзонуклеазалар мРНКнын нормалдуу алмашуусуна катышат. Алар 5' 3' экзонуклеаза (Xrn1), 3' 5' экзонуклеаза жана поли-А спецификалык 3' 5' экзонуклеаза. 5' 3' экзонуклеаза көз каранды декаппинг белок болуп саналат. 3' 5' экзонуклеаза көз карандысыз белок болуп саналат. Поли А спецификалык 3'-5' экзонуклеаза поли-А куйругунун экзонуклеолитикалык деградациясына катышкан поли-А спецификалык рибонуклеаза катары да белгилүү.
02-сүрөт: Экзонуклеаза
Археяларда да, эукариоттордо да РНКнын деградациясы 3'-5' экзорибонуклеазалардан турган көп белоктуу экзосома комплекси тарабынан ишке ашырылат.
Чектөө эндонуклеазасы менен экзонуклеазанын кандай окшоштуктары бар?
- Рестрикциялык эндонуклеаза жана экзонуклеаза нуклеаза ферменттеринин эки түрү.
- Эки фермент тең ДНК молекулаларын кесип.
- Бул ферменттер прокариоттордо кездешет.
- Алар белоктор.
Чектелген эндонуклеаза менен экзонуклеазанын ортосунда кандай айырма бар?
Рестрикциялык эндонуклеаза – белгилүү бир ДНК ырааттуулугун таанып, ДНКны ошол ырааттуулуктун ичинде же ага жанаша бөлүүчү нуклеаза ферменти, ал эми экзонуклеаза – полинуклеотиддеги нуклеотиддерди 5' учунан же 3' учунан ажыратуучу нуклеаза ферменти бир бирден. Ошентип, бул чектөө эндонуклеаза менен экзонуклеазанын ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, чектөө эндонуклеаза прокариоттордо гана, ал эми экзонуклеаза прокариоттордо да, эукариоттордо да кездешет.
Төмөнкү инфографикада чектөө эндонуклеазасы менен экзонуклеазанын ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача – Чектөөчү эндонуклеаза жана экзонуклеаза
Нуклеазалар нуклеин кислоталарынын нуклеотиддери ортосундагы фосфодиэстер байланыштарын үзүүчү ферменттер. Чектөө эндонуклеаза жана экзонуклеаза нуклеаза ферменттеринин эки түрү болуп саналат. Чектөөчү эндонуклеаза белгилүү бир ДНК ырааттуулугун тааныган жана ДНКны ошол ырааттуулуктун ичинде же ага жанаша бөлгөн нуклеаза ферменти. Экзонуклеаза - полинуклеотиддеги нуклеотиддерди 5' учунан же 3' учунан бирден ажыратуучу нуклеаза ферменти. Ошентип, бул чектөө эндонуклеаза менен экзонуклеазанын ортосундагы айырманы жалпылайт.
