Интегралдык протеиндер жана перифериялык протеиндер
Белоктар бир же бир нече полипептиддик чынжырдан турган макромолекулалар катары каралат. Полипептиддик чынжырлар бири-бирине пептиддик байланыштар менен байланышкан аминокислоталардан турат. Белоктун негизги структурасын аминокислота ырааттуулугу менен аныктоого болот. Кээ бир гендер көптөгөн белокторду коддошот. Бул гендер аминокислоталардын ырааттуулугун аныктап, ошону менен алардын негизги түзүлүшүн аныкташат. Интегралдык жана перифериялык белоктор пайда болушуна байланыштуу "плазма мембранасынын белоктору" катары каралат. Бул белоктор тышкы чөйрө менен өз ара аракеттенүү үчүн клетканын жөндөмдүүлүгү үчүн жалпысынан жооптуу.
Интегралдык протеин
Интегралдык белоктор негизинен плазма мембранасынын фосфолипиддердин кош катмарында толук же жарым-жартылай суу астында кездешет. Бул белоктордо полярдуу жана полярдуу эмес аймактар бар. Полярдык баштар кош катмардын бетинен чыгып турат, ал эми полярдуу эмес аймактар ага камтылган. Адатта полярдуу эмес аймактар гана фосфолипиддердин май кислотасынын куйруктары менен гидрофобдук байланыш түзүү аркылуу плазма мембранасынын гидрофобдук өзөгү менен өз ара аракеттенишет.
Бүт мембрананы ички бетинен сырткы бетине чейин камтыган интегралдык белоктор трансмембраналык белоктор деп аталат. Трансмембраналык белоктордо липиддик катмардан чыккан эки учу полярдуу же гидрофильдүү аймактар болуп саналат. Ортоңку аймактар полярдуу эмес жана бетинде гидрофобдук аминокислоталар бар. Өз ара аракеттенүүнүн үч түрү бул белокторду липиддик кош катмарга киргизүүгө жардам берет, атап айтканда, фосфолипиддердин молекулаларынын полярдык баштары менен иондук өз ара аракеттенүүсү, фосфолипиддердин молекулаларынын гидрофобдук куйруктары менен гидрофобдук өз ара аракеттешүүсү жана липиддердин, гри-липакчалардын айрым аймактары менен спецификалык өз ара аракеттенүүсү.
Перифериялык протеин
Перифериялык белоктор (тышкы белоктор) фосфолипиддердин кош катмарынын эң ички жана эң сырткы катмарында болот. Бул белоктор плазма мембранасы менен түздөн-түз эки катмар фосфолипиддердин полярдык баштары менен өз ара аракеттенүү аркылуу же кыйыр түрдө интегралдык белоктор менен өз ара аракеттенүү аркылуу эркин байланышат. Бул белоктор жалпы мембрана белокторунун болжол менен 20-30 % түзөт.
Перифериялык белоктордун көбү мембрананын эң ички бетинде же цитоплазмалык бетинде жайгашкан. Бул белоктор май чынжырлары менен коваленттик байланыштар аркылуу же фосфолипиддерге олигосахарид аркылуу байланышкан.
Интегралдык жана перифериялык протеиндин ортосунда кандай айырма бар?
• Перифериялык белоктор плазма мембранасынын бетинде пайда болот, ал эми интегралдык белоктор плазма мембранасынын липиддик катмарына толук же жарым-жартылай чөккөн абалда пайда болот.
• Перифериялык белоктор липиддик кош катмар менен эркин байланышкан жана фосфолипиддердин эки катмарынын ортосундагы гидрофобдук өзөк менен өз ара аракеттенишпейт. Ал эми, интегралдык белоктор тыгыз байланышта жана плазма мембранасынын гидрофобдук өзөгү менен түздөн-түз өз ара аракеттенишет. Ушул себептерден улам интегралдык протеин диссоциациясы перифериялык белокторго караганда кыйыныраак.
• Перифериялык белокторду плазма мембранасынан бөлүп алуу үчүн жумшак дарылоо колдонулушу мүмкүн, бирок интегралдык белокторду изоляциялоо үчүн жумшак дарылоо жетишсиз. Гидрофобдук байланыштарды бузуу үчүн жуугучтар керектелет. Ошентип, интегралдык белокторду плазма мембранасынан бөлүп алууга болот.
• Бул эки белокторду плазма мембранасынан бөлүп алгандан кийин, перифериялык белоктор нейтралдуу суулуу буферлерде эрийт, ал эми интегралдык белоктор нейтралдуу суулуу буферлерде же агрегаттарда эрибейт.
• Перифериялык белоктордон айырмаланып, интегралдык белоктор эригенде липид менен байланышкан.
• Перифериялык белоктордун мисалдары болуп эритроциттердин спектри, цитохром С жана митохондриянын ATP-азасы жана электроплакс мембраналарындагы ацетилхолинэстераза саналат. Интегралдык белоктордун мисалдары: мембрана менен чектелген ферменттер, дары жана гормондук рецепторлор, антиген жана родопсин.
• Интегралдык белоктор болжол менен 70%, ал эми перифериялык белоктор плазма мембранасынын белокторунун калган бөлүгүн түзөт.
