Агароза vs Полиакриламид
Агароза жана Полиакриламид экөө тең сууда эрүүчү полимерлер, бирок алардын келип чыгышынан баштап көптөгөн айырмачылыктарды көрүүгө болот. Агароза жана Полиакриламид экөө тең кеуектүү гел матрицаларын түзүү жөндөмүндө жалпы нерсеге ээ. Буга карабастан, экөөнүн ортосунда бир катар айырмачылыктар бар. Бул эки полимердин ортосундагы негизги айырмачылыктар алардын келип чыгыш табиятында, химиялык түзүлүшүндө, ар кандай колдонулуштарында жана гел электрофорезинин көрсөткүчтөрүндө жатат.
Агароза деген эмне?
Агароза – табигый жол менен пайда болгон сызыктуу полимер, ал өз кезегинде балырларда табылган агар деп аталган татаал полимерден алынган. Агароза агаропектин деп аталган белок компонентин алып салуу аркылуу агардан алынат. Агароза ага гелдерди пайда кылуу жөндөмүн берет.
Агарозанын негизги колдонулушу микробиологиялык жана молекулярдык биологиялык изилдөөлөр болуп саналат. Микробиологиялык изилдөөлөрдө агароза ылайыктуу азыктар менен толукталганда, бактериялар жана козу карындар сыяктуу микроорганизмдерди өстүрүү үчүн бекем базаны түзөт. Жарым катуу концентрацияда колдонулганда, бул микроорганизмдердин кыймылдуулугун баалоодо пайдалуу болушу мүмкүн. Молекулярдык биологияда ал "гель электрофорези" же "агароза гел электрофорези" (AGE) деп аталган эң негизги резолюция процесстеринин бири үчүн маанилүү курал катары кызмат кылат. Гель электрофорези - бул нуклеиндик кислоталарды же белокту алардын өлчөмүнө жана зарядына жараша чечүүгө же бөлүүгө мүмкүндүк берүүчү процесс. Бул жерде агароза көзөнөктүү элек сымал гел катары кызмат кылат, ал аркылуу бөлүнөт.
Агароза структурасы
Полиакриламид деген эмне?
Полиакриламид синтетикалык полимер жана ар түрдүү тармактарда колдонулат. Мурда айтылгандай, анын колдонулушу гелдерди түзүү жөндөмдүүлүгүнө көз каранды. Бирок, мындан тышкары, анын ар кандай концентрациядагы сууну кармап калуу жана агызуу жөндөмдүүлүгү ар кандай тармактарда да колдонулат.
Полиакриламиддин эң кеңири таралган жана кеңири колдонулушу бул агынды сууларды тазалоодо. Бул жерде, ал кандайдыр бир токтотулган органикалык материалдарды алып салуу үчүн flocculating агент катары колдонулат; демек, булганууну жакшыртуу жана сууну тазалоо. Полиакриламидди дагы бир колдонуу кагаз өнөр жайы болуп саналат. Бул жерде, талапка жараша кагаз массасынан сууну кармап туруу же агызуу үчүн колдонулат. Ошо сыяктуу эле айыл чарба жана курулуш өнөр жайларында кыртыштын эрозиясын алдын алуу жана анын сапатын жакшыртуу үчүн кыртыштын кондиционери катары колдонулат.
Агароза сыяктуу эле, полиакриламид да молекулярдык биологияда "Полиакриламиддик гел электрофорези" (PAGE) деп аталган окшош процессте маанилүү чечүүчү курал катары колдонулат. Мунун баарына кошумча, Полиакриламид руданы кайра иштетүүдө жана флокуляциялоочу агентти өндүрүүдө ар кандай асма органикалык материалды алып салуу үчүн колдонулат; демек, булганууну жакшыртуу жана сууну тазалоо. Полиакриламидди дагы бир колдонуу кагаз өнөр жайы болуп саналат. Бул жерде, талапка жараша кагаз массасынан сууну кармап туруу же агызуу үчүн колдонулат. Ошо сыяктуу эле айыл чарба жана курулуш өнөр жайларында кыртыштын эрозиясын алдын алуу жана анын сапатын жакшыртуу үчүн кыртыштын кондиционери катары колдонулат. Мунун баарынан тышкары, полиакриламид тамак-аш кошулмаларын, жумшак контакт линзаларын жана текстиль өндүрүшүндө да колдонулат.
Полиакриламиддик структура
Агароза менен Полиакриламиддин ортосунда кандай айырма бар?
Агароза жана полиакриламиддин келип чыгышы:
Агароза: Агароза – табигый тектүү полимер. Ал балырдан алынган.
Полиакриламид: Полиакриламид синтетикалык келип чыккан жана эч кандай табигый шартта кездешпейт.
Агароза жана полиакриламиддин молекулалык формуласы:
Агароза: Агарозанын молекулалык формуласы C24H38O19.
Полиакриламид: Полиакриламиддин молекулалык формуласы (C 3H5NO)n.
Агароза менен полиакриламиддин химиялык түзүлүшү:
Агароза: Агароза – сызыктуу полисахарид. Ал суутек байланыштары менен бириктирилген агробиоза деп аталган кайталануучу дисахариддик бирдиктерден турат.
Полиакриламид: Полиакриламид химиялык жактан кайчылаш байланышкан полимер. Ал акриламиддик мономерлерден жана кайчылаш агент N, N'-метиленбисакриламидден турат.
Агарозанын жана полиакриламиддин уулуулугу:
Агароза: агароза да, анын мономер бирдиги агробиоза да жаратылышта уулуу эмес.
Полиакриламид: Полиакриламиддин мономер бирдиги, акриламид болжолдонгон канцероген жана белгилүү нейротоксин, ал эми полимерленген түрү жаратылышта уулуу эмес.
Агароза жана полиакриламиддик гелдердин мүнөздөмөлөрү:
AGE жана PAGE:
Агароза: AGE үчүн агароза гелин даярдоо азыраак убакытты талап кылат, оңой жана жөнөкөй жана демилгечи же полимерлөөчү катализаторду талап кылбайт.
Полиакриламид: PAGE үчүн полиакриламиддик гелди даярдоо көп убакытты талап кылат жана түйшүктүү, ошондой эле демилгечи (аммоний персульфат) жана полимерлөөчү катализатор (N, N, N', N'-тетраметилетилендиамин – TEMED) талап кылынат.
Жаратылыш:
Полиакриламиддик гелдер химиялык жактан агароздук гелдерге караганда туруктуураак.
Тешикчелердин өлчөмү:
Ошол концентрацияны эске алганда, полиакриламиддик гел матрицалары агароздук гел матрицасына салыштырмалуу тешикчелердин көлөмү азыраак болот.
Тешикчелердин өлчөмүн өзгөртүү:
Полиакриламиддик гелдердин тешикчелеринин өлчөмү агароздук гелдерге караганда көзөмөлгө алынган түрдө өзгөртүлүшү мүмкүн.
Чечүү күчү:
Полиакриламиддик гелдердин чечүүчү күчү жогору, ал эми агароздук гелдердин чечүүчү күчү төмөн.
Нуклеиндик кислотаны жайгаштыруу:
Полиакриламиддик гелдер чечүүчү каражаттар үчүн агароздук гелдерге караганда көбүрөөк сандагы нуклеин кислотасын батыра алат.