Олигопептид менен полипептиддердин негизги айырмасы – олигопептиддерде аминокислотанын калдыктары аз, ал эми полипептиддерде көп сандагы аминокислота калдыктары бар.
Олигопептиддер жана полипептиддер терминдери белоктордун категориясына кирет. Пептиддер аминокислоталардын кыска чынжырлары. Аминокислоталар бири-бири менен пептиддик байланыштар аркылуу байланышат. Ошондуктан, биз бул пептиддердин аминокислоталардын санына жараша бул пептиддерди категорияга болот. Мисалы, дипептиддер, трипептиддер, тетрапептиддер, олигопептиддер жана полипептиддер.
Олигопептид деген эмне?
Олигопептид – бул ар бир молекулада аз сандагы аминокислоталарды камтыган аминокислоталардын тизмеги. Биз көбүнчө бул молекулаларды жалпы термин катары "пептиддер" деп атайбыз. Бул пептиддик молекулалардагы аминокислота калдыктарынын саны экиден жыйырма аминокислотага чейин болушу мүмкүн. Олигопептиддер дипептиддер, трипептиддер ж.б. сыяктуу кээ бир кичинекей пептиддик формаларды да камтышы мүмкүн. Табигый жактан пайда болгон олигопептиддердин кээ бир жалпы мисалдарына микровиридин, цианопептолиндер, микроцистиндер ж.б. кирет.
01-сүрөт: Трипептиддин түзүлүшү
Бул олигопептиддер рибосомалык эмес пептиддердин синтазалары же NRPS тарабынан өндүрүлөт. Бирок кээ бир өзгөчөлүктөр бар. Мисалы, цикламиддер жана микровиридин рибосомиялык жолдор аркылуу синтезделет. Олигопептиддерди изоляциялоо процессине олигопептиддерди байытуу, тазалоо жана идентификациялоо кирет. Идентификациялоо процесси үчүн гел хроматографиясын, HPLC, HPLC-масса спектроскопиясын, ион алмашуу хроматографиясын ж.
Полипептид деген эмне
Полипептид – көп сандагы аминокислоталарды камтыган аминокислота калдыктарынын тизмеги. Белок бир же бир нече полипептиддик чынжырларды камтыйт. Бул полипептиддик чынжырларда аминокислоталар бири-бири менен коваленттик химиялык байланыштардын бир түрү болгон пептиддик байланыштар аркылуу байланышкан. Ар бир полипептиддик чынжыр эки терминалды камтыйт: N-терминал жана С-терминал. N-терминал эркин амин тобу менен аяктаган амино-терминал, ал эми С-терминал эркин карбоксил тобу менен аяктаган карбоксил-терминал. Пептиддеги аминокислоталардын ырааттуулугу mRNAдагы кодондор менен аныкталат, алар полипептидди же белокту калыпка которуу аркылуу түзүүгө катышат.
Белоктогу полипептиддердин санына жана тизилишине ылайык, белок структураларынын төмөнкүдөй төрт негизги түрү бар:
- Негизги структура – Белоктун негизги түзүлүшү бир чынжырдагы кээ бир аминокислоталардын ортосунда дисульфиддик көпүрөлөргө ээ болгон бир полипептиддик чынжырды камтыйт, бул бүктөлгөн түзүлүштү түзөт.
- Экинчи структура – Белоктун экинчилик структурасы эки негизги формага ээ: альфа-спираль структурасы жана бета-баракча түзүлүшү.
02-сүрөт: Alpha Helix түзүмү
- Үчүнчү структура – Бул өтө бүктөлгөн тармак структурасы. Бул түзүлүш абдан маанилүү, анткени ал белоктун функциясын аныктайт.
- Төрттүнчү түзүлүш – Бул бири-бири менен байланышкан эки же үч полипептиддик чынжырдын өтө татаал структурасы.
Олигопептид менен Полипептидтин ортосунда кандай айырма бар?
Олигопептиддер жана полипептиддер белоктордун эки башка категориясы. Алар белок молекулаларындагы аминокислота калдыктарынын санына жараша бири-биринен айырмаланат. Ошондуктан, олигопептид менен полипептиддердин ортосундагы негизги айырмачылык, олигопептиддердин курамында бир нече аминокислота калдыктары бар, ал эми полипептиддерде көп сандагы аминокислота калдыктары бар.
Төмөнкү инфографика олигопептид менен полипептиддин ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача – Олигопептид менен Полипептид
Олигопептиддер жана полипептиддер белоктордун эки башка категориясы. Бул белок молекулаларындагы аминокислота калдыктарынын санына жараша бири-биринен айырмаланат. Башкача айтканда, олигопептиддер менен полипептиддердин негизги айырмасы, олигопептиддерде аминокислота калдыктары аз, ал эми полипептиддерде көп сандагы аминокислота калдыктары бар.
