I группа менен II группа интрондорунун негизги айырмасы I группадагы интрондордо сплайцинация реакциясы гуанозиндик кофактор тарабынан башталса, II топ интрондордо сплайцинация реакциясы ички аденозин тарабынан башталат.
Пре-мРНК интрондору да, экзондору да бар негизги транскрипт. Пре-мРНК которууга чейин мРНКга айланышы керек. РНК сплайсинг же пре-мРНК сплайсинг транскрипциядан кийинки ушундай модификациялардын бири. РНК сплайсингинде интрондор мРНКга чейинки молекуладан чыгарылып, экзондор бири-бирине кошулат. I жана II группадагы интрондор өзүнөн өзү кошулуучу интрондор. Алар пре-мРНК молекуласынан башка ферменттин жардамысыз ажырашат. Демек, булар РНК ферменттери же рибозимдер, алар пре-мРНКдан өздөрүнүн сплайсингин катализдешет. Мындан тышкары, алар мобилдик элементтер катары иштөө мүмкүнчүлүгүнө ээ. Сплайсинг учурунда интронду акциздөө жана экзондорду байлоо үчүн бир катар трансэтерификация реакциялары жүрөт. Бул рибозимдер үч доменде тең бар, анын ичинде бактериялар, археялар жана эукариоттор.
I тайпадагы интрондор деген эмне?
I-топтогу интрондор бактерияларда, бактериофагдарда жана эукариоттордо (органеллардык жана ядролук геномдор) кездешүүчү өзүн-өзү бириктирүүчү рибозимдердин бир түрү. Алар маанилүү гендерде кездешет. Алар пре-мРНК молекуласынан өздөрүнүн сплайсингин катализдей алышат. I группадагы интрондордо бир нече жүздөн үч миңге чейин нуклеотиддер болушу мүмкүн. Мындан тышкары, алар организмдер боюнча бир аз ырааттуулук окшоштугун көрсөтөт.
01-сүрөт: I топ интрондору
Экинчи структуралар төрт кыска аймакта абдан сакталган. Сплайсингдин трансэтерификация реакциясынын эки баскычы бар. I группадагы интрондор 5P кошулган жеринде гуанозин кофакторунун 3' гидроксилинин нуклеофилдик чабуулу аркылуу сплайстык механизмди башташат.
II-топтогу интрондор деген эмне?
II группа интрондору – бул үч доменге тең тиешелүү организмдерде кездешүүчү өзүн-өзү бириктирүүчү интрондордун бир түрү. Алар пре-мРНКдан өздөрүнүн сплайсинг реакцияларын катализдөөчү рибозимдер. Алар рРНКда, тРНКда жана белок коддоочу гендерде кездешет. Бирок алар I топтун интрондорунан айырмаланып, ядролук геномдо кездешпейт.
02-сүрөт: II топ интрондор
II группадагы интрондор I группадагы интрондорго окшош эки трансэтерификация баскычы аркылуу сплайсацияны катализдейт. Бул ферменттер 5′ сплайс түйүнүндөгү аденозин бутактарынын сайтынын 2′OH нуклеофилдик чабуулу аркылуу сплайсинг реакциясын баштайт. Сплайсинг реакциялары учурунда II группадагы интрондор лариат сымал түзүлүштү түзөт. Мындан тышкары, интрон сплайсинг GTP жок болгондо ишке ашат.
I группа менен II группа интрондорунун кандай окшоштуктары бар?
- Группа I жана II группа интрондору бул РНК ферменттеринин эки түрү, рибозимдер, алар ар кандай механизмдер аркылуу өздөрүнүн бириктирилишин катализдешет.
- Алар чоң рибозимдер.
- Экөө тең үч доменде тең табылган.
- Алар мобилдик элементтер.
- Андан тышкары, алар рРНКда, тРНКда жана белок коддоочу гендерде кездешет.
- Эки фермент тең биотехнологияда жана молекулярдык медицинада максаттуу генди нокаут/нокаут, ген жеткирүү же ген терапия системалары үчүн курал катары колдонууда.
I группа менен II группа интрондорунун ортосунда кандай айырма бар?
I-топтогу интрондор - бактерияларда, бактериофагдарда жана эукариоттук органеллардык жана ядролук геномдордо кездешүүчү рибозимдер. II группа интрондор бактерияларда, археяларда жана эукариоттук органеллдерде кездешүүчү рибозимдер. Мындан тышкары, I группадагы интрондор 5Р сплайс жеринде гуанозин кофакторунун 3′ гидроксилинин нуклеофилдик чабуулу менен сплайсинг реакциясын башташат, ал эми II группа интрондору аденозин бутагынын 2′ ОН нуклеофилдик чабуулу аркылуу сплайсинг реакциясын башташат. 5′ биригүү. Демек, бул I жана II топ интрондорунун ортосундагы негизги айырма.
Мындан тышкары, II группадагы интрондор сплайсинг учурунда лариат сымал структураны түзөт, ал эми I топтун интрондору пайда болбойт. Ошентип, бул I жана II топ интрондорунун ортосундагы дагы бир олуттуу айырма. Мындан тышкары, I группадагы интрондор эукариоттук ядролук геномдордо кездешет, ал эми II группадагы интрондор эукариоттук ядролук геномдордо кездешпейт.
Төмөндө инфографикада I жана II топ интрондорунун ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача маалымат – I группага каршы II группа интрондор
I жана II группадагы интрондор - биринчилик транскрипттен интрондорду бөлүп чыгаруу үчүн трансэтерификация реакциясын катализдеген чоң рибозимдер. Алар бардык үч доменде табылган. Экөө тең мобилдик генетикалык элементтер. Мындан тышкары, алар биотехнология жана молекулярдык медицинада курал катары колдонулат. Бирок I группадагы интрондор 5Р сплайс жеринде гуанозин кофакторунун 3′OH нуклеофилдик чабуулу аркылуу сплайсинг реакциясын баштайт. Бирок, II группа интрондору 5′ сплайс түйүнүндөгү аденозин бутактарынын сайтынын 2′OH нуклеофилдик чабуулу аркылуу сплайсинг реакциясын баштайт. Андан тышкары, II топтун интрондору лариятка окшош структураны түзүшөт, ал эми I топтун интрондору лариат сыяктуу структураны түзбөйт. Ошентип, бул I топ менен II группа интрондорунун ортосундагы айырманын корутундусу.
