crRNA tracrRNA менен gRNA ортосундагы негизги айырма crRNA максаттуу ДНК ырааттуулугун толуктап турган CRISPR РНКсынын эки түрүнүн бири болуп саналат, ал эми tracrRNA CRISPR РНКсынын экинчи түрү болуп саналат, ал Cas нуклеазасы жана gRNA үчүн байланыштыргыч CRISPR-Cas9 бактериялар менен археялар системасынын эки негизги компонентинин бири, ал максаттуу ДНКны тааныйт жана Cas протеиндерин максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүккө учуратууга багыттайт.
CRISPR кластердик үзгүлтүксүз кесилишкен кыска палиндромикалык кайталоолорду билдирет. Бул бактериялардын жана архейлердин иммундук системаларынын бири. Бактериялар жана археялар бул системаны вирустук козгогучтардан коргоо үчүн колдонушат. Бул ийгиликтүү генетикалык модификацияны камтыган эң укмуштуу механизмдердин бири. Бул механизм (CRISPR-Cas9) Биотехнологияда генди оңдоонун жаңы куралы катары колдонулат. Ал биотехнологияга, өзгөчө гендик инженерия тармагына жаңы жетишкендиктерди алып келди.
CRISPR-Cas9 тутумунун эки негизги компоненти бар. Алар жетектөөчү РНК (гРНК) жана CRISPR менен байланышкан (Cas) нуклеазалар. Жетектөөчү РНК - бул максаттуу ДНКны ажыратууга Cas протеиндерин жетектеген белгилүү бир РНК ырааттуулугу. Гид РНК РНКнын эки түрүнөн турат. Алар crispr РНК (crRNA) жана tracrRNA болуп саналат. CRISPR менен байланышкан (Cas) нуклеазалар максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүктөрдү жасаган спецификалык эмес эндонуклеазалар. Бактериялар жана археялар максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүктөрдү жасоо менен алардын эндогендик оңдоо механизмдерин вирустук ДНКны инактивациялоого багыттайт.
КРНК деген эмне?
crRNA же Crispr РНК жетектөөчү РНКнын эки түрүнүн бири. Структуралык жактан алганда, бул 17-20 нуклеотиддик ырааттуулук. crRNAнын эң баалуу өзгөчөлүгү анын максаттуу ДНКга кошумча болушунда. Демек, crRNA вирустук ДНК ырааттуулугу менен дал келет. CRISPR-Cas 9 системасынын өзгөчөлүгү crRNAга көз каранды. Бактерияларда crRNA CRISPR РНКсынын экинчи түрү болгон tracrRNA ырааттуулугуна кошулган. crRNA өндүрүшү бактериялардын вируска кайра таасир этиши менен шартталган. Ачыкка чыкканда crRNA коддоочу гендин транскрипциясы ишке ашат. Андан кийин коргонуу механизми вируска каршы иштей баштайт.
01-сүрөт: CRISPR-Cas9 системасы
TracrRNA деген эмне?
Транс-активдештирүүчү crRNA же tracrRNA гидРНКнын же CRISPR РНКнын экинчи бөлүгү. Бул тракер РНК деп айтылат. tracrRNA эндонуклеаза Cas 9 протеин үчүн байланыштыргыч катары кызмат кылат. Башка сөз менен айтканда, tracrRNA максаттуу ДНКга карай Cas9 жетектөө үчүн тутка катары иштейт. Структуралык жактан тракрРНКда 42 нуклеотид бар. Ал crRNA менен айкалышкан.
gRNA деген эмне?
Гид РНК же gRNA CRISPR-Cas9 иммундук системасынын эки негизги компонентинин бири. Бул эки элементтен турган белгилүү бир РНК тизмеги: crRNA жана tracrRNA. gRNA максаттуу ДНКны тааныйт жана Cas протеиндерин максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүккө учуратууга багыттайт. Бул үчүн crRNA максаттуу ДНКнын кошумча ырааттуулугунан турат, ал эми tracrRNA тутка катары иштеген Cas протеиндерин жетектейт.
02-сүрөт: gRNA
Туура gRNAны долбоорлоо CRISPR-Cas9 генди түзөтүү куралында маанилүү кадам болуп саналат. Демек, CRISPR системасынын ийгилиги жана редакциялоонун натыйжалуулугу gRNAнын туура ырааттуулугунан көз каранды. гРНКны трансфекцияланган плазмидадан клеткаларда көрсөтсө болот. Клондолгон плазмиддер клеткаларга киргизилгенде, кабыл алуучу клеткалар гРНКны жаратат. Эң көп жаралган gRNA 100 базалык жуптан турат.
crRNA tracrRNA жана gRNA ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- crRNA, tracrRNA жана gRNA бактериялар менен археяларда табылган РНК тизмеги.
- Алардын баары CRISPR тутумуна таандык.
- gRNA crRNA жана tracrRNAдан жасалган.
- Алар бактериофагдын ДНКсын таанууга жана эндонуклеазаларды максаттуу ДНКга багыттоого катышат.
- Демек, РНКнын үч түрү тең Cas9 нуклеазасын башка генетикалык материалдарды басып алууда кош жиптүү үзгүлтүккө учуратууга багыттоого катышат.
- CRISPR экспериментинин ийгилиги РНКнын үч түрүнө тең көз каранды.
crRNA tracrRNA менен gRNAнын ортосунда кандай айырма бар?
crRNA максаттуу ДНКга кошумча болгон CRISPR гРНКсынын бир бөлүгү, ал эми тракрРНК Cas нуклеазасы үчүн байланыштыргыч катары кызмат кылган gRNAнын экинчи бөлүгү.gRNA - crRNA менен tracrRNAнын айкалышы жана ал максаттуу ДНКны тааныган жана максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүктөр үчүн нуклеазаларды жетектеген CRISPR-Cas9 системасынын эки компонентинин бири. Демек, бул crRNA tracrRNA менен gRNA ортосундагы негизги айырма.
Төмөнкү таблица crRNA tracrRNA менен gRNA ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача маалымат – crRNA vs tracrRNA vs gRNA
CRISPR-Cas9 системасы – бул бактериялардын жана археялардын иммундук системасы. Бул система Биотехнологияда генди түзөтүүчү курал катары колдонулат. CRISPR РНКнын эки түрүнөн турат, атап айтканда CRISPR РНК (crRNA) жана CRISPR РНКсынын трансактивдештирүүчүсү (tracrRNA). Алар жалпысынан гидРНК же гРНК деп аталат. Бул РНК басып кирген патогендердин максаттуу ырааттуулугун тааныйт жана максаттуу ДНКда кош тилкелүү үзгүлтүктөр үчүн эндонуклеазаларды жетектейт. Чет өлкөлүк генетикалык материалда кош жиптүү үзгүлтүккө учурагандан кийин, эндогендик оңдоо механизми (гомологдук эмес аягы кошулуу; NHEJ) мутацияларды киргизүү менен чет өлкөлүк ДНКны активдештирет. Ошентип, бул crRNA tracrRNA менен gRNA ортосундагы айырманы жалпылайт.
