PARP1 менен PARP2 ортосундагы негизги айырмачылык: өсүмдүк менен жаныбар PARP1 Zn-манжа ДНКны байланыштыруучу мотивдерди, ал эми өсүмдүк PARP2 N-терминалдык SAP ДНКны байланыштыруучу мотивдерди алып жүрөт.
Poly ADP рибоза полимераза (PARP) ядролук ферменттер болгон белоктордун үй-бүлөсү. PARP үй-бүлөсүндө 17 түрдүү PARP ферменттери бар. PARP1 жана PARP2 кадимки ДНКны оңдоо иш-аракеттери үчүн зарыл болгон эки фермент.
PARP деген эмне?
PARP (Poly ADP рибоза полимераза) - ДНКны оңдоо, геномдук туруктуулук жана программаланган клетка өлүмү сыяктуу көптөгөн клеткалык процесстерде кызмат кылган белоктордун үй-бүлөсү. Алар ADP-рибосиляция деп аталган процессти катализдешет. ADP-рибосилденүү ДНК тилкелеринин үзүлүшүн оңдоо үчүн никотинамид адениндинуклеотидинен (NAD) ADP-рибоза бирдиктеринин максаттуу субстраттарга кошулушун билдирет.
PARP ферменттери ДНКны байланыштыруучу белоктор. Алар ДНК молекулаларында болгон никелер менен активдештирет. Алар ДНК тыныгуусу менен байланышкандан кийин, алар NAD+ никотинамидге гидролиздеп, ADP-рибозанын полимеризациясына көмөктөшөт. Ошондуктан, PARP ядролук ферменттери ДНКны оңдоого катышат. Мындан тышкары, поли-ADP-рибосилация репликацияда, транскрипциялоодо, теломерди сактоодо жана белоктун бузулушунда негизги ролду ойногон пост-трансляциялык модификация катары иштейт. PARP ферменттери ошондой эле геномдун туруктуулугун сактоого, хроматин түзүмүн жөнгө салууга, клетканын пролиферациясына жана апоптозго катышат.
PARP1 деген эмне?
PARP1 PARP протеининин үй-бүлө мүчөсү. Бул үй-бүлөдөгү биринчи жана эң жакшы мүнөздөлгөн белок. Ал ДНКнын бузулушун аныктап, андан кийин оңдоо механизмин тандоону жеңилдеткен биринчи жооп берүүчү катары иштейт. Мындан тышкары, PARP1 бир тизмектүү ДНК бузулууларын оңдоону жөнгө салат.
01-сүрөт: PARP1
Бир тилкелүү ДНК сыныктарын оңдоодон тышкары, PARP1 репликация айрысынын прогрессиясын жана кайра башталышын жөнгө салат. Мындан тышкары, ал альтернативалуу эмес аягы кошулууну өбөлгө түзөт.
PARP2 деген эмне?
PARP2 PARP протеин үй-бүлө мүчөлөрүнүн дагы бир белок болуп саналат. Бул PARP1 ферменти менен тыгыз байланышта. PARP2 гени адамдардагы PARP2 протеининин коддору. PARP2 каталитикалык доменге ээ, бирок N терминалдык ДНКны байланыштыруучу домен жок. PARP ингибиторунун ракка каршы дарылары PARP1ге окшош PARP2ди бөгөттөй алат.
02-сүрөт: PARP2
Өсүмдүктөрдө, айрыкча Arabidopsis thalianaда, PARP2 PARP1ге караганда ДНКнын бузулушуна жана бактериялык патогенезге коргоочу жооптордо маанилүү роль ойнойт.
PARP1 менен PARP2 ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- PARP1 жана PARP2 - ядролук ферменттердин эки түрү.
- Алар NAD+ поли ADP рибосилациясын катализдөө үчүн субстрат катары колдонушат.
- Экөө тең ДНКнын бир тилкелик үзүлүшү менен активдешти.
- Сүт эмүүчүлөрдүн PARP1 жана PARP2 ядросунда жайгашкан.
- PARP1 жана PARP2 экөө тең хроматин менен иштешет.
- Алар ДНКнын бузулушун калыбына келтиришет.
- PARP1ге багытталган кээ бир PARP ингибиторунун ракка каршы дарылары да PARP2ди токтотот.
PARP1 менен PARP2 ортосунда кандай айырма бар?
PARP1 каталитикалык домени жана N-терминалдык ДНКны байланыштыруучу домени бар PARP протеининин үй-бүлөсүнүн мүчөсү, ал эми PARP2 N-терминалдык ДНКны байланыштыруучу домени жок PARP үй-бүлөнүн мүчөсү. PARP1 менен PARP2 ортосундагы негизги айырмачылык, өсүмдүк менен жаныбардын PARP1 Zn-манжа ДНКсын байланыштыруучу мотивдерди, ал эми өсүмдүк PARP2 N-терминалдык SAP ДНКны байланыштыруучу мотивдерди алып жүрөт.
Төмөнкү инфографика PARP1 менен PARP2 ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача – PARP1 крш PARP2
PARP - ДНКнын бузулушун сезген жана аларды оңдогон ядролук ферменттер. PARP1 жана PARP2 алардын экөөсү бири-бири менен тыгыз байланышта. Эки ферменттин тең каталитикалык домени бар. Бирок PARP2де PARP1де болгон N-терминалдык ДНКны байланыштыруучу домен жок. Ошентип, бул PARP1 жана PARP2 ортосундагы негизги айырма. Ферменттердин эки түрү тең субстрат катары NAD+ колдонот.
