Клеткасыз ДНКнын жана айлануучу шишик ДНКсынын ортосундагы негизги айырма, клеткасыз ДНК канда эркин айлануучу ДНКнын ар кандай формалары, ал эми шишик ДНКсы канда айлануучу фрагменттелген шишиктен алынган ДНК болуп саналат.
Клеткасыз ДНК жана айлануучу шишик ДНКсы айлануучу нуклеиндик кислоталардын эки түрү. Айланадагы нуклеин кислоталарын 1948-жылы Мандел жана Метал ачышкан. Кийинчерээк, оорулуу пациенттерде циркуляциядагы нуклеиндик кислоталардын саны бир топ жогору экени аныкталган. Бул ачылыш биринчи жолу лупус менен ооруган адамдарга карата жасалган. Мындан тышкары, жүгүртүүдөгү нуклеиндик кислоталар жогорку прогностикалык мааниге ээ жана ар кандай ооруларды аныктоо үчүн биомаркер катары колдонулушу мүмкүн.
Клеткасыз ДНК деген эмне?
Клеткасыз ДНК (Cf ДНК) канда эркин айлануучу ДНКнын ар кандай формаларын билдирет, мисалы, айлануучу шишик ДНКсы, клеткасыз митохондриялык ДНК жана клеткасыз түйүлдүктүн ДНКсы ж.б.. Клеткасыз ДНКнын жогорку деңгээли рак, травма, сепсис, миокард инфаркты, диабет, инсульт, орок сымал клетка оорусу ж.б. оорулардын көптүгү. Бул ДНК трансплантациядан баш тартууну аныктоо үчүн да колдонулушу мүмкүн. Алар ошондой эле кадимки стрессти аныктоодо, төрөткө чейинки жынысты аныктоодо жана аталыкты текшерүүдө колдонулат.
01-сүрөт: Клеткасыз ДНК
Клеткасыз ДНК адатта ДНКнын кош саптуу клеткадан тышкаркы молекуласы. Ал кичинекей фрагменттерден (50дөн 200 кб) жана чоңураак фрагменттерден (21 кб) турат. Мындан тышкары, ал простата жана эмчек рагын аныктоо үчүн ишенимдүү биомаркер катары таанылган. Клеткасыз ДНК негизинен нуклеосомалар түрүндө кан агымында айланат. Нуклеосомалар – гистондордун жана ДНКнын өзөктүк комплекстери. Cf ДНКны ПЦР, массалык параллелдүү секвенирлөө, ультра кызгылт көк спектрометрия, PicoGreen боёгу жана ELISA сыяктуу ар кандай ыкмаларды колдонуу менен сандык аныктоого болот. Кан агымында Cf ДНКсын аныктоо тез, оңой, инвазивдүү эмес, кайталануучу ыкма болгондуктан, келечекте аутоиммундук ревматикалык оорулар жана шишиктер сыяктуу көптөгөн ооруларды диагностикалоо үчүн потенциалдуу биомаркер болот.
Айлануучу шишик ДНКсы деген эмне?
Айлануучу шишик ДНКсы (Ct ДНК) канда айлануучу шишиктен алынган фрагменттелген ДНК. Анын шишик келип чыгышы бар. Айлануучу шишик шишиктин бүт геномун чагылдыра алгандыктан, клиникалык орнотуулардагы потенциалдуу пайдалуулугу үчүн кеңири тартууга ээ болду. Кан алуу үчүн суюк биопсиялар айлануудагы шишиктерди текшерүү үчүн колдонулушу мүмкүн.
02-сүрөт: Айланадагы шишик ДНКсы
Ct ДНКны бөлүп чыгарууга катышкан биологиялык процесстерге өлүп жаткан клеткалардан апоптоз жана некроз же шишик клеткаларынан активдүү бошотуу кирет. Дени сак ткандарда инфильтрацияланган фагоциттер Кт ДНКны тазалай алат. Андан тышкары, айлануудагы шишик ДНКсын талдоодо тамчылык санариптик ПТР, BEAMing, CAPP-Seq (терең секвенирлөө), Коопсуз секвенирлөө жана дуплекстүү секвенирлөө сыяктуу ар кандай ыкмаларды колдонсо болот.
Клеткасыз ДНК менен Айлануучу шишик ДНКсынын кандай окшоштуктары бар?
- Клеткасыз ДНК жана айлануучу шишик ДНКсы айланма нуклеиндик кислоталардын эки түрү.
- Алар нуклеотиддерден турат.
- Эки түрү тең клиникалык орнотууларда ар кандай ооруларды аныктоо үчүн потенциалдуу маркерлер катары колдонулушу мүмкүн.
- Алар кан агымында кездешет.
- Экөө тең ДНК молекулаларынын клеткадан тышкаркы формалары.
- Алар экөө тең инфильтрацияланган фагоциттер аркылуу тазаланат.
Клеткасыз ДНК менен Айлануучу шишик ДНКсынын ортосунда кандай айырма бар?
Клеткасыз ДНК – бул ДНКнын ар кандай формалары, мисалы, айлануучу шишик ДНКсы, клеткасыз митохондриялык ДНК жана клеткасыз түйүлдүктүн ДНКсы, ж.б., алар канда эркин айланышат, ал эми айлануучу шишик ДНКсы – шишиктен алынган фрагменттүү ДНК. бул канда айланып турат. Ошентип, бул клеткасыз ДНК менен айлануучу шишик ДНКсынын ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, клеткадан бош ДНК 50-220 битке чейинки фрагменттерде, ал эми шишик ДНКсы 134-144 bp аралыгындагы фрагменттерде айланат.
Төмөнкү инфографика клеткасыз ДНК менен айлануудагы шишик ДНКсынын ортосундагы айырманы жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө көрсөтөт.
Кыскача маалымат – Клеткасыз ДНК жана Айлануучу шишик ДНК
Айлануучу нуклеиндик кислоталар жөнгө салынган же кокустук механизмдер аркылуу канга ыргытылат. Клетка эркин ДНК жана айлануучу шишик ДНК айлануучу нуклеиндик кислоталардын эки түрү болуп саналат. Клеткасыз ДНК – бул ДНКнын ар кандай формалары, мисалы, айлануучу шишик ДНКсы, клеткасыз митохондриялык ДНК, канда эркин айлануучу клеткасыз түйүлдүктүн ДНКсы, ал эми шишик ДНКсы канда айлануучу фрагменттелген шишиктен алынган ДНК. Ошентип, бул клеткасыз ДНК менен айлануучу шишик ДНКсынын ортосундагы айырманы жалпылайт.
