Сигма фактору менен rho факторунун негизги айырмасы бул сигма фактору бактерияларда транскрипцияны баштоо үчүн зарыл болгон протеин, ал эми rho фактору бактерияларда транскрипцияны токтотуу үчүн зарыл болгон белок.
Сигма фактору жана rho фактору бактериялык транскрипция үчүн эки маанилүү фактор болуп саналат. Бактериялык транскрипция – бул бактериялык ДНКнын бир бөлүгү мРНКнын жаңыдан жасалган тилкесине (кабарчы РНК) көчүрүлгөн процесс. Бул процесс РНК полимераза деп аталган фермент тарабынан катализделет. Бактериялар айлана-чөйрөгө туура жооп берүү үчүн транскрипцияга жана котормого таянышат. Бактериялык РНК полимераза өзөктөн жана голоферменттик түзүлүштөн турат. Өзөктө β, β′, α жана 2ω суббирдиктери бар, ал эми голоферментте сигма фактору бар. Мындан тышкары, РНК полимеразанын rho фактору деп аталган көмөкчү фактору да бактериянын транскрипциясы үчүн абдан маанилүү.
Сигма фактору деген эмне?
Сигма фактору же өзгөчөлүк фактору – бактерияларда транскрипцияны баштоо үчүн зарыл болгон белок. Бул бактериялык транскрипцияны баштоо фактору. Бул фактор транскрипция учурунда РНК-полимераза ферментинин ДНКнын промотордук аймак деп аталган белгилүү бир аймагы менен байланышын камсыздайт. Сигма фактору, адатта, археалдык транскрипция фактору В жана эукариоттук транскрипция фактору TF11B менен гомолог болуп саналат. Мындан тышкары, белгилүү бир гендин өзгөчө сигма фактору генге жана айлана-чөйрөнүн сигналдарына жараша өзгөрөт. Промоторлор РНК полимеразасы тарабынан ага байланышкан сигма факторуна жараша тандалат.
01-сүрөт: Сигма фактору
Сигма факторун пластиддик-коддолгон полимеразанын (ПЭП) бир бөлүгү катары өсүмдүктөрдүн хлоропластында да табууга болот. Сигма фактору жана РНК полимераза жалпысынан РНК полимераза голоэнзими деп аталат. Сигма факторунун молекулярдык салмагы болжол менен 70 кДа. Транскрипция башталгандан кийин сигма фактору комплекстен ажырайт. Андан кийин РНК полимеразы транскрипция аяктаганга чейин созула берет.
Ро фактор деген эмне?
Ро фактор - транскрипцияны токтотууга катышкан прокариоттук белок. Rho фактору, адатта, транскрипция терминаторунун тыныгуу сайтына байланышат. Бул сайт цитозинге бай гуаниндин начар ырааттуулугу боюнча ачык окуу алкагынын жанындагы бир тилкелүү РНКнын ачык аймагы. Бул прокариоттордо маанилүү транскрипция белок болуп саналат. Escherichia coliде rho фактору болжол менен 274,6 кДа окшош суббирдиктердин гексамерине барабар. Ар бир суббирдиктин РНКны байланыштыруучу домени жана ATP гидролизинин домени бар. Мындан тышкары, rho факторунун функциясы - спираль активдүүлүгү.
02-сүрөт: Rho фактор
Ро фактору РНК молекуласы менен байланышат, андан кийин РНК молекулаларын которуу үчүн энергия менен камсыз кылуу үчүн анын ATPase активдүүлүгүн колдонот. Rho фактору транслокацияны РНК-ДНКнын спиралдуу аймагына жеткенге чейин ишке ашырат, ал жерде гибриддик (РНК-ДНК) дуплекстүү структураны ачат. Бул процесс транскрипция процессин токтотуучу жерде РНК полимеразаны тындырат.
Сигма фактору менен Rho факторунун кандай окшоштуктары бар?
- Сигма фактору жана rho фактору бактериялардын транскрипциясы үчүн эки маанилүү фактор болуп саналат.
- Экөө тең прокариоттордо гана бар.
- Алар аминокислоталардан турган белоктор.
- Экөө тең нуклеиндик кислоталарды байланыштыруучу белоктор.
- Прокариоттор өзгөчө протеиндерди түзө турган мРНКны түзүү жана алардын айлана-чөйрөгө өзгөчө жооп кайтаруусуна жардам берүү үчүн ушул факторлорго катуу таянышат.
Сигма фактору менен Rho факторунун ортосунда кандай айырма бар?
Сигма фактору - бактерияларда транскрипцияны баштоо үчүн зарыл болгон протеин, ал эми rho-фактор - бактерияларда транскрипцияны токтотуу үчүн керектүү белок. Ошентип, бул сигма фактору менен rho факторунун ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, сигма фактору ДНКны байланыштыруучу протеин, ал эми rho фактору РНКны байланыштыруучу протеин.
Төмөнкү инфографикада сигма фактору менен rho факторунун ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача – Сигма факторуна каршы Rho фактор
Транскрипция – бул ДНКдагы маалыматтын mRNA (кабарчы РНК) деп аталган жаңы молекулага көчүрүлгөн процесси. Бул м-РНК акыры белгилүү бир протеинди өндүрүүгө катышат. Сигма фактор жана rho фактор бактериялык транскрипция үчүн эки маанилүү фактор болуп саналат. Алар белоктор. Сигма фактору бактерияларда транскрипциянын башталышына катышат. Rho фактор бактериялардагы транскрипцияны токтотуу үчүн жооптуу. Ошентип, бул сигма фактору менен rho факторунун ортосундагы айырманын корутундусу.
