РНК полимераза өзөгү менен холоферменттин негизги айырмасы РНК полимераза өзөгү сигма фактору жок фермент, ал эми РНК полимераза голоэнзими сигма факторунан турган фермент.
Бактериялардагы транскрипция – бул бактериялык ДНКнын сегменти РНК полимераза ферментинин жардамы менен жаңы синтезделген mRNA тилкесине көчүрүлгөн процесс. Бул процесс үч негизги этапта ишке ашат: инициация, узартуу жана бүтүрүү. Бактериялык РНК полимераза 6 суббирдиктен турат. РНК полимераза өзөгү β, β′, α2 жана ω суббирдиктеринен турат. Бул РНК-полимераза өзөгү голоферментке σ (сигма) фактору негизги фермент менен байланышканда айланат. РНК полимераза өзөгү жана холофермент бактериялык РНК полимераза ферментинин эки формасы болуп саналат.
РНК полимераза өзөгү деген эмне?
РНК-полимераза өзөгү – сигма фактору жок бактериялык транскрипцияга катышкан фермент. Ал β, β′, α2 жана ω деп белгиленген 5 суббирдиктен турат. Бул фермент бактериялык жана фагдык ДНК промоторлорунан спецификалык транскрипцияны баштабайт. Себеби, ал кандайдыр бир конкреттүү бактерия же фаг ДНК промоутерлерин тааныбайт. Бирок, бул фермент РНКны спецификалык эмес инициация тизмегинен транскрипциялоо мүмкүнчүлүгүн сактап калат. Мындан тышкары, бул ферментке сигма факторунун кошулушу ферментке белгилүү бактериялык жана фагдык промоутерлерден РНК синтезин баштоого мүмкүндүк берет. РНК-полимераза өзөк ферментинин молекулярдык салмагы болжол менен 400 кДа.
01-сүрөт: РНК полимераза өзөгү
Негизги фермент РНК полимеразанын каталитикалык касиеттерин камтыйт. α суббирдиги 36,5 кДа өлчөмүндөгү гомодимер. Бул rpoA гени тарабынан коддолгон. Бул суббирдиктин функциялары RNAP жыйыны, ДНК менен өз ара аракеттенүү жана транскрипцияны жөнгө салуу үчүн транскрипция факторлору. Β суббирдиги 150,4 кДа өлчөмүндө. Бул rpoB гени тарабынан коддолгон. Бул суббирдиктин функциялары: ДНК менен РНКны байланыштыруу, РНК синтези, NTP менен байланышуу, RMP менен байланышуу сайты жана σ факторун байланыштыруу. β′ суббирдиги 155 кДа өлчөмүндө жана rpoC гени менен коддолгон. Бул суббирдиктин функциялары: ДНКны байланыштыруу, РНК синтези, каталитикалык Mg2+ координация, ppGpp 1-байланыш сайты жана σ фактору. Мындан тышкары, ω факторунун өлчөмү 10,2 кДа жана rpoZ гени менен коддолгон. ω факторунун функциясы - RNAP бүктөлүүчү жана ppGpp байланыш сайты 1.
РНК полимераз голофермент деген эмне?
РНК полимераза голофермент β, β′, α2 жана ω суббирдиктеринен башка сигма фактору деп аталган белгилүү бир компоненттен турат. Сигма факторунан улам РНК полимераза голоэнзими промоутерлерди тааный алат. Сигма фактору ошондой эле РНК-полимераза голоферментинин туура жайгаштырылышына жана башталгыч жерде бошонуусуна жардам берет. Сигма фактору өзүнүн талап кылынган жана өзгөчө функциясын аткаргандан кийин, РНК полимераза голоферментинен ажырайт, ал эми РНК полимеразанын каталитикалык бөлүгү (β, β′, α2 жана ω) ДНКда калып, транскрипцияны улантат.
02-сүрөт: РНК полимераз голоэнзим
Сигма факторлорунун саны бактериялардын түрлөрүнө жараша өзгөрөт. E. coli жети сигма факторуна ээ. Мындан тышкары, сигма факторлор мүнөздүү молекулярдык салмактары менен айырмаланат. Мисалы, σ70 молекулярдык салмагы 70 кДа болгон сигма фактору. Ар кандай сигма факторлору ар кандай экологиялык шарттарда бактериялар тарабынан колдонулат. Ар кандай σ факторлордун мисалдары төмөнкүлөрдү камтыйт; σ19, σ24, σ18, σ32, σ38 жана σ54
РНК полимераза ядросу менен голоферменттин кандай окшоштуктары бар?
- РНК полимераза өзөгү жана холофермент бактериялык РНК полимераза ферментинин эки формасы.
- Эки форма тең бактериялык транскрипцияга катышат.
- Алардын суббирдиктери бар.
- Алар аминокислоталардан турган белок молекулалары.
РНК полимераз өзөгү менен Холоферменттин ортосунда кандай айырма бар?
РНК полимераза өзөгү сигма фактору жок фермент, ал эми РНК полимераза голоэнзими сигма факторунан турган фермент. Ошентип, бул РНК полимераза өзөгү менен голоэнзимдин ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, РНК полимеразынын өзөгү негизинен транскрипциянын узартуу баскычына катышат, ал эми РНК полимераза голоэнзими негизинен транскрипциянын башталгыч баскычында катализдейт.
Төмөнкү инфографикада РНК-полимераза өзөгү менен голоферменттин ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – РНК Полимераз өзөгү менен Холоэнзим
Бактериялык РНК полимераза – көп суббирдик ДНКга көз каранды фермент. Ал бактериялардын транскрипциясына катышат. Бул ген экспрессиясынын негизги ферменти жана жөнгө салуу максаты болуп саналат. РНК полимераза өзөгү жана холоэнзим бактериялык РНК полимераза ферментинин эки түрү болуп саналат. РНК полимеразанын өзөгүндө сигма фактору жок, ал эми РНК полимераза голоферментинде сигма фактору бар. Демек, бул РНК полимераза өзөгү менен голоферменттин ортосундагы айырманы кыскача көрсөтөт.
