SnRNA менен snoRNAнын негизги айырмасы snRNA пре-мРНКнын альтернативалуу сплайсинациясын камтыйт, ал эми snoRNA рРНКны жана тРНКны модификациялоону, мРНКны редакциялоону жана геномду басып чыгарууну камтыйт.
Чакан РНК 200дөн аз нуклеотидден турган полимердик РНК молекулалары. Алар, адатта, коддолбогон. Алар сигналдарды өткөрүү үчүн кабарчы РНКлар арасында бар. Кичинекей РНКлар РНКга көз каранды РНК полимеразанын аракети менен өндүрүлгөн кемчиликсиз эки тилкелүү РНКдан келип чыгат. Чакан РНКлар клетканын дифференциациясында, өсүүдө жана көбөйүүдө, апоптоздо, зат алмашууда, миграцияда жана коргонууда маанилүү роль ойнойт. Ошондуктан, кичинекей РНКлар өнүгүүнүн жана физиологиянын маанилүү жана критикалык жөнгө салуучулары болуп саналат. Чакан ядролук РНК жана кичинекей нуклеолдук РНК - кичинекей РНК молекулаларынын эки классы.
SnRNA деген эмне?
Чакан ядролук РНК же snRNA - эукариоттук клеткалардын ядросунда табылган кичинекей РНК молекулаларынын классы. СнРНКнын орточо узундугу болжол менен 150 нуклеотидди түзөт. РНК полимераза II же РНК полимераза III snRNA транскрипциясы. snRNAнын негизги функциясы ядродогу кабарчыга чейинки РНКны иштетүү. Алар ошондой эле транскрипция факторлорун же РНК полимераза IIди жөнгө салууга жана теломерлерди кармап турууга жардам берет.
01-сүрөт: Чакан РНКнын аракет механизми
Жалпы ырааттуулук өзгөчөлүктөрүнө жана РНКны байланыштырган LSm протеин сыяктуу протеиндик факторлорго негизделген snRNAнын эки классы бар. Эки класс Sm-класс snRNA жана Lsm-класс snRNA болуп саналат. Sm классындагы snRNA U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 жана U12 жогорку уридин мазмунунан турат. РНК полимераза II SM классындагы snRNAны транскрипциялайт. СнРНКга чейинки транскрипциядан кийин алар, адатта, ядродо 7-метилгуанозин 5' капкагын алышат. Андан кийин алар андан ары иштетүү үчүн ядролук тешикчелер аркылуу цитоплазмага чыгарылат. Lsm классындагы snRNA U6 жана U6atac жогорку уридин мазмунуна ээ. РНК полимераза III Lsm классындагы snRNAны транскрипциялайт жана ал ядродон чыкпайт. Адамдын эң кеңири таралган snRNA компоненттери: U1 сплицеосомдук РНК, U2 сплицеосомдук РНК, U4 сплицеосомдук РНК, U5 сплицеосомдук РНК жана U6 сплайцеосомдук РНК.
SnoRNA деген эмне?
Кичинекей нуклеолдук РНК же snoRNA - рибосомалык РНК, трансфер РНК жана кичинекей ядролук РНК сыяктуу башка РНКдагы химиялык модификацияларды жетектеген кичинекей РНК молекулаларынын классы. Ар бир snoRNA молекуласы өзгөртүү процессинде РНК/белок комплексиндеги төрт негизги белоктор менен байланышкан. СноРНКда 10-20 нуклеотидден турган антисенстик элемент бар. Бул негиздер РНКга чейинки молекуладагы модификацияны бутага алган нуклеотиддерди курчаган ырааттуулукту толуктап турат.
02-сүрөт: Кичинекей ядролук РНК
СноРНКнын эки классы бар. Алар C/D кутучасы snoRNA жана H/ACA кутучасы snoRNA. C/D кутучасы snoRNA метилденүү менен, ал эми H/ACA кутучасы snoRNA псевдоуридилденүү менен байланышкан. Ар бир snoRNA молекуласы максаттуу РНКдагы бир же эки модификация үчүн жетектөөчү ролду ойнойт. C/D кутучасы snoRNA эки кыска сакталган ырааттуулук мотивдерин камтыйт, тиешелүүлүгүнө жараша snoRNAнын 5' жана 3' учуна жакын. 5 нуклеотидден турган кыска аймактар С кутусунун өйдө жагында жана D кутучасынын ылдый жагында жайгашып, өзөк кутучасынын түзүлүшүн түзөт. Бул C жана D кутучаларынын мотивдерин жакыныраак кылат. СноРНКнын туура синтези жана ядролук локализация үчүн өзөк-куту түзүлүшү маанилүү. H/ACA кутучасы snoRNA эки чач тактайчасынан жана эки бир жиптүү аймактардан турган экинчи структурага ээ. Бул, адатта, hairpin-ілмек-чачка-куйрук структурасы катары белгилүү. H/ACA кутучасы snoRNA да сакталган эки H жана ACA мотивинен турат. Экөө тең бир катарлуу аймактарда жайгашкан. H кутусу шарнирде, ал эми ACA куйрук аймагында. Үч нуклеотид тизмектин 3' учунун түзөт.
SnRNA менен snoRNAнын кандай окшоштуктары бар?
- snRNA жана snoRNA кичинекей РНКлар.
- Экөө тең эукариоттук клеткаларда бар.
- Экөө тең коддолбогон РНК молекулалары.
- Андан тышкары, алар транскрипция процессинде РНКны өзгөртүүгө катышат.
SnRNA менен snoRNAнын ортосунда кандай айырма бар?
snRNA пре-мРНКнын альтернативдик сплайсингине катышат, ал эми snoRNA негизинен РНК молекулаларын өзгөртөт. Ошентип, бул snRNA жана snoRNA ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, snRNAs узундугу болжол менен 150 нуклеотиддерди түзөт жана көп учурда кичинекей ядролук рибонуклеопротеиддер деп аталган белоктордун жана комплекстердин тобу менен байланышкан. snoRNAs узундугу болжол менен 60-170 нуклеотидди түзөт жана алар негизинен ядродо кездешет.
Мындан тышкары, snRNAs РНК полимераза II же РНК полимераза III аркылуу транскрипцияланат, ал эми snoRNA РНК полимераза II тарабынан гана транскрипцияланат.
Төмөнкү инфографикада snRNA менен snoRNAнын ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – snRNA vs snoRNA
snRNA жана snoRNA кичинекей РНК молекулаларынын класстары. snRNA пре-мРНКнын альтернативдик сплайсингине катышат, ал эми snoRNA негизинен РНК молекулаларын өзгөртөт. Ошентип, бул snRNA жана snoRNA ортосундагы негизги айырма. Чакан РНК узундугу 200дөн аз нуклеотидден турган жана адатта коддолбогон полимердик РНК молекулалары. snRNAs эукариоттордун ядросунда кездешет. сноРНКлар археяларда жана эукариоттордо кездешет. СнРНКнын транскрипциясы РНК полимераза II жана II аркылуу ишке ашат, ал эми сноРНКны транскрипциялоого РНК полимераза II гана катышат. Демек, бул snRNA менен snoRNAнын ортосундагы айырманы жалпылайт.
