Полисома профилин түзүү менен рибосома профилин түзүүнүн ортосундагы негизги айырма, полисома профили которуу учурунда рибосоманы да, мРНКны да (полисома) колдонуу менен рибосоманын жүрүм-турумун талдайт, ал эми рибосоманын профили которуу учурунда mRNA ырааттуулугун колдонуп гана рибосоманын жүрүм-турумун талдайт.
Которуу - мРНКдагы маалыматты аминокислота ырааттуулугуна айландыруучу протеин синтезинин экинчи фазасы. Транслатомика – бул организмдин клеткасында активдүү которулган ORF (ачык окуу рамкалары) жөнүндө изилдөө. Полисома жана рибосома профилдөө ыкмалары - бул молекулярдык биология тармагында транслатомду талдоо контекстинде ар кандай параметрлерди баалоо жана корутундулоо ыкмаларынын эки түрү.
Полизомдук профилдөө деген эмне?
Полисома профили - бул рибосоманын да, мРНКнын да (полисома) жүрүм-турумун талдоо жолу менен белгилүү бир мРНКнын котормо статусун аныктаган ыкма. Башка сөз менен айтканда, бул ыкма рибосомалар менен mRNAs бирикмеси боюнча маалыматтарды жана корутундуларды берет. Полисома которуунун узартуу фазасында бар мРНКга байланышкан рибосомалардын тобун билдирет.
01-сүрөт: Полисома профилин түзүү
Полисома профилин түзүү үчүн клетка лизаты талап кылынат, ал андан кийин центрифугаланат. Андан кийин центрифугаланган үлгү рибосомалардын кичине жана чоң суббирдиктерин жана полисоманын пайда болушуна катышкан тиешелүү мРНКны мүнөздөш үчүн алардын тыгыздыгына жараша бөлүнөт. Мындан тышкары, процесс оптикалык тыгыздыкты өлчөөнү камтыйт. Эксперттер полисома профилин түзүшү керек.
Polysome профилин түзүү ыкмасы көптөгөн колдонмолор үчүн маанилүү курал болуп саналат. Окумуштуулар бул ыкманы клеткалардагы которуунун даражасын изилдөө үчүн колдонушат. Тагыраак айтканда, бул жеке белокторду жана алардын спецификалык мРНКларын изилдөө боюнча так маалымат берүү үчүн курал. Белгилүү бир мРНКнын которулуу даражасын изилдөөнүн контекстинде полисоманы профилдөө ыкмасы өтө маанилүү. Бул жерде мРНКнын 3' жана 5' ырааттуулугун алардын өндүрүлгөн мРНКнын көлөмүнө жана которуу деңгээлине тийгизген таасирине шилтеме кылуу менен изилдөөгө болот.
Рибосома профилин түзүү деген эмне?
Рибосоманын профилин түзүү - которуу учурунда рибосоманын анын мРНКсына карата жүрүм-турумун анализдөөчү ыкма. Бул ыкманы Джоан Стейц жана Мэрилин Козак таап, иштеп чыгышкан. Кийинчерээк бул технология эки илимпоз Николас жана Джонатан тарабынан кийинки муундагы секвенирлөө менен айкалышып, андан ары өнүккөн, бул Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) методологиясы сыяктуу ар кандай байланышкан техникалардын өнүгүшүнө алып келген.
02-сүрөт: Рибосомалардын тизилиши
Рибосома профилин түзүү процедурасы мРНКны изоляциялоону, рибосомалар менен байланышпаган РНКны жок кылууну жана рибосомаларга байланышкан мРНКны бөлүүнү камтыйт. Бул процедурадан кийин мРНК изоляты тескери транскрипцияланат жана кДНК синтези ишке ашат. Акырында, иРНКга карата рибосоманын жүрүм-турумунун мүнөздөмөлөрүн чыгаруу үчүн ырааттуулук маалыматтарын котормо профилине дал келтирсе болот.
Рибосомалардын профили көптөгөн изилдөөчүлөргө котормонун башталгыч жерлеринин ордун, клеткадагы же кыртыштагы которулган ачык окуу алкактарынын (ORFs) толуктоосун, mRNAдагы рибосомалардын бөлүштүрүлүшүн жана ылдамдыгын аныктоого жана жыйынтык чыгарууга жардам берет. рибосомаларды которуу. Рибосоманын профилин түзүү рибосоманын изи же Ribo Seq. катары да белгилүү
Полисома профилин түзүү менен рибосома профилин түзүүнүн кандай окшоштуктары бар?
- Полисома жана рибосома профилин түзүү - изилдөөдө маанилүү молекулярдык биологиялык ыкмалар.
- Алар котормо процесси боюнча маалымат беришет.
- Профиль түзүү процесси тең котормону талдоо аркылуу маалымат берет.
- Так натыйжалар үчүн эки ыкманы тең аткаруу үчүн кесипкөй эксперттер керек.
- Биоинформатика куралдары эки техникада тең маанилүү роль ойнойт.
Полисома профилин түзүү менен рибосома профилин түзүүнүн ортосунда кандай айырма бар?
Полисома профили котормо учурунда рибосоманы да, mRNA (полисома) менен да рибосоманын жүрүм-турумун талдайт, ал эми рибосома профили которуу учурунда mRNA ырааттуулугун колдонуу менен гана рибосоманын жүрүм-турумун талдайт. Ошентип, бул полисомдук профилдөө менен рибосома профилинин ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, полисомаларды профилдөө тыгыздык градиентинин центрифугасы жана оптикалык тыгыздыкты өлчөө сыяктуу ыкмаларды камтыйт, ал эми рибосома профили mRNA экстракциясын жана секвенирлөө ыкмаларын камтыйт. Ошондой эле, рибосоманын профили полисоманын профилине караганда такыраак.
Төмөнкү инфографикада полисома менен рибосоманын ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Корытынды – Полисома профилин түзүү жана рибосома профилин түзүү
Котормо - бул протеин синтезинин экинчи фазасы, мРНК ырааттуулугу жөнүндө маалыматты аминокислота ырааттуулугуна айландырууну камтыйт. Бул процесс мРНК шаблонун, рибосомаларды, аминокислоталарды, тРНКны жана башка факторлорду талап кылат. Полисома жана рибосома профили эки молекулярдык ыкма. Полисома профили которуу учурунда рибосоманы да, мРНКны да (полисома) колдонуу менен рибосоманын жүрүм-турумун талдайт, ал эми рибосоманын профили которуу учурунда mRNA ырааттуулугун колдонуу менен гана рибосоманын жүрүм-турумун талдайт. Полисома профилин түзүү тыгыздык градиентти центрифугалоо жана оптикалык тыгыздыкты өлчөө сыяктуу ыкмаларды камтыйт. Рибосома профилин түзүү мРНКны экстракциялоо, кДНК синтези жана секвенирлөө сыяктуу ыкмаларды камтыйт. Ошентип, бул полисома профилин түзүү менен рибосома профилин түзүүнүн ортосундагы айырманы жалпылайт.
