Негизги айырмасы – горизонталдуу жана вертикалдуу гель электрофорез
Гель электрофорези – бул генетикада ДНК, РНК жана башка белокторду камтыган аралашмаларды тиешелүү зарядына жана молекулалык өлчөмүнө жараша бөлүү үчүн колдонулган лабораториялык ыкма. Бул ыкмада бөлүнүшү керек болгон ДНК, РНК же белоктор кичинекей тешикчелерди камтыган гелден өткөрүлөт. Молекулалар электр талаасы аркылуу гел аркылуу айдалат. Молекулалар гелдин тешикчелери аркылуу өтөт жана кыймылдын ылдамдыгы алардын узундугуна тескери пропорционалдуу. Демек, молекулярдык көлөмү төмөн болгон молекулалар молекулалык салмагы жогору молекулаларга караганда ылдамыраак кыймылдайт. Электр талаасы гелдин эки учундагы заряддын айырмасынан пайда болот. Бир учунда оң заряд, экинчи учунда терс заряд бар. ДНК жана РНК молекулалары терс заряддуу болгондуктан, гелдин оң заряддуу учуна тартылышат. Гель электрофорез эки түрдүү болушу мүмкүн: горизонталдуу гел электрофорез жана вертикалдуу гел электрофорез. Горизонталдык гель электрофорезинде гел горизонталдуу ориентацияда болот жана гел кутучасынын ичинде болгон үзгүлтүксүз иштеп жаткан буферге батып кетет. Вертикалдык гель электрофорезинде буфердик система вертикалдуу багытталган жана үстү жагында жана ылдый жагында тиешелүүлүгүнө жараша катод жана анод бар эки камера менен үзгүлтүккө учурайт. Бул горизонталдуу жана вертикалдуу гель электрофорезинин негизги айырмасы.
Горизонталдык гель электрофорез деген эмне?
Горизонталдык гель электрофорези ДНКны, РНКны же белок молекулаларын тиешелүү молекулярдык чоңдукка жана зарядга жараша бөлүү үчүн негизги теорияны колдонот. Бул ыкмада гель горизонталдуу багытта болот жана үзгүлтүксүз болгон буферге батып турат. Агароз гели гел кутучасын эки бөлүмгө бөлүү үчүн колдонулат. Гель кутусунун бир учунда анод, экинчи учунда катод бар. Ток колдонулганда, бул техникада колдонулган буфер заряддын градиентин түзүүгө мүмкүндүк берет. Зарядка колдонулганда гел ысып кетет. Буфер температураны оптималдуу деңгээлде кармап турган муздаткыч катары да иштейт. Иштеп жаткан буферди рециркуляциялоо рН градиентинин пайда болушуна жол бербейт. Үзгүлтүксүз буфердик системаны горизонталдуу гель электрофорезинде колдонууга болбойт, анткени гел системасынын эки бөлүмү иштеп жаткан буфер менен туташат. Акриламид гелдик электрофорез учурунда протеин аралашмасын бөлүү үчүн колдонулат.
01-сүрөт: Горизонталдык гель электрофорез
Горизонталдык гель электрофорезинде акриламидди колдонууга болбойт, анткени гел кутучасы кычкылтектин таасиринде болот. Кычкылтектин болушуна байланыштуу акриламиддин полимеризациясы тоскоол болот жана бул гелдин пайда болушуна тоскоол болот. Горизонталдык гель электрофорези ДНК менен РНКны бөлүүдө колдонулган оңой ыкма.
Вертикаль гель электрофорез деген эмне?
Вертикаль гель электрофорез ыкмасы гел электрофорезинин негизги теориясына ылайык иштейт, бирок ал горизонталдуу гел электрофорез ыкмасына караганда татаалыраак деп эсептелет. Бул техника үзгүлтүксүз буферди колдонот. Үстүнкү камерада катод, ал эми астыңкы камерада анод жайгашкан. Ар бир бөлүмдө бар электроддор талап кылынган электр талаасын камсыз кылат. Эки орнотулган айнек плиталардын ортосуна жука катмар гель куюлат. Демек, гелдин үстүнкү бөлүгү үстүнкү камерага, ал эми гелдин астыңкы бөлүгү ылдый жагындагы камерага батат. Ток колдонулгандан кийин буфердин кичине бөлүгү гел аркылуу үстүнкү камерадан төмөнкү камерага жылат. Бул техникада колдонулган ток мүнөттүк бирдиктер.
02-сүрөт: Вертикалдык гелдик электрофорез
Виктик гель электрофорезинде буфер гел аркылуу гана агып өтөт. Бул бөлүү стадиясында чыңалуу градиентин так башкарууга мүмкүндүк берет. Акриламиддик гелди колдонсо болот, анткени отсектерге атмосфералык кычкылтек тийбейт. Акриламиддик гелдин тешикчелеринин көлөмү кичирээк болгондуктан, аны так бөлүүгө жогорку чечим менен жетишүүгө болот.
Гелдик электрофорездин горизонталдуу жана вертикалдуу кандай окшоштуктары бар?
- Эки система тең гел электрофорезинин негизги теориясына ылайык иштейт.
- Анод жана катод эки системада тең керектүү электр талаасын камсыз кылуу үчүн колдонулат.
Гелдик электрофорездин горизонталдуу жана вертикалдуу ортосунда кандай айырма бар?
Горизонталдык vs Вертикалдык гель электрофорез |
|
| Горизонталдык гель Электрофорез – гелдин горизонталдуу багытында жайгашкан гел электрофорез ыкмасы. | Вертикалдык гель Электрофорез – гел вертикалдуу багытталган гел электрофорез ыкмасы. |
| Буфер | |
| Горизонталдык гель электрофорези үзгүлтүксүз буферден турат. | Тик гель электрофорезинде иштеп жаткан буфер үзгүлтүксүз. |
| Акриламидди колдонуу | |
| Акриламидди горизонталдык гел электрофорези үчүн колдонууга болбойт, анткени гел кутучасы атмосфералык кычкылтектин таасиринде болот. | Гель эки өзүнчө камерадан улам атмосфералык кычкылтектин таасирине кирбегендиктен, акриламидди вертикалдуу гел электрофорези үчүн колдонсо болот. |
| Функция | |
| Горизонталдык гель электрофорези көбүнчө ДНК менен РНК аралашмаларын бөлүү үчүн колдонулат, бирок белокторду эмес. | Вертикалдык гель электрофорези белоктун аралашмаларын бөлүү үчүн колдонулат. |
Кыскача маалымат – Горизонталдуу vs Вертикалдык гель электрофорез
Гель электрофорези – бул ДНК, РНК жана белоктордун молекулаларын камтыган аралашмаларды бөлүүдө кеңири колдонулган лабораториялык ыкма. Гель электрофорезинин эки ыкмасы бар: горизонталдуу жана вертикалдуу гель электрофорези. Горизонталдуу гель электрофорезинде иштеп жаткан буфер үзгүлтүксүз, ал эми вертикалдуу гель электрофорезинде үзгүлтүксүз болот. Бул горизонталдуу жана вертикалдуу гел электрофорездин ортосундагы айырма. Эки система тең гел электрофорезинин жалпы принцибине ылайык иштешет.
Горизонталдык vs Вертикалдык гель электрофорезинин PDF версиясын жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, шилтеме эскертүүсүнө ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз: Горизонталдык жана Вертикалдык гель электрофорезинин ортосундагы айырма.
