Максаттуу жана максатсыз протеомиканын негизги айырмасы - максаттуу протеомика белгилүү бир белоктун көптүгүн өлчөөгө багытталган, ал эми максатсыз протеомика белгилүү бир протеинди бутага албайт.
Протеомика белокторду, алардын структураларын жана функцияларын масштабдуу изилдөө. Белгилүү шарттарда бир клеткадагы, ткандагы же организмдеги бүт протеин толуктоосун изилдейт. Протеомиканын максаттуу протеомика жана максатсыз протеомика сыяктуу эки түрү бар.
Максаттуу протеомика деген эмне?
Атынан көрүнүп тургандай, максаттуу протеомика талдоо үчүн белоктордун татаал аралашмасындагы белгилүү бир протеинге же пептидге багытталган. Андан кийин ал алдын ала тандалган белгилүү бир протеиндин бар экендигин жана санын талдайт. Бул ыкма бир гана үлгү үчүн же бир нече үлгүлөр боюнча мүмкүн. Бул ыкма белоктордун белгилүү бир тобуна да ылайыктуу. Бул так, сандык жана сезимтал маалыматтарды берет. Мындан тышкары, масс-спектрометрия максаттуу протеомика менен бирге так ишенимдүү өлчөөлөрдү чыгарат. Бул ыкма талдоо үчүн үч тараптуу төрт полюстүү масс-спектрометрди (QQQ) колдонот.
01-сүрөт: Протеомика
Максаттуу протеомика, эгер сиз бутага чындап кулатылганын текшергиңиз келсе же кандын сывороткасындагы, мээ суюктугундагы же клетка лизатындагы белгилүү бир белоктун/пептиддин санын аныктоону кааласаңыз, ылайыктуу метод. Белгилүү бир белоктун үлгүлөр боюнча дифференциалдуулугун текшергиңиз келсе же убакыт курсу боюнча эксперимент учурунда колдонуңуз.
Максатсыз протеомика деген эмне?
Максатсыз протеомика, аты айтып тургандай, аны талдоо үчүн белгилүү бир протеинге же пептидге багытталган эмес. Ачылыш протеомикасы - Максатсыз протеомиканын дагы бир аты. Чынында, бул көбүрөөк "глобалдык" талдоо. Жалпысынан, максатсыз протеомиканы аткаруу "бул үлгүдө же бир нече үлгүдө кандай белок же белоктор бар?" Деген суроого жооп берүү. Бул ыкма максаттуу протеомика сыяктуу сезимтал эмес. Бирок ал көптөгөн протеиндерди, анын ичинде жаңы белокторду аныктап, өлчөй алат. Максатсыз протеомика сандык жана сапаттык өлчөөлөрдү жасай алат.
Максаттуу жана максатсыз протеомиканын кандай окшоштуктары бар?
- Максаттуу жана максатсыз протеомика үлгүлөрдөгү белокторду өлчөйт.
- Алар протеом анализинде маанилүү.
- Бул ыкмалар масс-спектрометрди колдонот.
Максаттуу жана максатсыз протеомиканын ортосунда кандай айырма бар?
Биринчиден, максаттуу протеомика - бул белоктордун татаал аралашмасында белгилүү бир белоктун же пептиддин болушун жана санын аныктоо. Ал эми, максатсыз протеомика - бул белгилүү бир протеинди көздөбөстөн үлгүдөгү же үлгүдөгү протеиндердин сандык жана сапаттык изилдөөсү. Максаттуу протеомика алдын ала тандалган же максаттуу белоктор менен аткарылат, ал эми максатсыз протеомика бул үлгүдөгү протеиндердин түрлөрүн билүү үчүн жүргүзүлөт. Андан тышкары, максаттуу протеомика максатсыз протеомикага караганда сезгич.
Корытынды – Максаттуу жана максатсыз протеомика
Кыскача айтканда, максаттуу жана максатсыз протеомика протеиндик изилдөөлөрдүн эки түрү. Алардын аттары айтып тургандай, максаттуу протеомика белгилүү бир белокту бутага алат, ал эми максатсыз протеомика белгилүү бир протеинди бутага албайт. Бул максаттуу жана максатсыз протеомиканын айырмасы.
