Негизги айырма – Геномика менен Протеомика
Геномика жана протеомика молекулярдык биологиянын эки маанилүү тармагы болуп саналат. Геном организмдин генетикалык материалы болуп саналат. Ал организмдердин генетикалык маалыматы (генетикалык коддор) менен жазылган гендерди камтыйт. Геном жөнүндө маалыматты табуу үчүн жасалган изилдөөлөр геномика деп аталат. Гендин нуклеотиддик тизмеги генетикалык код аркылуу белоктун аминокислота ырааттуулугун аныктайт. Гендер мРНКга транскрипцияланат жана мРНК керектүү протеиндерди өндүрүү үчүн которулат. Протеом организмдин жалпы протеиндерин билдирет. Клеткадагы бүт белок топтомунун өзгөчөлүктөрүн, түзүлүштөрүн, функцияларын жана экспрессияларын табуу үчүн жасалган изилдөөлөр протеомика деп аталат. Ошентип, геномика менен протеомиканын негизги айырмасы геномика организмдин гендерин изилдеген молекулярдык биологиянын бир тармагы, ал эми протеомика клеткадагы жалпы белокторду изилдеген молекулярдык биологиянын бир тармагы болуп саналат. Геномикалык изилдөөлөр организмдин гендеринин түзүлүшүн, функциясын, жайгашкан жерин, жөнгө салынышын түшүнүү үчүн маанилүү. Протеомика боюнча изилдөөлөр көбүрөөк пайдалуу, анткени белоктор клеткалардагы чыныгы функционалдык молекулалар жана чыныгы физиологиялык шарттарды чагылдырат.
Геномика деген эмне?
Геномика – организмдин бүт геномун изилдөө. Бул геномдун түзүмүн жана функциясын (организмдердин ДНКсынын толук топтомун) изилдөө үчүн рекомбинантты ДНК технологиясы, ДНК секвенциясы жана биоинформатика менен алектенген молекулярдык биологиянын маанилүү тармагы. ДНК төрт негиздерден турат жана гендин ичиндеги генетикалык маалымат организмди түзүү үчүн зарыл болгон төрт негизги тилде жазылган. Гендер белокторду жасоого жооптуу жана алар клеткада белгилүү бир белок же белоктордун топтомун жасоо боюнча көрсөтмөлөрдү алып жүрүүчү ДНК бирдиктери. Демек, гендер боюнча жүргүзүлгөн изилдөөлөр комплекстүү ооруларды, генетикалык бузулууларды, мутацияларды, маанилүү гендик жөнгө салууларды, гендер менен айлана-чөйрөнүн факторлорунун өз ара аракеттенүүсүн, ооруларды диагностикалоо, дарылоо жана дарылоо ыкмаларын иштеп чыгуу ж.б. түшүнүү үчүн абдан маанилүү. маанилүү, анткени ал бардык гендерге жана алардын өз ара аракетине жана жүрүм-турумуна кайрылат.
01-сүрөт: Геномикалык колдонуу
Протеомика деген эмне?
Протеиндер клеткаларда кездешүүчү маанилүү макромолекулалар. Алар организмде пайда болгон көптөгөн физиологиялык функциялар үчүн маанилүү. Дээрлик бардык биохимиялык реакциялар клеткалардагы белоктор тарабынан катализделет. Гендер протеиндерди өндүрүү үчүн генетикалык көрсөтмөлөр менен сакталат. Генетикалык код белгилүү бир белокту аныктаган аминокислота ырааттуулугуна айланат. Бул процесс белгилүү ген экспрессиясы. Зарыл болгондо, гендер белок катары экспрессияланат жана синтезделет. Клетканын бардык белок топтому протеом деп аталат. Клетканын протеомасын изилдөө протеомика деп аталат. Белоктордун структуралары, мүнөздөмөлөрү, өз ара аракеттенүүсү жана функциялары протеомикада протеиндердин клеткалык процесстерге кандай таасир тийгизерин изилдөө үчүн изилденет.
Организмдер клеткаларда ар кандай функцияларды аткарган миңдеген түрдүү белокторду камтыйт. Геномдук изилдөөлөр протеомикалык изилдөөлөрдү жүргүзүү үчүн негизги маалыматты камсыз кылат, анткени гендер mRNA молекулаларын коддошот жана mRNA белокторду коддойт. Протеомика изилдөөлөрү көптөгөн тармактарда маанилүү; бул өзгөчө рак биологиясында пайдалуу, мында рак ооруларына алып келген анормалдуу белокторду ачуу үчүн колдонулушу мүмкүн.
02-сүрөт: Протеин синтези
Геномика менен протеомиканын айырмасы эмнеде?
Genomiks vs Proteomics |
|
| Геномика – организмдин геномун изилдөө. Гендер геномикалык негизде изилденет. | Протеомика - клетканын бүтүндөй белокторун изилдөө. Белоктор протеомика боюнча изилденет. |
| Окуу аймактары | |
| Геномика геномдун картасын түзүү, секвенирлөө, экспрессия анализи, ген структурасын анализдөө ж.б. чөйрөсүн камтыйт. | Протеомика белоктордун мүнөздөмөсүн, белоктордун түзүлүшүн жана функциясын изилдөө ж.б. камтыйт. |
| Классификация | |
| Структуралык геномика жана функционалдык геномика деп аталган эки негизги түрү. | Структуралык протеомика, функционалдык протеомика жана экспрессия протеомикасы деп аталган үч негизги категория. |
| Окуу материалынын мүнөзү | |
| Геном туруктуу. Организмдин ар бир клеткасы бирдей гендерге ээ. | Proteome динамикалык жана өзгөрүп турат. Ар кандай кыртыштарда өндүрүлгөн белоктордун топтому гендин экспрессиясына жараша өзгөрөт. |
Кыскача – Геномика протеомика
Геномика – организмдин толук геномун изилдөө. Протеомика - молекулярдык биологиянын бир тармагы, ал белоктордун структурасын жана функциясын жана белоктордун клетка процесстерине кандай таасир тийгизерин түшүнүү үчүн клеткада туюнтулган белоктун толук топтомун изилдейт. Геномика белок синтези учурунда пайда болгон пост-трансляциялык өзгөрүүлөргө байланыштуу клеткалардын чыныгы шарттарын түшүндүрө албайт. Демек, протеомика клеткалардын чыныгы шарттарын жана функцияларын түшүнүү үчүн маанилүү. Бул геномика менен протеомиканын айырмасы.
