Негизги айырмасы – Топоизомераза I менен II
ДНК клетканын бөлүнүү жолу менен эки кыз клеткага бөлүнүшү үчүн клеткага керек. ДНК ДНК репликациясы менен копияланат. Демек, катуу жараланган спираль ДНКны кайталоо үчүн атайын механизм болушу керек. Топоизомераза - бул ДНКны белгилүү бир чекитте кесип, ДНКнын бурулушун чечип, ДНКнын суперкоюл табиятын бошоткон фермент. Бул ДНКны айлантууга жана ачууга катышкан фермент. ДНКнын ийримдүү маселеси эки тилкелүү ДНКнын чырмалышкан түзүлүшүнөн улам көтөрүлөт. ДНКнын эки эселенген тилкесинде түзүлгөн топологиялык көйгөйлөрдүн бул түрлөрү топоизомеразалар аркылуу оңдолот. Алар, адатта, ДНК фосфат омурткасын бир же эки жипти кесип, ДНКнын суперкоюл түзүмүн ачууга мүмкүндүк берет. Кийинчерээк ДНК омурткасы кайра жабылат. Бактериялык жана адамдын топоизомеразалары окшош механизмдерге ээ. Топоизомераза I жана II - бул өтө ийилген ДНК менен иштөө ыкмалары. Топоизомераза I кош тилкелүү ДНКдагы бир сапты кесип, анын иштеши үчүн АТФ талап кылынбайт. Экинчи жагынан, Топоизомераза, II ДНКдагы эки жипти тең кесип, анын активдүүлүгү үчүн ATP керек. Бул топоизомераза I менен II ортосундагы негизги айырма.
Топоизомераза I деген эмне?
Топоизомераза I – ДНКнын суперкирилишин жөнгө салуучу ферменттердин классы. Алар ДНКдагы супер ийримди бир катарлуу үзгүлтүктөрдү жаратып, ДНК тилкелерин түшүрүү менен башкарат. Алардын ролу ДНКнын репликациясы жана транскрипциясы үчүн абдан маанилүү. Алар дагы IA типке жана IB типке бөлүнөт. IA типтеги топоизомеразалар прокариоттук топоизомеразалар I деп аталат. Экинчи жагынан, IB типтеги топоизомеразалар эукариоттук топоизомеразалар I деп аталат. IA түрү жана IB түрү топоизомеразалар функциялык жактан айырмаланат. Прокариоттук топоизомераза I терс ДНКнын суперкоилдерин гана жандандыра алат. Жана эукариот топоизомераза Мен позитивдүү ДНКнын суперкойлдорун киргизе алам, ошондой эле алар репликациядан кийин кыз хромосомасынын ДНКсын бөлүп, бул ДНКны эс алдырат.
01-сүрөт: Топоизомераза I жана II
Ecoli топоизомераза I – карбоксилдик чекитке жакын тетрацистеин мотивдеринде үч Zn (II) атому бар голофермент. Анын салмагы 97 кДа. Топоизомераза I бир нече адаттан тыш өзгөчөлүктөргө ээ. ДНКнын топологиялык кайра түзүлүшүн катализдөө үчүн АТФ гидролиздөөнүн кереги жок. Топоизомераза Iнин өзгөчөлүгү - бул толук функционалдык мономер, ал эми ДНКнын татаал топологиялык кайра түзүлүшүн камтыган көпчүлүк ферменттер табияты боюнча олигомердик.
Топоизомераза II деген эмне?
ДНК чырмалышаларын жана суперкоюлдарын башкаруу үчүн II типтеги топоизомераза эки ДНК тилкесин бир эле учурда кесип салат. Алар бул иш үчүн ATP гидролиздөө керек. II типтеги топоизомераза тегерек ДНКнын байланыш санын ± 2ге өзгөртөт. Алар жалпысынан эки категорияга бөлүнөт, атап айтканда, II А түрү жана IIB түрү.
02-сүрөт: Топоизомераза II
II А топоизомеразаларына бактериялык ДНК гираза, эукариот топоизомераза II, эукариалдык вирустук топоизомераза альфа жана бета жана топоизомераза IV кирет. II В типтеги топоизомеразаларга археяларда кездешүүчү VI топоизомеразалар жана жогорку өсүмдүктөрдө кездешүүчү VI топоизомеразалар кирет. Топоизомераза IIнин функциясы бир ДНКнын кош спиралынын эки тилкесин кесип, ал аркылуу дагы бир үзүлбөгөн ДНК спиралын өткөрөт. Акыр-аягы, кесилген учтары кайра ылдыйлат. Топоизомераза II үчүн ингибитор молекулаларды Hu-331, ICRF-193 жана митиндомид катары тапса болот.
Топоизомераза I жана II ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Экөө тең суперкоюлдарды бошотууга катышат.
- Экөө тең прокариоттук организмдерде, ошондой эле эукариоттук организмдерде кездешет.
- Топоизомераза I жана II функциялары экөө тең тирүү клеткада ДНКнын туура репликациясын жана транскрипциясын сактоо үчүн абдан маанилүү.
- Экөө тең табиятта белок.
Топоизомераза I жана II ортосунда кандай айырма бар?
Топоизомераза I и Топоизомераза II |
|
| Тип I топоизомераза - бул бир катар үзүлүүлөрдү жана релегацияны пайда кылуу менен ДНКнын супер-илүү даражасын өзгөрткөн фермент. | II типтеги топоизомераза - кош тизмектердин үзүлүшүн жана сызылышын пайда кылуу менен ДНКнын супер-илүү даражасын өзгөрткөн фермент. |
| ATP Гидролиздөө | |
| Топоизомераза I функциясы үчүн ATP гидролиздөөнүн кереги жок. | Топоизомераза II өзүнүн функциясы үчүн ATP гидролизине муктаж болушу керек. |
| ДНКнын бузулушу | |
| Топоизомераза Мен бир жипти үзүп коём. | Топоизомераза II кош жипти үзөт. |
| Түзүмү | |
| Топоизомераза I - мономер. | Топоизомераза II – гетеродимер. |
| Айланма ДНКнын байланыш санын өзгөртүү | |
| Топоизомераза I тегерек ДНКнын байланыш санын 1дин бирдигине же 1ге(n) эселенген санына өзгөртүп жатат. | Топоизомераза II тегерек ДНКнын байланыш санын ±2 бирдиктерине өзгөртүүдө. |
Кыскача – Топоизомераза I vs II
Топоизомеразалар ДНКны ороп же ачууга катышкан ферменттер. Алар ДНКнын supercoils бошотот жана ДНК репликациясын жана транскрипциясын жеңилдетет. Бул энзимдерди дээрлик бардык организмдерде табууга болот, мисалы; адамдар, бактериялар, жогорку өсүмдүктөр, башка бактериялар жана археялар. Топологиялык ДНКнын кайра түзүлүшү топоизомеразалар тарабынан ишке ашырылат. ATP гидролиздөө топоизомераза I функциясы үчүн керек эмес. Топоизомераза I ДНКдагы бир сапты кесип салат. Экинчи жагынан, топоизомераза II ДНКдагы эки жипти тең кесип, алардын иштеши же активдүүлүгү үчүн ATP керек. Кийинчерээк ДНК омурткасындагы бул кесип кайра жабылат. Бактериялык жана адамдык топоизомеразалар табиятта окшош механизмдерге ээ. Бул топоизомераза I менен II ортосундагы айырма.
Topoisomerase I vs IIнин PDF версиясын жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, шилтеме эскертүүсүнө ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз Топоизомераза I жана II ортосундагы айырма
