Молекулярдык док менен скорингдин ортосундагы негизги айырма - док эки молекуланын ортосундагы байланышты аныктоо үчүн колдонулган ыкма, ал эми балл коюу - бул жагымдуу молекулалар аралык өз ара аракеттенүүлөрдүн санын эсептөө аркылуу белгилүү бир позаны баалоо процесси.
Молекулярдык док жана скоринг терминдери молекулярдык моделдөө тармагында колдонулат. Молекулярдык моделдөө - бул бир заттын ар кандай молекулаларынын мүмкүн болгон жайгашуусун аныктоо үчүн колдонулган ыкма. Бул ыкма жаңы туруктуу кошулмаларды түзүү үчүн маанилүү.
Молекулярдык док деген эмне?
Молекулярдык док – бул рецепторго байланыштыруучу талапкер лигандынын эсептөө симуляциясы. Бул ыкма туруктуу комплексти түзүү үчүн бири-бири менен байланышканда бир молекуланын экинчи молекулага артыкчылыктуу багытын болжолдойт. Бул ыкмадан алынган натыйжалар эки молекуланын ортосундагы ассоциациянын күчүн же байланыштын жакындыгын болжолдоо үчүн колдонулушу мүмкүн. Бул жерде молекулярдык балл функциясы да маанилүү.
01-сүрөт: Биологиялык системалардагы молекулалык өз ара аракеттенүү процессин көрсөткөн жөнөкөй диаграмма
Жалпысынан, бул ыкма белоктор, пептиддер, нуклеиндик кислоталар, углеводдор жана липиддер сыяктуу биологиялык тиешелүү молекулаларды карайт. Бул молекулалар абдан маанилүү жана алар биздин денебиздеги сигнал өткөрүү механизмдеринде маанилүү ролду ойношот. Демек, бул сигналды өткөрүү процесси үчүн байланыша турган эки молекуланын багыты бул жерде өндүрүлгөн сигналдын түрүнө таасир этет. Бул дегенди билдирет; молекулярдык док биологиялык системаларда сигналды өткөрүү учурунда өндүрүлгөн сигналдын күчүн да, түрүн да аныктоодо маанилүү.
Мындан тышкары, молекулярдык док ыкмалары структурага негизделген дарыларды долбоорлоодо маанилүү. Бул анын лиганддар сыяктуу кичинекей молекулалардын ылайыктуу байланыш жерине туташтыруу конформациясынын алдын ала мүмкүндүгүнө байланыштуу.
Молекулярдык балл деген эмне?
Молекулярдык балл – молекулярдык туташуунун жүрүшүн баалоодо пайдалуу математикалык функциянын бир түрү. Эсептөөчү химия тармагында баллдык функциялар док процессинен кийин эки молекуланын ортосундагы байланышты болжолдоо үчүн колдонулат. Мисалы, бизде кичинекей бир бөлүкчөнүн бир молекуласы бар болсо жана протеин сыяктуу биологиялык максаттуу болсо, биз дары-дармектин байланыштыруучу жерге жакындыгын баалай алабыз. Мындан тышкары, молекулярдык балл эки белоктун ортосундагы же бир белок менен ДНК молекулаларынын ортосундагы молекулалар аралык өз ара аракеттенүү болжолдоо үчүн колдонулушу мүмкүн.
02-сүрөт: Кыскача баалоо функциясы
Молекулярдык баллдын негизги колдонулушу дары-дармектерди долбоорлоо процесстеринде колдонулат, мисалы, виртуалдык скрининг, жаңы долбоорлоо, коргошун оптималдаштыруу ж.б.
Молекулярдык док менен баллдын ортосунда кандай айырма бар?
Молекулярдык док жана балл алуу молекулярдык моделдөөдө маанилүү. Молекулярдык док менен скорингдин ортосундагы негизги айырма - док эки молекуланын ортосундагы байланышты аныктоо үчүн колдонулган ыкма, ал эми балл алуу жагымдуу молекулалар аралык өз ара аракеттенүүлөрдүн санын эсептөө аркылуу белгилүү бир позаны баалоо процесси.
Төмөнкү инфографика молекулярдык док менен баллдын ортосундагы айырманы жалпылайт.
Кыскача маалымат – Молекулярдык док менен Скоринг
Молекулярдык док жана балл алуу молекулярдык моделдөөдө маанилүү. Молекулярдык док менен скорингдин ортосундагы негизги айырма - док эки молекуланын ортосундагы байланышты аныктоо үчүн колдонулган ыкма, ал эми балл алуу жагымдуу молекулалар аралык өз ара аракеттенүүлөрдүн санын эсептөө аркылуу белгилүү бир позаны баалоо процесси.
