ДНК менен РНК зонддорунун негизги айырмасы, ДНК зонддору максаттуу нуклеотид тизмегине кошумча болгон ДНКнын фрагменттери, ал эми РНК зонддору максаттуу тизмектердин комплементарлык нуклеиндик кислота тизмеги болгон бир тилкелүү РНКнын созулары болуп саналат.
Зонд – бул радиоактивдүү же радиоактивдүү эмес молекулалар менен белгиленүүчү ДНКнын же РНКнын жасалма синтезделген кыска ырааттуулугу. Анын узундугу 100дөн 1000ге чейин болушу мүмкүн. Зонддор зонддун ырааттуулугун толуктоочу максаттуу нуклеотиддердин ырааттуулугун аныктоодо пайдалуу. Кошулгандан кийин, зонддор кошумча тизмектер же максаттуу ырааттуулуктар менен гибридделет жана радиоактивдүүлүктү алып жүргөндүктөн, максаттуу тизмектерди аныктоо үчүн аны көрүнүктүү кылат. Зонддор көптөгөн микробдук жана молекулярдык тармактарда, мисалы, генетикалык ооруларды аныктоодо, вирусологияда, соттук-медициналык патологияда, аталыкты аныктоодо, ДНК манжа изинде, RFLP, молекулярдык цитогенетика, in situ гибриддештирүү ж.б.у.с. үчүн маанилүү молекулярдык курал болуп саналат.
ДНК зонддору деген эмне?
ДНК зонддору - бул ДНКнын бир тилкелүү узундуктары. Алар гибриддештирүү жолу менен комплементардык нуклеиндик кислота тизмегинин (максаттуу ырааттуулуктун) болушун аныктоо үчүн колдонулушу мүмкүн. ДНК зонду өзүнүн толуктоочу ырааттуулугу менен гибриддештирилгенден кийин, ал эки жиптүү гибридди түзөт. Аларды аныктоо үчүн ДНК зонддору көбүнчө радиоизотоптор, биотин, эпитоптор же флюорофорлор менен белгиленет. Биотин менен белгиленген ДНК зонддорун стрептавидин менен белгиленген щелочтук фосфатаза менен бир катар ферменттик жана химиялык ыкмалар менен аныктоого болот.
Сүрөт 01: ДНК пробу
ДНК зондунун нуклеотиддердин тизмеги белгилүү. Алар 100дөн 1000ге чейинки базалык жуптарга чейинки кыска тизмектер. Узун ДНК зонддору рекомбинантты ДНК технологиясы менен түзүлүшү мүмкүн. Алар ошондой эле ПЦР жана клондоштуруу жолу менен түзүлүшү мүмкүн. Клиникалык микробиология лабораторияларында ДНК зонддору жугуштуу ооруларды тез диагностикалоо үчүн жеткиликтүү.
РНК зонддору деген эмне?
РНК зонддору - РНКнын бир саптуу созулган бөлүктөрү. Алар үлгүдөгү максаттуу ырааттуулуктарды толуктоочу тизмектер. Алар көбүнчө ДНКнын in vitro транскрипциясы аркылуу SP6, T7 же T3 бактериофагдарынын РНК полимеразалары менен синтезделет. Узун РНК зонддору сызыктуу плазмиддик ДНКдан in vitro транскрипциясы аркылуу түзүлүшү мүмкүн. Жалпысынан алганда, РНК зонддору ДНК зонддоруна караганда, алардын толуктоочу ырааттуулугу менен күчтүү жана тыгыз байланышат. ДНК зонддору сыяктуу эле, РНК зонддору да транскрипцияланып жатканда белгилениши мүмкүн.
ДНК менен РНК зонддорунун кандай окшоштуктары бар?
- ДНК жана РНК зонддору экөө тең бир тилкелүү нуклеотид ырааттуулугу.
- Экөө тең жасалма түрдө иштелип чыккан жана синтезделген.
- Мындан тышкары, алар радиоизотоптор, эпитоптор, биотин же флюорофорлор менен белгилениши мүмкүн.
- Алардын белгилүү бир ДНК же РНК максаттуу ырааттуулугуна күчтүү жакындыгы бар.
- Алар нуклеиндик кислотанын максаттуу ырааттуулугун аныктоо үчүн ар кандай тазалоо жана in situ гибриддештирүү ыкмаларында колдонулат.
- Зонддордун эки түрү тең бири-бирин толуктоочу ырааттуулугу менен гибриддештирилиши мүмкүн.
- Алар ошондой эле микроорганизмдерди идентификациялоодо жана инфекциялык, тукум куума жана башка ооруларды аныктоодо колдонулат.
ДНК менен РНК зондунун ортосунда кандай айырма бар?
ДНК зонду – максаттуу ырааттуулукка кошумча болгон ДНКнын кыска бөлүгү. Башка жагынан алганда, РНК зонд максаттуу ырааттуулугун толуктоочу РНКнын кыска бир тилкелүү созулат. Ошентип, бул ДНК жана РНК изилдөөлөрүнүн ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, ДНК зонддорунда A, T, C жана G, ал эми РНК зонддору A, U, C жана G камтыйт.
Мындан тышкары, ДНК менен РНК зонддорунун дагы бир айырмасы алардын термодинамикалык туруктуулугу. РНК зонддору ДНК зонддоруна салыштырмалуу көбүрөөк термодинамикалык туруктуулукту көрсөтөт.
Төмөндө ДНК менен РНК зонддорунун ортосундагы маанилүү айырмачылыктар инфографика таблицаларында көрсөтүлгөн.
Кыскача маалымат – ДНК менен РНК зонддору
Зонд – молекулалык гибриддештирүү жолу менен ДНКнын же РНКнын үлгүсүндө белгилүү ырааттуулуктун бар экендигин аныктоо үчүн колдонулган ДНКнын же РНКнын кичинекей фрагменти. ДНК зонддору кыска бир тилкелүү ДНК фрагменттери, ал эми РНК зонддору кыска бир тилкелүү РНК тизмеги. Алар белгилүү тизмектер. Термодинамикалык туруктуулук РНК зонддорунда ДНК зонддоруна караганда жогору. РНК зонддору ДНК зонддоруна караганда, алардын толуктоочу ырааттуулугу менен тыгыз байланышат. Ошентип, бул ДНК менен РНК зонддорунун ортосундагы айырманы жыйынтыктайт.
