ДНК полимераза и РНК полимераза
Бул клеткалык деңгээлде орун алган ар кандай функцияларга жооптуу эки башка фермент. Негизинен ДНК жана РНК тилкелеринин түзүлүшү ушул ферменттер тарабынан жөнгө салынат. Бул макалада жашоону камсыз кылуунун көптөгөн процесстери үчүн бул өтө маанилүү ферменттердин негизги айырмачылыктары талкууланмакчы.
ДНК полимераза
ДНК полимераз ферменти өз милдетин ДНКнын репликациясы учурунда, тиешелүү нуклеотиддерди жайгаштыруу баскычында, учурдагы жана жаңы ДНК тилкелеринин тиешелүү азоттук негиздеринин ортосунда суутек байланыштарын түзө баштайт. Бул фермент ДНКнын кош спиралдуу түзүлүшү ДНК геликазы деп аталган экзонуклеаза ферменти тарабынан демонтаждалгандан же бурулгандан кийин иштей баштайт. Дезоксирибонуклеотиддердин полимеризациясы дайыма ДНК тилкесинин 3' учунан башталат. ДНК полимеразаларынын көптөгөн түрлөрү бар жана ар бир түрү протеинден турат, башкача айтканда, ал белгилүү бир фермент үчүн уникалдуу негиздер ырааттуулугун камтыйт. Адамдын ДНК полимераз чынжырларында болжол менен 900 – 1000 аминокислота бар. Адатта, репликация процессинде ДНК полимераза азоттуу негиздердин ырааттуулугун көчүрүүгө жөндөмдүү, ошондуктан бир ферменттен дагы окшош жиптерди чыгара алат. Бул ферменттин ар кандай түрдөгү өзгөрүшү анча деле байкалбайт, анткени ферменттин структурасынын каталитикалык суббирдиктери көптөгөн түрлөрдө дээрлик бирдей. Бирок, ошол кичине өзгөрүүлөрдүн негизинде A, B, C, D, X, Y жана RT деп аталган ДНК полимеразаларынын жети үй-бүлөсү аныкталган. Бул типтердин бардыгында эукариоттордо 15, прокариоттордо 5 түрдүү фермент бар.
РНК полимераза
РНК полимераза РНК тилкелеринин өндүрүшүн катализдөөчү негизги фермент болуп саналат. ДНКнын азоттуу база тизмегинин калыптары, адатта, РНКны өндүрүүгө негизделген жана бул фермент көптөгөн функцияларды аткара алат. Биринчиден, ДНК тилкесинин белгилүү бир бөлүгү (көбүнчө ген) РНК полимераза аркылуу карама-каршы тилкелердин тиешелүү негиздеринин ортосундагы суутек байланыштарын бузуу аркылуу ачылат. Андан кийин, тимин үчүн урацилди алмаштыруу менен базалык ырааттуулукту көчүрүү ДНК тилкесинин 3' учунан 5' учуна чейин ишке ашат. ДНК тилкесинин РНК полимеризациясынын башталгыч чекити промотор деп аталат, ал эми аяктоочу аягы терминатор деп аталат. Бул фермент рибонуклеотиддердин жардамы менен жипти түзгөндүктөн, РНК полимераза деген термин колдонулат. РНК полимераза кабарчы РНК, рибосомалык РНК, трансфер РНК, микро РНК жана рибозим же каталитикалык РНК сыяктуу бир катар продуктуларды чыгара алат. РНК полимераза ДНК тилкесин чечүүгө жөндөмдүү болгондуктан, кош спиралдын түзүлүшүн демонтаждоо үчүн башка ферментти талап кылбайт. Бактерияларда РНК полимераза α2, β, β' жана ω деп аталат. Бул бактериялык РНК полимеразалар бири-биринен структуралык жана функционалдык жактан бир аз айырмаланат. Функцияны күчөтүү үчүн ар кайсы жерлерде РНК полимераза менен байланышкан транскрипциялык кофакторлор бар, айрыкча E. coli сыяктуу кээ бир бактерияларда.
ДНК полимераза менен РНК полимеразанын ортосунда кандай айырма бар?
• ДНК-полимераза дезоксирибонуклеотиддерден ДНК тилкесин түзөт, ал эми РНК полимераза рибонуклеотиялардан РНК тилкелерин түзөт.
• РНК полимеразасы ДНК полимераза жасай алган функцияга салыштырмалуу көп функцияларды аткара алат.
• РНК полимераза ар кандай продуктуларды түзөт, бирок ДНК полимераза эмес.
• ДНК полимераза ДНК тилкесинин 3' учунан иштей баштайт, ал эми РНК полимераза ДНК тилкесинин 3' учунан 5' аягына чейин каалаган жеринде иштей баштайт.
