Цис менен транс сплайсингдин ортосундагы негизги айырма цис сплайсинг интрондорду жок кылуучу жана бир эле РНК транскриптинин ичиндеги экзондорду бириктирүүчү интрамолекулярдык механизм, ал эми транс-сплайсинг интрондорду же аутрондорду жок кылуучу молекулалар аралык механизм жана бир РНК транскрипциясында болбогон экзондорго кошулат.
РНК сплайсинг - протеин синтезине чейин РНКны иштетүүнүн бир түрү. Бул процессте жаңы жасалган алдын ала кабарчы РНК стенограммасы жетилген кабарчы РНКга айланат. Жетилген кабарчы РНК белок молекуласын өндүрүүгө жардам берет. РНКны бириктирүү учурунда интрондор (коддобогон аймактар) алынып салынат жана экзондор (коддоочу аймактар) жетилген мРНКны түзүү үчүн биригишет. Cis жана trans splicing - бул РНКны бириктирүү механизминин эки түрү.
Cis Splicing деген эмне?
Cis сплайсинг – интрондорду жок кылуучу жана бир эле РНК транскриптинин ичиндеги экзондорду бириктирүүчү молекула ичиндеги механизм. Кадимки cis сплайсинг бир РНК молекуласын иштетет. Cis сплайсинг - бул сплайсеосомалар тарабынан жүзөгө ашырылуучу пре мРНКнын типтүү сплайсинг процесси. Интрондо донордук участок (интрондун 5' аягы), бутак участогу (интрондун 3' учуна жакын) жана акцептордук участок (интрондун 3' аягы) сплайсинг үчүн абдан маанилүү. Кошумча донордук сайт интрондун 5' аягындагы инварианттык GU ырааттуулугун камтыйт. Интрондун 3' аягындагы сплайс акцепторунун орду инварианттык AG ырааттуулугуна ээ. AG ырааттуулугунан жогору карай пиримидиндик аймак (полипиримидиндик тракт) деп аталган аймак бар. Полипиримидиндик тракттын андан ары жогору жагында аденозин нуклеотиди камтыган тармактык чекит бар. Бул нуклеотид лариат түзүүгө катышат.
01-сүрөт: Cis жана Trans Splicing
Негизги спликосомалар U1, U2, U4, U5 жана U6. Алардын арасында U1 жана U2 абдан маанилүү. Cis сплайсингде U1 5' сплайс сайтына, ал эми U2 3' кошулган жердин жанындагы бутак чекитине байланышат. U5/U4/U6 5' сайтында экзондорду, U6 U2 менен байланыштырат. Кийинчерээк U1 чыгарылат. U5 экзондон интронго жылыйт, ал эми U6 5' кошулган жеринде байланышат. Мындан тышкары, U4 да чыгарылат. U6/U2 трансэтерификацияны катализдеп, интрон лигатынын 5' учунун интрондогу А нуклеотидине айлантат. Бул лариат пайда болушуна түрткү берет. Лариаттын пайда болушунда U5 экзонду 3' сплайс жеринде байланыштырат, ал эми 5' жери ажырайт. Жалгаштыруунун акыркы фазасында U2/U5/U6 лариятка байланып калат, ал эми 3' жери ажырайт. Мындан тышкары, экзондор бул фазада ATP гидролизинин жардамы менен байланат.
Транс Splicing деген эмне?
Транс сплайсинг – интрондорду же аутрондорду жок кылуучу жана бир РНК транскрипциясында болбогон экзондорду бириктирүүчү молекулалар аралык механизм. Транс-сплайсингде U1 протеининин байланышы үчүн mRNA алдындагы молекулада 5' сплайс жери жок. Анын ордуна, капталган сплайс лидери (SL) РНК аутрондогу ырааттуулукка кошулат.
02-сүрөт: Trans Splicing
Outron - бул 5' капкак менен транс сплайс жеринин ортосундагы алдын ала мРНКнын аймагы. Бирок, U2 протеин адатта 3' сплайс сайтына байланышат. Аутронду алып салгандан кийин, сплайс лидери (SL) экзону пре мРНКдагы биринчи экзонго кошулат. Мындан тышкары, транс-сплайсинг гендерди экспрессиялоо үчүн Kinetoplastae классынын протисттери сыяктуу кээ бир микроорганизмдерде байкалган механизм.
Cis жана Trans Splicing ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Cis жана trans splicing - бул РНКны бириктирүү механизминин эки түрү.
- Эки механизмде тең интрондор алынып салынат.
- Ошондой эле эки механизмде экзондор биригип, жетилген мРНКны түзүшөт.
- Эукариоттордо эки механизм тең кездешет.
- Бул механизмдер прокариоттордо жок.
Cis жана Trans Splicing ортосунда кандай айырма бар?
Cis сплайсинг – интрондорду жок кылуучу жана бир эле РНК транскриптинин ичиндеги экзондорду бириктирүүчү интрамолекулярдык механизм, ал эми транс-сплайсинг – интрондорду же аутрондорду жок кылуучу жана бир РНКда жок экзондорду бириктирүүчү молекулалар аралык механизм. транскрипт. Ошентип, бул cis жана trans splicing ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, цис сплайсингинде интрондор жетилген мРНКны түзүү үчүн алынып салынат. Экинчи жагынан, транс сплайсингде интрондор же аутрондор жетилген мРНКны түзүү үчүн алынып салынат.
Төмөнкү инфографикада cis жана trans splicing ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача – Cis vs Trans Splicing
РНК сплайсинг протеин синтези процессине чейин РНКны иштетүүнүн бир түрү. Cis жана trans splicing - эукариоттордо кездешкен РНКны бириктирүү механизминин эки түрү. Цис сплайсинг – интрондорду жок кылуучу жана бир эле РНК транскрипциясынын ичиндеги экзондорду бириктирүүчү интрамолекулярдык механизм, ал эми транс-сплайсинг – интрондорду же аутрондорду жок кылуучу жана бир эле РНК транскрипциясында жок экзондорду бириктирүүчү молекулалар аралык механизм. Ошентип, муну менен cis жана trans splicing ортосундагы айырманы талкуулоо аяктайт.
