Негизги айырма – I тип менен II типтеги чектөө энзими
Көбүрөөк чектөө эндонуклеаза деп аталган чектөө ферменти ДНК молекулаларын майда фрагменттерге бөлүү жөндөмүнө ээ. Бул бөлүнүү процесси ДНК молекуласын чектөөчү жер деп аталган атайын таануу жерине жакын же ошол жерде болот. А таануу сайты, адатта, 4-8 базалык жуптан турат. Бөлүнгөн жерине жараша чектөө ферменттери төрт түрдүү болушу мүмкүн; I тип, II тип, III тип жана IV тип. Рестриктаза ферменттерин төрт топко бөлүүдө бөлүнүү жеринен тышкары, курамы, ко факторлордун талабы жана максаттуу ырааттуулуктун абалы сыяктуу факторлор да эске алынат. ДНК молекуласынын ажыроо учурунда ажыраган жер чектөө жеринин өзүндө же чектөө аймагынан алыс болушу мүмкүн. ДНКнын бөлүнүү процессинде рестрикция ферменттери ДНКнын кош спиралындагы кант фосфат омурткаларынын ар бири аркылуу экиден тешик жаратат. Чектөө ферменттери негизинен Achaea жана бактерияларда кездешет. Алар бул ферменттерди басып кирген вирустарга каршы коргонуу механизми катары колдонушат. Рестриктаза ферменттери бөтөн (патогендик) ДНКны ажыратат, бирок өзүнүн ДНКсын эмес. Анын ДНКсы метилтрансфераза деп аталган фермент тарабынан корголот, ал кабыл алуучу ДНКга өзгөртүүлөрдү киргизет жана бөлүнүүнүн алдын алат. I типтеги чектөө энзими таануу аймагынан алыс жайгашкан жиктөөчү жерге ээ. II типтеги чектөө ферменттери таануу жеринин өзүндө же ага жакыныраак аралыкта бөлүнөт. Бул I тип менен II типтеги чектөө энзиминин негизги айырмасы.
Тип I чектөө энзими деген эмне?
Тип I чектөө ферменттери үч көп суббирдиктен турган пентамердик протеиндер: чектөө суббирдиги, метилдөөчү суббирдик жана ДНК ырааттуулугун таануу подбирдиги. Бул суббирдиктер окшош эмес. Алар алгач ичеги таякчасынын эки башка формасында аныкталган. Бул чектөө ферменттеринин бөлүнүүчү жери ар кандай туш келди чекиттерде, адатта таануучу жерден 1000 база жуп алыстыкта болот. Бул чектөө ферменттери активдештирүү үчүн ATP, Mg2+ жана S-adenosyl-L-метионинди талап кылат. I типтеги чектөө ферменттери метилаза жана чектөө активдүүлүгүнө ээ. Бактериялар вирустарды басып алуудан клетканы коргоо механизми катары чектөө ферменттерин колдонушат. Чектөө ферменттери вирустун ДНКсын бөлүп, аларды жок кылат. Ал эми өзүнүн ээси ДНКсынын бөлүнүшүнө жол бербөө үчүн I типтеги чектөө энзими метилден коргоону камсыз кылат. Бул кабыл алуучу ДНКны өзгөртөт жана бөлүнүүнүн алдын алат. Бул чектөө ферменттери биохимиялык жактан маанилүү болгонуна карабастан, алар дискреттик чектөө фрагменттерин же гел менен байланыштырууну камсыз кылбагандыктан кеңири колдонулбайт.
Тип II чектөө ферменттери деген эмне?
Тип II чектөө ферменттери структурасында эки окшош суббирдикти камтыйт. Гомодимерлер II типтеги чектөө ферменттери тарабынан таанылуу жерлери менен түзүлөт. Таануу жерлери адатта палиндромдук жана бөлүнбөйт. Анын узундугу 4-8 түп жупка жетет. I типтен айырмаланып, II типтеги чектөө ферментинин бөлүнүү аймагы таануу жеринде бар же тааныган жерге жакын аралыкта болот.
02-сүрөт: II типтеги чектөө ферменттери
Бул чектөө ферменттери биохимиялык жактан маанилүү жана коммерциялык жактан кеңири жеткиликтүү. Аны активдештирүү үчүн ага Mg2+ гана керек. Ал метилдөө активдүүлүгүнө ээ эмес жана чектөө активдүүлүгүн гана камсыз кылат. Бул чектөө ферменттери ДНК молекулалары менен гомодимерлер катары байланышат жана симметриялуу ДНК тизмектерин, ошондой эле асимметриялык тизмектерди таануу жөндөмүнө ээ.
Тип I жана II типтеги чектөө ферменттеринин кандай окшоштуктары бар?
- Тип I жана II типтеги чектөө ферменттери - ферменттердин түрлөрү, алар ДНК молекулаларынын майда фрагменттерге бөлүнүшүнө катышкан чектөө эндонуклеазалары.
- Экөө тең молекулярдык биологиялык техникада пайдалуу.
Тип I жана II типтеги чектөө энзиминин ортосунда кандай айырма бар?
Тип I vs II Тип чектөөчү фермент |
|
| Тип I чектөө ферменти – бул ДНКны чектөөчү фермент, ал ДНКны тааныган жеринен алыс жайгашкан туш келди жерлерден ажыратат. | Тип II чектөө ферменти – ДНКны аныктоочу жерге жакын же анын ичинде аныкталган позицияларда ажыратуучу ДНК чектөө ферменти. |
| Композиция | |
| Тип I чектөө ферменти үч (03) окшош эмес суб-бирдиктен турган татаал фермент. | Тип II чектөө ферменти эки окшош суббирдиктен турган жөнөкөй фермент. |
| Молекулярдык салмак | |
| I типтеги чектөө ферментинин салмагы 400 000 дальтон. | Тип II чектөө ферментинин салмагы 20 000 – 100 000 дальтон. |
| Ажыратуунун ырааты | |
| Ажыратуунун ырааттуулугу I типтеги чектөө ферментинде өзгөчө эмес. | Тип II чектөө ферментинин белгилүү бир ырааттуулугу бар. |
| Бөлүнгөн жер | |
| Бөлүү жери I типтеги чектөө ферменттеринде таануучу жерден 1000 нуклеотид алыстыкта жайгашкан. | Бөлүнгөн жер II типтеги чектөө ферментинин таануу жеринде же таанылган жерден кыска аралыкта жайгашкан. |
| Активдештирүү үчүн кофакторлор | |
| Тип I чектөө ферменти активдештирүү үчүн ATP, Mg2+ жана S-аденозил-L-метионинди талап кылат. | II типтеги чектөө ферментин активдештирүү үчүн Mg2+ гана керек. |
| Метилдөө активдүүлүгү | |
| I типтеги фермент ДНКны метилденүү жолу менен коргойт. | II типтеги чектөө ферменттеринде метилдөө активдүүлүгү жок. |
| Ферменттин активдүүлүгү | |
| Тип I чектөө энзими эндонуклеазаны (чектөө) жана метилдөө активдүүлүгүн камсыздайт. | Тип II чектөө ферменти чектөө активдүүлүгүн гана камсыз кылат. |
| Мисалдар | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Кыскача маалымат – I типке каршы II типтеги чектөө энзими
Чектөөчү ферменттер ДНК молекулаларын майда заттарга бөлүүчү биологиялык кайчы деп аталат. Чектөөчү ферменттер 04 түрдүү категорияга бөлүнөт, алар таануу сайтына, учурда болгон факторлорго, максаттуу ырааттуулуктун курамына жана абалына карата бөлүнүү жеринин жайгашкан жерине жараша. Аны активдештирүү үчүн I типтеги чектөө ферменттери ATP, Mg2+, жана S-аденозил-L-метионинди талап кылат. I типтеги чектөө ферментинин бөлүнүүчү жери, адатта, таануучу жерден 1000 жуп алыс жайгашкан жана ДНКга метилазадан коргоону камсыз кылат. II типтеги чектөөлөр ферменттери активдештирүү үчүн Mg2+гана талап кылат. Ажыратуучу жер тааныган жерде же ага жакын жерде болот. Ал метилдөө активдүүлүгүнө ээ эмес жана коммерциялык жактан кеңири жеткиликтүү. Бул I түрдөгү чектөө ферменти менен II типтеги чектөө ферментинин ортосундагы айырма.
Тип I жана II Типти чектөөчү ферменттин PDF версиясын жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, шилтеме эскертүүсүнө ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз I жана II типтеги чектөө энзиминин айырмасы.
