CRISPR менен CRISPR Cas9 ортосундагы негизги айырма CRISPR (кластердик үзгүлтүксүз аралыкта кыска палиндромдук кайталоо) табигый прокариоттук иммундук коргонуу механизми, ал эми CRISPR cas9 CRISPR адаптивдик бөлүгү болгон РНК жетектеген Cas9 нуклеазасы. иммундук система.
CRISPR – бактериялар менен археяларда табылган вируска каршы коргонуу иммундук системасы. Бул бактериялык геномдо табылган ДНК тизмектеринин үй-бүлөсү. Ал мурда аларды жуктуруп алган бактериофагдардын ДНК фрагменттеринен алынган спасердик тизмектерден турат. Кийинки вирустук инфекцияларда бактериялар бул тизмектерди вирустун ДНКсын жок кылуу үчүн колдонушат. CRISPR ырааттуулугунда кыска палиндромдук кайталоо жана мейкиндик ырааттуулугу бар. Мындан тышкары, CRISPR кайталануучу мейкиндик ырааттуулугу көбүнчө Cas протеиндерин коддогон байланышкан гендерге ээ. Cas9 - бул РНК жетектеген эндонуклеаза. CRISPR ырааттуулугу менен бирге Cas9 протеини бактерияларда бактериофагдарга каршы ыңгайлашуучу иммундук система катары иштейт.
CRISPR деген эмне?
CRISPR Кластердик үзгүлтүксүз аралыкта кыска палиндромикалык кайталоолорду билдирет. Бул бактериянын геномунда табылган ДНК тизмегинин кластери. Ал бактерияларда табигый коргонуу механизми катары иштейт жана ал биринчи жолу E. coliде аныкталган. Бактерияларда, өзгөчө, бактериофагдарга каршы, адаптациялык иммундук коргоо милдетин аткарат. Демек, бул ырааттуулукка мүнөздүү механизм.
01-сүрөт: CRISPR
CRISPR системасы бир нече кыска сегменттелген ДНКнын кайталануу ырааттуулугун камтыйт. Бул кайталоо палиндромдук болуп саналат, 5'тен 3'ге чейин окуганда бирдей базалык ырааттуулукка ээ, ал эми экинчиси 3'ден 5'ге чейин окуганда бирдей ырааттуулукту берет. Мындан тышкары, кайталоо бирдей болуп саналат. Алар окшош эмес кыска "космостук" ДНК тизмектеринин ортосунда жайгашкан. Бирок бул спасердик ДНК тизмектери чет өлкөлүк бактериофаг ДНКсына окшош же дал келет. CRISPR менен байланышкан гендер CRISPR менен байланышкан гендер же Cas гендери катары белгилүү. Cas гендери геликазалар же нуклеазалар болгон Cas протеиндерин коддойт. Геликазалар ДНКны ачат, ал эми нуклеазалар ДНКны кесип салат. Жалпысынан, CRISPR карап жатканда, бул бактериофагдарга (вирустарды жугузуучу бактериялар) каршы иштеген бактериялардын иммундук системасы.
CRISPR Cas9 деген эмне?
Cas9 же CRISPR менен байланышкан протеин 9 - бул бактериялык РНК жетектеген эндонуклеаза. Демек, ал жетектөөчү РНКга толуктоочу максаттуу ДНКны (айрыкча бактериофаг ДНКсын) таанып, кесүүчү фермент. Ал жип-спецификалык бөлүүнү жүзөгө ашырат. Cas9 протеини CRISPR менен байланышкан ген тарабынан коддолгон. CRISPR cas9 – бул РНК жетектеген CRISPR-Cas9 нуклеаза системасы, аны геномду редакциялоо, транскрипциялык бузулуу, эпигенетикалык модуляция жана геномду сүрөттөө үчүн РНК-программалануучу ДНКны максаттуу жана редакциялоо платформасы катары колдонсо болот. Бул CRISPR cas9 системасы учурдагы геномду түзөтүү системаларында абдан популярдуу.
02-сүрөт: CRISPR Cas9
Учурда CRISPR/Cas9 системасы сүт эмүүчүлөрдүн геномун транскрипция репрессиясы же активдештирүү жолу менен өзгөртүү же өзгөртүү үчүн колдонулат. Сүт эмүүчүлөрдүн клеткалары оңдоо механизмин кабыл алуу менен CRISPR/Cas9 ортомчу ДНК тыныгууларына жооп бере алат. Бул гомологдук эмес аягы кошулуу ыкмасы (NHEJ) же гомологияга багытталган оңдоо (HDR) аркылуу жасалышы мүмкүн. Бул эки оңдоо механизми эки катарлуу тыныгууларды киргизүү менен ишке ашат. Бул сүт эмүүчүлөрдүн генинин редакциясына алып келет. NHEJ ген мутацияларынын абляциясына алып келиши мүмкүн жана функция эффекттерин жоготуу үчүн колдонулушу мүмкүн. HDR конкреттүү чекит мутацияларын киргизүү же ар кандай узундуктагы ДНК сегменттерин киргизүү үчүн колдонулушу мүмкүн. Учурда CRISPR/ Cas системасы терапевтикалык, биомедициналык, айыл чарба жана изилдөө тармактарында колдонулат.
CRISPR жана CRISPR Cas9 ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Cas9 CRISPR Cas тутумунун бир бөлүгү.
- Crisper ca9 системасы – бул табигый түрдө бактерияларда табылган иммундук система.
CRISPR менен CRISPR Cas9 ортосунда кандай айырма бар?
CRISPR – бактериофагдарга каршы табигый коргонуу системасы катары иштеген бактериянын геномунда табылган ДНК тизмектеринин кластери. Ал үзгүлтүксүз аралыкта жайгашкан кыска палиндромдук кайталануулардан, спрейсерлерден жана ага байланыштуу гендерден турат. Ал эми, cas9 бул CRISPR менен байланышкан протеин 9, ал РНК жетектеген эндонуклеаза энзими. Ал вирустардын ДНКсынын кош тилкелерин тааныйт жана ажыратат. Чынында, бул CRISPR коргонуу системасынын бир бөлүгү. Демек, бул CRISPR менен CRISPR cas9 ортосундагы негизги айырма.
Кыскача – CRISPR жана CRISPR Cas9
CRISPR Cas системасы микробдордон коргонуу системасы. CRISPR - палиндромдук кыска кайталоодон, спасердик ырааттуулуктан жана ага байланышкан гендерден турган ДНК тизмектеринин кластери. Cas9 бир РНК жетектеген эндонуклеаза болгон бир Cas протеин. CRISPR жана Cas9 белок бактериялардагы бактериофаг инфекцияларына каршы иштеген иммундук системаны түзөт. Cas9 протеини чет өлкөлүк вирустун ДНКсын бөлүп, аларды бузууга жөндөмдүү. CrRNA вирустук ДНКны таануу үчүн ca9ды жетектейт. Ошондуктан, CRISPR cas9 системасы вирустарга каршы бактерияларда табылган табигый иммундук система. Ошентип, бул CRISPR менен CRISPR cas9 ортосундагы айырманын кыскача мазмуну.