Шилтемелер менен адаптердин негизги айырмасы - байланыштыргычтын бириккен учтары жок, ал эми адаптердин бир аягы бар.
ДНК лигациясы - фосфодиэстер байланыштарын түзүү, эки ДНК молекуласын бириктирүү процесси. ДНК лигаза деп аталган фермент бул реакцияны катализдейт. Бул рекомбинантты ДНК технологиясы жана ДНК клондоо сыяктуу заманбап молекулярдык биологиялык талаалардагы маанилүү кадамдардын бири. Лигациянын эффективдүүлүгү байлана турган ДНК молекулаларынын учтарына көз каранды. ДНК учтарынын жабышчаак учтары жана туюк учтары болуп эки түрү бар. Лигациянын эффективдүүлүгү жабышчаак учтары менен туюк учтарга караганда жогору. Эгерде максаттуу ДНК молекулаларынын учтары курч болсо, адаптер же шилтемелер деп аталган молекулалар пайдалуу болот. Адаптерлер жана шилтемелер - бул ДНКнын лигациясына жардам берген химиялык синтезделген олигонуклеотиддик молекулалар. Алардын ички чектөө сайттары да бар. Адаптердин бир жабышчаак жана бир учу бар, ал эми байланыштыргычтын эки учу бар.
Шилтеме деген эмне?
Linker – химиялык жактан синтезделген олигонуклеотиддердин ырааттуулугу, ал кош саптуу. Линкердин эки учтары бар. Линкер векторлорго туюк учтары бар ДНК молекулаларын байлоо үчүн колдонулат. Ал бир же бир нече ички чектөө сайттарын камтыйт. Бул чектөө сайттары чектөө ферменттерин таануу сайттары катары иштейт.
01-сүрөт: Шилтемечи
Байланышкандан кийин, ДНК бириктирилген учтарды пайда кылуу үчүн кайрадан чектөө ферменттери менен чектелет. EcoRI-байланыштыргычтар жана sal-I байланыштыргычтар көбүнчө колдонулган шилтемелер.
Адаптор деген эмне?
Адаптер – бул эки ДНК молекуласын бириктирүү үчүн колдонулган кош саптуу олигонуклеотид ырааттуулугу. Бул бир туңгуюк учу жана бир жабышчаак же бириккен учу бар кыска ырааттуулук. Демек, ал ДНКнын лигациясынын эффективдүүлүгүн жогорулаткан бир учунда бир жиптүү куйруктан турат.
02-сүрөт: Адаптор аркылуу ДНКнын лигациясы
Андан тышкары, адаптерде ички чектөө сайттары бар. Ошондуктан, байлагандан кийин, ДНК жаңы чыгып турган терминалды түзүү үчүн тиешелүү чектөө ферменттери менен чектелиши мүмкүн. Адаптерлердин бир кемчилиги эки адаптер базаны өздөрү менен жупташтыруу аркылуу диммерлерди түзө алат. Аларды щелочтуу фосфатаза деп аталган фермент менен дарылоо аркылуу мунун алдын алууга болот.
Линкер менен Адаптордун кандай окшоштуктары бар?
- Байланыштыргыч да, адаптер да эки тизмектүү кыска олигонуклеотид ырааттуулугу.
- Аларда ички чектөө сайттары бар.
- Андан тышкары, алар химиялык синтезделген ДНК молекулалары жана синтетикалык молекулалар.
- Алар эки ДНК молекуласын бириктире алышат.
- Линкерлерди жана адапторлорду байлагандан кийин, жабышчаак учтарды пайда кылуу үчүн ДНК кайрадан чектөө ферменттери менен чектелет.
Линкер менен Адаптордун ортосунда кандай айырма бар?
Линкер – бул химиялык жактан синтезделген кыска олигонуклеотиддик эки туюк учу бар дуплекс. Адаптер - бул химиялык синтезделген кыска олигонуклеотиддик дуплекс, бир жабышчаак учу жана бир учу. Ошентип, бул байланыштыргыч менен адаптордун ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, адаптер димерлерди түзө алат, ал эми линкер димерлерди түзбөйт. Демек, бул байланыштыргыч менен адаптордун ортосундагы дагы бир олуттуу айырма.
Төмөндө таблица түрүндөгү шилтемелер менен адаптердин ортосундагы айырмачылыктардын корутундусу келтирилген.
Кыскача маалымат – Шилтемеч жана Адаптор
Линкер жана адаптер химиялык синтезделген олигонуклеотиддердин эки түрү болуп саналат, алар туңгуюк ДНКны бириктирүүдө пайдалуу. Линкердин эки учтуу учу бар, ал эми адаптердин бир учу жана бир уяча учу бар. Демек, бул байланыштыргыч менен адаптордун ортосундагы негизги айырма. Алар ички чектөө жерлерине ээ болгон эки жиптүү молекулалар. Алар рекомбинанттык ДНК технологиясында жана ДНК клондоштурууда кеңири колдонулат.
