Серин менен тирозин рекомбиназанын ортосундагы негизги айырма - серин рекомбиназасында серин - бул сайтка тиешелүү рекомбинация учурунда ДНКга кол салуу үчүн фермент тарабынан колдонулган нуклеофилдик аминокислота, ал эми тирозин рекомбиназасында тирозин нуклеофилдик аминокислота болуп саналат. сайтка тиешелүү рекомбинация учурунда ДНКга кол салуу үчүн фермент тарабынан.
Сайтка тиешелүү рекомбинация (консервативдик сайтка мүнөздүү рекомбинация) – генетикалык рекомбинация ыкмасынын бир түрү, мында ДНК тилкелеринин алмашуусу ырааттуулуктун гомологиясынын белгилүү даражасына ээ болгон сегменттер арасында ишке ашат. Сайттын рекомбиназдары сайттын рекомбинация процессин жөнгө салат. Бул энзимдер серин рекомбиназа үй-бүлөсү жана тирозин рекомбиназа үй-бүлөсү катары эки үй-бүлөгө топтоштурулган. Аттар ДНКга чабуул жасоо үчүн колдонулган жана сайтка тиешелүү рекомбинацияда жип алмашуу учурунда аны менен коваленттүү байланышта болгон рекомбиназалардын жогорудагы эки классында бар сакталган нуклеофилдик аминокислота калдыктарынан келип чыккан.
Серин рекомбиназа деген эмне?
Текшелүү рекомбинация методунда эки кыска ДНК тизмеги («максаттуу сайттар») эки жиптин тең белгилүү чекиттеринде кесилип, кесилген учтары кайрадан жаңы өнөктөштөр менен бириктирилет. Сайттын өзгөчө рекомбинация технологиялары – гендик инженерияда ДНКнын максаттуу бөлүгүн алмаштыруу үчүн рекомбиназа ферменттерине көз каранды болгон геномдук куралдар. Бул ДНКнын кайра түзүлүшүн ар кандай максаттар үчүн аткаруу үчүн көптөгөн сайттарга тиешелүү рекомбинация системалары табылган. Бирок бул рекомбиназа ферменттеринин баары эки үй-бүлөгө таандык. Алардын бири серин рекомбиназасы. Алар ДНКны кайра түзүүнүн үч түрүнө чейин ортомчулук кыла алат: интеграция, кесүү жана инверсия.
01-сүрөт: Сериндик рекомбиназа
Серин рекомбиназасы сыяктуу сайтка тиешелүү рекомбиназалар кыска ДНК ырааттуулугун (максаттуу участок) таануу жана байланыштыруу аркылуу ДНКны кайра түзүүнү аткарышат, анда алар ДНКнын омурткасын ажыратышат. Кийинчерээк эки ДНК спиралынын алмашуусу болуп, ДНК тилкелеринин кайра кошулуусу ишке ашат. Сериндик рекомбиназада серин - бул сайтка тиешелүү рекомбинация учурунда ДНКга кол салуу үчүн фермент тарабынан колдонулган аминокислота. ДНКны ажыратуу учурунда протеин-ДНК байланышы трансэтерификация реакциясы аркылуу түзүлөт. Фосфодиэстер байланышы ажыраган жердеги 5'фосфат тобу менен консервацияланган серин калдыктарынын гидроксил тобунун ортосундагы фосфозерин байланышы менен алмашат. Жаңы байланыш максаттуу жерде ДНКны бөлүүгө сарпталуучу энергияны сактайт. Бул энергия кийинчерээк ДНКны башка сайттагы тиешелүү дезоксирибоза гидроксил тобуна кайра кошуу үчүн колдонулат. Сериндик рекомбиназалардын мисалдары сериндик резолвазалар/инвертазалар жана серин интегразалар.
Тирозин рекомбиназа деген эмне?
Тирозин рекомбиназа консервативдик сайттын рекомбинациясын жөнгө салуучу башка фермент классы болуп саналат. Мурда айтылгандай, тирозин рекомбиназа да ДНКнын омурткасын бөлүп турган кыска ДНК ырааттуулугун (максаттуу жер) таанып жана байланыштырып, ошол эле жол менен ДНКнын кайра түзүлүшүн ишке ашырат. Кийинчерээк эки ДНК спиралынын алмашуусу жана ДНК тилкелеринин кайра кошулуусу ишке ашат.
02-сүрөт: Тирозин рекомбиназа
Бирок тирозин рекомбиназада тирозин - бул сайтка тиешелүү рекомбинация учурунда ДНКга кол салуу үчүн фермент тарабынан колдонулган аминокислота. Бул класстын жалпы өзгөчөлүгү - сакталган нуклеофилдик тирозин калдыктары 3′-фосфотирозин байланышын түзүү үчүн цисссилдүү ДНК-фосфатка чабуул коюуда. Тирозин рекомбиназалар (A1) жана тирозин интеграздары (A2) тирозин рекомбиназа ферменттеринин үй-бүлөсүндөгү көрүнүктүү фермент топтору болуп саналат.
Серин жана тирозин рекомбиназанын кандай окшоштуктары бар?
- Алар рекомбиназа ферменттеринин классы.
- Экөө тең сайтка тиешелүү рекомбинацияны жөнгө салат.
- Алар белоктор.
- Негизги химиялык реакция экөө тең бирдей.
- Экөө тең трансэтерификация реакциясын катализдейт.
Серин жана тирозин рекомбиназанын ортосунда кандай айырма бар?
Сериндик рекомбиназада серин - бул нуклеофилдик аминокислота, ал фермент тарабынан атайын рекомбинация учурунда ДНКга чабуул жасоо үчүн колдонулат. Башка жагынан алганда, тирозин рекомбиназада, тирозин - бул нуклеофилдик аминокислота, ал фермент тарабынан атайын рекомбинация учурунда ДНКга кол салуу үчүн колдонулат. Ошентип, бул серин жана тирозин рекомбиназынын ортосундагы негизги айырма. Сериндик рекомбиназанын жалпы өзгөчөлүгү - бул ДНК менен фосфозериндик байланышты түзүшү, ал эми тирозин рекомбиназа сайтка тиешелүү рекомбинация процессинде ДНК менен фосфотирозин байланышын түзөт.
Төмөнкү инфографика таблица түрүндө серин менен тирозин рекомбиназанын ортосундагы айырмачылыктарды тизмелейт.
-
Таблица түрүндө серин жана тирозин рекомбиназынын ортосундагы айырма
Кыскача маалымат – Серин и тирозин рекомбиназа
Рекомбинация гомологдордун рекомбинациясындагыдай ДНКнын окшош молекулаларынын ортосунда же гомологдор эмес рекомбинациядагыдай окшош эмес молекулалардын ортосунда болушу мүмкүн. Сайт-спецификалык рекомбинация – бул генетикалык рекомбинациянын бир түрү, мында ДНК тилкелеринин алмашуусу жок дегенде белгилүү даражадагы ырааттуулук гомологиясына ээ болгон сегменттер арасында ишке ашат. Ал рекомбиназалар тарабынан катализделет. Көпчүлүк рекомбиназалар эки үй-бүлөгө бөлүнөт: серин рекомбиназа жана тирозин рекомбиназа. Сериндик рекомбиназа нуклеофилдик аминокислота катары серинди колдонот, бул сайтка тиешелүү рекомбинация процессинде ДНКга кол салуу. Тирозин рекомбиназа сайтка өзгөчө рекомбинация процессинде ДНКга кол салуу үчүн нуклеофилдик аминокислота катары тирозин колдонот. Ошондуктан, бул серин жана тирозин рекомбиназа ортосундагы негизги айырма.
