LTR менен LTR эмес ретротранспозондордун негизги айырмасы, LTR ретротранспозондорунун түзүмүндө узун терминалдык кайталанышы бар ретротранспозондордун бир түрү, ал эми LTR эмес ретротранспозондор ретротранспозондордун бир түрү болуп саналат, аларда узак терминалдык кайталануулар жок. алардын түзүмүндө.
Ретротранспозондор (I класстагы транспозондук элементтер же РНК аралык заттары аркылуу транспозондор) – генетикалык компоненттин бир түрү, алар өздөрүн ар кандай геномдук жерлерге көчүрө алышат. Алар муну РНКны кайра ДНКга айландыруу аркылуу, РНКнын транспозициясынын ортоңку бөлүгүн колдонуп, тескери транскрипция деп аталган процесс аркылуу аткарышат.ретротранспозондордун LTR жана LTR эмес ретротранспозондор сыяктуу эки негизги түрү бар
LTR ретротранспозондор деген эмне?
LTR ретротранспозондор түзүмүндө узун терминалдык кайталоолорго ээ ретротранспозондордун бир түрү. Кайталануучу ДНКнын узун тилкелерин LTR ретротранспозонунун ар бир четинен табууга болот. Бул узак терминалдык кайталоо (LTR) деп аталат. Ар бир LTR бир нече жүз базалык жуптарды түзөт. LTR ретротранспозондорунун узундугу адатта 5 килобазадан ашат. Мындан тышкары, узак терминалдык кайталоолордун ортосунда ретровирус генине гаг жана пол эквиваленттүү транскрипцияланган гендер бар. Бул гендер бири-бирине дал келет, ошондуктан алар адатта алынган транскрипцияны функционалдык ген продуктыларына иштеткен протеазаны коддойт.
01-сүрөт: LTR ретротранспозондору
Ретротранспозондордун Гаг гени башка ретротранспозондордун транскрипттери менен байланышып, вируска окшош бөлүкчөлөрдү пайда кылган продукт түзөт. Пол гени тескери транскриптаза, интеграза жана рибонуклеаза Н домендери сыяктуу ферменттерди камтыган өнүмдөрдү жасайт. Тескери транскриптаза ферменти ретротранспозондук ДНКнын тескери транскрипциясын ишке ашырат. Интеграза ферменти ретротранспозон ДНКсын эукариоттук геномдун ДНКсына бириктирет. Рибонуклеаза Н домендери РНКнын ортомчуларынын ортосундагы фосфодиэстер байланыштарын үзүүдө пайдалуу. LTR ретротранспозондору ошондой эле тРНКны байланыштыруучу жерлери бар транскрипттерди коддойт, ошондуктан алар тескери транскрипциядан оңой өтүшү мүмкүн. Андан тышкары, ретротранспозон эукариоттук геномдун маалыматын камтыгандыктан, ал өзүнүн көчүрмөлөрүн эукариоттук клетканын ичиндеги башка геномдук жерлерге киргизе алат.
LTR эмес ретротранспозондор деген эмне?
LTR эмес ретротранспозондор – бул ретротранспозондордун түзүмүндө узун терминалдык кайталанышы жок бир түрү. LTR ретротранспозондор сыяктуу эле, LTR эмес ретротранспозондор да тескери транскриптаза, РНКны байланыштыруучу белок, нуклеаза жана кээде рибонуклеаза Н домендерин камтыган гендерди камтыйт. Бирок аларда узак терминалдык кайталоо жетишпейт; анын ордуна, алар бири-биринин жанында негиздери тескери тартипте болушу мүмкүн кыска кайталоо бар. РНКны байланыштырган белоктор РНКнын транспозициясынын ортоңку бөлүгү менен байланышат, ал эми нуклеазалар нуклеиндик кислоталардагы нуклеотиддердин ортосундагы фосфодиэстер байланыштарын үзүшөт.
02-сүрөт: LTR жана LTR эмес ретротранспозондор
Алар ретротранспозондор болгонуна карабастан, алар LTR ретротранспозондору сыяктуу эле РНК аралык өнүмдөрүн колдонуу менен тескери транскрипцияны жүргүзө алышпайт. Себеби LTR эмес ретротранспозондор тРНКны байланыштырган ырааттуулукту камтыбайт. Демек, мРНКга транскрипцияланган жана протеиндерге которулган LTR эмес ретротранспозон тескери транскриптаза катары иштейт. Тескери транскриптаза LTR эмес ретротранспозондун РНКсынын ДНК көчүрмөсүн түзөт, ал жаңы сайтта геномго кошула алат. Андан тышкары, LTR эмес ретротранспозондор эки түргө бөлүнөт: LINEs (узун кесилген ядролук элементтер) жана SINEs (кыска аралыкта жайгашкан ядролук элементтер).
LTR жана LTR эмес ретротранспозондордун кандай окшоштуктары бар?
- LTR жана LTR эмес ретротранспозондор ретротранспозондордун эки негизги түрү болуп саналат.
- Эки түр тең тескери транскриптаза, РНКны байланыштыруучу протеин, нуклеаза жана рибонуклеаза H домендери сыяктуу ферменттердин гендерин камтыйт.
- Аларды адамдын геномунда табууга болот.
- Эки түрү тең эволюциялык жактан маанилүү.
LTR жана LTR эмес ретротранспозондордун ортосунда кандай айырма бар?
LTR ретротранспозондорунун структурасында узун терминалдык кайталануулар бар, ал эми LTR эмес ретротранспозондор структурасында узак терминалдык кайталануулар жок. Ошентип, бул LTR жана LTR эмес ретротранспозондордун ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, LTR ретротранспозондорунун узак түз кайталанышы бар, алар өздөрүн кайталаган негиздердин бир ырааттуулугу. Башка жагынан алганда, LTR эмес ретротранспозондор кыска кайталанууга ээ, алар бири-бирине жакын негиздеринин тескери иретинде болушу мүмкүн.
Төмөнкү инфографикада LTR жана LTR эмес ретротранспозондордун ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача – LTR жана LTR эмес ретротранспозондор
LTR жана LTR эмес ретротранспозондор ретротранспозондордун эки негизги түрү болуп саналат. LTR ретротранспозондорунун түзүмүндө узун терминалдык кайталануулары бар, ал эми LTR эмес ретротранспозондордун структурасында узун терминалдык кайталоолору жок. Демек, бул LTR менен LTR эмес ретротранспозондордун ортосундагы негизги айырма.
