ДНК транспозондорунун жана ретротранспозондордун ортосундагы негизги айырмачылык, ДНК транспозондору геномдун бир жеринен экинчи жерге кесүү жана чаптоо механизмин колдонуу менен кыймылдуу генетикалык элементтер, ал эми ретротранспозондор бир жерден жылуучу мобилдүү генетикалык элементтер. көчүрүү жана чаптоо механизмин колдонуу менен геномдогу башкасына.
Мобилдик генетикалык элементтер (MGEs) – геномдун ичиндеги кыймылын ортомчу болгон белгилүү ферменттерди жана белокторду коддоочу ДНКнын сегменттери же бир түрдөн экинчи түргө өтүшү мүмкүн. Алар ошондой эле өзүмчүл генетикалык элементтер катары белгилүү. Transposable элементтер мобилдик генетикалык элементтердин бир нече түрлөрүнүн бирин билдирет. Транспозондук элементтердин эки негизги түрү бар: ДНК транспозондору жана ретротранспозондор. Демек, ДНК транспозондору жана ретротранспозондор геномдо бир жерден экинчи жерге көчүп кете ала турган мобилдик генетикалык элементтер болуп саналат.
ДНК транспозондору деген эмне?
ДНК транспозондору – кесүү жана чаптоо механизмин колдонуу менен геномдун бир жеринен экинчи жерге көчүүчү мобилдик генетикалык элементтер. Алар ДНКнын ортоңку заты аркылуу кыймылдаган II класстагы транспозоляциялык элементтерге кирет. Бул РНКнын ортоңку бөлүгү аркылуу кыймылдаган I класстагы транспозондук элементтерге (ретротранспозондорго) карама-каршы келет. Адатта, ДНК транспозондору кесүү жана чаптоо ыкмасын колдонуу менен геномдо кыймылдашат. Бул ыкма ДНКнын геномдогу учурдагы жайгашкан жеринен кыймылын катализдөөчү транспозаза ферментин жана жаңы жерге киргизүүнү талап кылат.
01-сүрөт: ДНК транспозондору
Бул транспозиция транспозондо үч ДНК участогун талап кылат (транспозондун ар бир учунда экиден терминалдык кайра кайталоо деп аталат жана бирөө максаттуу жерде). Транспозаза ферменти транспозондун тескери кайталанган терминалына байланышат жана транспозондун учтарынын синапсисине ортомчулук кылат. Андан кийин транспозаза ферменти элементти баштапкы донордук сайттын каптал ДНКсынан ажыратат жана транспозондун геномдогу жаңы киргизүү аймагына кошулуусуна ортомчулук кылат. Жаңы жерге транспозондун кошулушу киргизилген сегменттин эки тарабында кыска боштуктарды пайда кылат. Хост системалары бул боштуктарды оңдоп, натыйжада транспозицияга мүнөздүү болгон максаттуу ырааттуулуктун кайталанышына (TSD) алып келет.
Ретротранспозондор деген эмне?
Ретротранспозондор көчүрүү жана чаптоо механизмин колдонуу менен геномдун бир жеринен экинчи жерге көчүүчү мобилдик генетикалык элементтер. Алар I класстын транспозициондук элементтерине кирет. I класстагы транспозондук элементтер (ретротранспозондор) геномдогу РНКнын аралыгы аркылуу жылат. Алар өздөрүн ар кандай геномдук жерлерге көчүрүп, чаптаган генетикалык компоненттин бир түрү.
02-сүрөт: ретротранспозондор
Биринчиден, алар ДНКдан РНКга транскрипцияланат. Андан кийин өндүрүлгөн РНК кайра ДНКга транскрипцияланат. Бул копияланган ДНК кийинчерээк геномго кайра жаңы жерде киргизилет. Тескери транскрипция тескери транскриптаза менен катализделет. Тескери транскриптаза көбүнчө ретротранспозондун өзү тарабынан коддолот. Интеграция интеграза деп аталган фермент тарабынан ишке ашырылат. Андан тышкары, адатта, үч түрү бар: узун терминалдык кайталоо (LTR), узун кесилишкен ядролук элементтер (LINE) жана кыска аралыкта өзөктүк элементтер (SINE).
ДНК транспозондору менен ретротранспозондорунун кандай окшоштуктары бар?
- ДНК транспозондору жана ретротранспозондор кыймылдуу генетикалык элементтер.
- Экөө тең которула турган элементтер боюнча классификацияланган.
- Экөө тең секирүүчү гендер катары белгилүү.
- Алар геномдо бир жерден экинчи жерге жыла алышат.
- Алар эволюциялык жактан абдан маанилүү.
ДНК транспозондору менен ретротранспозондорунун ортосунда кандай айырма бар?
ДНК транспозондору кесүү жана чаптоо механизминин жардамы менен геномдун бир жеринен экинчи жерге көчүүчү кыймылдуу генетикалык элементтер, ал эми ретротранспозондор геномдун бир жеринен экинчи жерге көчүрүү жана көчүрүү аркылуу көчүүчү генетикалык элементтер. чаптоо механизми. Ошентип, бул ДНК транспозондор менен ретротранспозондордун ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, ДНК транспозондору II класстагы транспозондук элементтерге, ал эми ретротранспозондор I класстагы транспозондук элементтерге кирет.
Төмөнкү инфографикада ДНК транспозондору менен ретротранспозондордун ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – ДНК транспозондоруна каршы ретротранспозондор
ДНК транспозондору жана ретротранспозондор кыймылдуу генетикалык элементтер. ДНК транспозондору кесилген паста механизмин колдонуу менен геномдогу бир жерден экинчи жерге көчүшөт. Ретротранспозондор көчүрүү жана чаптоо механизмин колдонуу менен геномдун бир жеринен экинчи жерге көчүшөт. Демек, бул ДНК транспозондорунун жана ретротранспозондордун ортосундагы айырманы жалпылайт.
