Негизги айырма – Ti менен Ri Plasmid
Agrobacterium - эки үлүштүү өсүмдүктөрдүн бир нече ооруларын, анын ичинде таажынын өт оорусун жана түктүү тамыр оорусун пайда кылган бактериялык тукум. Бул эки оору бактериялардын плазмидаларында (хромосомдук эмес ДНК) жайгашкан гендер тарабынан коддолгон. Бактериялык түрлөрү Agrobacterium tumerfaciens өсүмдүктөрдүн өт оорусуна жооптуу шишик козгогуч плазмидди (Ti плазмидасын) камтыйт. Agrobacterium rhizogenes өсүмдүктөрдүн түктүү тамыр оорусу үчүн жооптуу тамыр индукциялоочу плазмидди (Ri плазмидасын) камтыган дагы бир бактерия. Ti жана Ri плазмиддери бул бактерия тукумуна гана таандык патогендик плазмиддер. Ti жана Ri плазмидинин ортосундагы негизги айырма Ti плазмидинин өт оорусунун пайда болушуна жооптуу гендер менен коддолгондугунда, ал эми Ri плазмиди өсүмдүктөрдүн түктүү тамыр оорусунун гендери менен коддолгондугунда. Бул патогендик плазмидалар ДНКнын репликациясына, вируленттүүлүгүнө, Т-ДНКсына, опинди колдонууга жана конъюгацияга жооптуу ген кластерлерин камтыйт. Инфекция учурунда Agrobacterium плазмиданын Т-ДНК (трансфер ДНК) аймагын акциздейт жана ооруну пайда кылуу үчүн өсүмдүк геному менен интеграцияланат. Бул жөндөмдү молекулярдык биологдор гендик инженерияда өсүмдүктөргө маанилүү гендерди киргизүү үчүн колдонушат. Демек, Agrobacterium биотехнологияда жана молекулярдык биологияда химердик ДНКны ар кандай өсүмдүктөрдүн түрлөрүнө киргизүү үчүн маанилүү курал катары каралат.
Ti Plasmid деген эмне?
Шишикти козгоочу плазмид (Ti плазмида) – бул Agrobacterium tumerfaciens тарабынан сакталган чоңураак плазмид, эки жарнатты өсүмдүктөрдүн кеңири спектринде өт оорусун пайда кылуу үчүн. Өттүн таажы оорусу деген аталыш А-нын өсүмдүк гормондору ауксин жана цитокининдерди ашыкча өндүрүүдөн улам топурак бетинин үстүндөгү өсүмдүктөрдүн таажысында чоң шишик (өт) пайда болушунан улам колдонулат.tumerfaciens. Т-ДНК аймагында шишик пайда кылуучу гендер бар. Agrobacterium tumerfaciens өсүмдүктөргө жабыркаган өсүмдүк кыртыштары аркылуу, өзгөчө жаралар аркылуу кирип, плазмиддик ДНКнын (Т-ДНК) бир бөлүгүн оору жаратуучу гендер менен бирге өсүмдүк клеткаларына өткөрүп берет. Бул Т-ДНК андан кийин өсүмдүк клеткасынын геномуна биригип, транскрипцияланат. Гендердин экспрессиясы шишиктердин пайда болушуна жана клетканын метаболизминде ага байланыштуу өзгөрүүлөргө алып келет. Таажынын өт оорусу улгайган өсүмдүктөргө олуттуу зыян келтирбейт. Бирок ал питомниктердин сапатын төмөндөтөт.
Инфекциянын уникалдуу ыкмасынан улам A. tumerfaciens гендик инженерияда трансгендик өсүмдүктөрдү өндүрүү үчүн курал катары кеңири колдонулат. Шишик пайда кылуучу гендер басылып, инсектицидге туруктуу гендер жана гербицидге туруктуу гендер сыяктуу керектүү гендер рекомбинантты ДНК технологиясын колдонуу менен Ti плазмидине киргизилет же рекомбинацияланат жана өсүмдүктөрдү өстүрүү программаларында колдонулат. Т-ДНК A. tumerfaciens инфекциясы менен өсүмдүктөргө өткөндө, өсүмдүктөр табигый түрдө керектүү гендердин таасирине ээ болушат. Демек, Т-ДНКга киргизилген ар кандай чет элдик ДНК бул бактериянын табигый инфекция процессинин жардамы менен өсүмдүк клеткасынын геномуна интеграцияланышы мүмкүн.
01-сүрөт: A. tumerfaciens ти плазмиди
Ри Плазмид деген эмне?
Тамыр индукциялоочу плазмида (Ri Plasmid) – A. rhizogenes бактериясы алып жүрүүчү плазмида. Ри плазмиди эки канаттуу өсүмдүктөрдүн түктүү тамыр оорусу деп аталган ооруга жооптуу. A. rhizogenes инфекциясы инфекция болгон жерде же ага жакын жерде кошумча тамырлардын кеңири пайда болушун шарттайт. Түктүү тамырды индукциялоочу гендер Ri плазмидинин Т-ДНК аймагында жайгашкан. Ri плазмиди Ti плазмидине окшош чоңураак плазмид. A. rhizogenes ошондой эле RI плазмидинин Т-ДНК аймагын өсүмдүк клеткаларына которууга жана өсүмдүк клеткасынын геному менен интеграцияланууга жөндөмдүү, ошондой эле ооруларды пайда кылуу үчүн өсүмдүк клеткасынын механизмдерин колдонуу менен транскрипцияларды алуу үчүн. Демек, Ri плазмиддери өсүмдүктөрдүн генетикалык инженериясында маанилүү векторлор катары да кызмат кылат.
Ti менен Ri Plasmidдин ортосунда кандай айырма бар?
Ti vs Ri Plasmid |
|
| Ti плазмидасы - тегерек формадагы жана чоңураак плазмида А. tumerfaciens | Ri плазмидасы - тегерек формадагы жана чоңураак плазмида, А. ризогендер |
| Оору | |
| Ti плазмиди өсүмдүктөрдүн өт оорусунун гендерин коддойт | Ri плазмиди эки канаттуу өсүмдүктөрдүн түктүү тамыр оорусунун гендерин коддойт. |
Кыскача маалымат – Ti vs Ri Plasmids
Ti жана Ri плазмидалары тиешелүүлүгүнө жараша A. tumerfaciencs жана A. rhizogenes тарабынан камтылган патогендик плазмидалар. Ti плазмидасында шишик козгоочу гендер бар, алар өсүмдүктөрдө өт оорусун пайда кылат. Ri плазмидинде өсүмдүктөрдө түктүү тамыр ооруларын пайда кылуучу тамырды индукциялоочу гендер бар. Бул Ti жана Ri плазмиддердин ортосундагы негизги айырма. Бул плазмиддер алардын плазмиддик ДНКсынын бир бөлүгүн кабыл алуучу геномго өткөрүп берүү табигый жөндөмдүүлүгүнөн улам өсүмдүктөрдүн генетикалык инженериясында векторлор катары колдонулушу мүмкүн. Алар ген кластерлерин камтыйт жана өлчөмү болжол менен 200 кбит. Ар бир плазмид уникалдуу гендерди камтыйт.
