Негизги айырма – Метаболомика менен Метабономика
Метаболиттер – клеткалардагы зат алмашуу реакцияларына катышкан майда молекулалар. Метаболиттерге зат алмашуунун ортоңку заттары, гормондор, экинчилик метаболиттер, сигнал берүүчү молекулалар жана башкалар кирет. Алар клеткалардын биохимиялык реакцияларынын иштөөчү молекулалары. Биологиялык үлгүнүн же бир организмдин метаболиттеринин толук жыйындысы метаболом деп аталат. Metabolome - дененин ичинде секунд сайын өзгөрүп турган динамикалык коллекция. Метаболомика жана метабономика организмдин метаболомасын изилдөөгө байланыштуу эки термин. Метаболомика менен метабономиканын негизги айырмасы метаболомика клеткалык же органдык деңгээлде нормалдуу эндогендик метаболизмге жана метаболизм профилине көбүрөөк көңүл бурат, ал эми метабономика айлана-чөйрөнүн факторлорунан, оорулардан, ичегилерден улам метаболизмдин бузулушу жөнүндө маалымат менен метаболизм профилин кеңейтүүгө көбүрөөк көңүл бурат. микроорганизмдер жана метаболизм профилин салыштыруу ж.б. Метаболомика негизинен масс-спектрометрия менен шартталган, ал эми метабономика метаболиттерди талдоо үчүн ЯМР спектроскопиясын колдонот.
Метаболомика деген эмне?
Метаболомика - клеткаларда, биосуюктуктарда, ткандарда же организмдерде пайда болгон зат алмашуу процесстерин изилдөө. Бул жакшы аналитикалык жана статистикалык куралдарды колдонуу менен уюлдук метаболиттерди аныктоону жана санын аныктоону камтыйт. Метаболомика маанилүү изилдөө катары каралат, анткени ал организмдеги зат алмашуу жөнүндө маалыматты ачып берет.
Субстраттарды жана зат алмашуу реакцияларынын продуктуларын изилдөө үчүн метаболомика аналитикалык платформа катары масс-спектрометрияны колдонот. Масс-спектрометрия метаболиттердин түрлөрүн жана алардын концентрацияларын ачып берет, клеткалардын же ткандардын чыныгы биохимиялык абалын чагылдырат. Демек, метаболомиканы организмдин молекулярдык фенотипинин эң мыкты өкүлү катары кароого болот. Метаболомика – бул организмдердин майда молекулаларынын омикалык технологиясы жана башка омикалык изилдөөлөр менен салыштырганда; метаболомика абдан маанилүү, анткени ал клеткалардын биохимиялык реакциясынын учурдагы абалын түздөн-түз чагылдырат.
Метаболомиканы протеомиканын уландысы катары да кароого болот, анткени алар төмөнкү сүрөттө көрсөтүлгөндөй белоктор болгон ферменттердин активдүүлүгүнөн улам пайда болот.
01-сүрөт: Метаболомика схемасы
Метабономика деген эмне?
Метабономика патофизиологиялык стресстерге же генетикалык модификацияга байланыштуу белгилүү бир убактагы көп параметрлик метаболизмдик жооптордун сандык өлчөөсү катары аныкталат. Бул, адатта, адамдын тамактануусу жана дары-дармектерге же ооруларга реакциясы жөнүндө жүргүзүлгөн изилдөөлөргө карата колдонулат. Бул ыкманы Лондондогу Империал Колледжде Жереми Николсон негиздеген жана ал бир катар тармактарда колдонулган, анын ичинде токсикология, оорулардын диагностикасы, тамактануу ж.б. зат алмашуунун.
Метабономика метаболомикада жеке метаболизмдик кошулмаларды аныктоонун ордуна биохимиялык профилдерди салыштырууга көбүрөөк кызыкдар. Ошондуктан, метабономиканы метаболомиканын бир бөлүгү катары аныктоого болот. Ал негизинен ар түрдүү популяциялардын метаболизм профилдерин ооруларга, экологиялык стресстерге, генетикалык модификацияга, тамактанууга, дары-дармектерге жана башкаларга салыштырууга басым жасайт. Себеби метаболиттер оорунун шарттарын, дары-дармектердин таасирин, экологиялык стресстерди, токсиндердин таасиринен кабар берген жакшы маркерлер болуп саналат., ж.б.
Метабономикалык изилдөөлөр клетка ичиндеги жана клеткадан тышкаркы метаболиттерди да аныктайт. Бул клеткалардын физиологиялык абалын убактылуу иликтөөгө мүмкүндүк берүүчү бир эле учурда жана кайра-кайра көп сандагы метаболиттерди талдоо үчүн жогорку өткөрүү жөндөмдүүлүгүн колдонот. Ошондой эле метаболиттер менен организмдин патологиялык абалынын ортосундагы байланышты ачып берет. Метабономикалык изилдөөлөрдү колдоо үчүн геномика жана протеомика колдонулушу мүмкүн, анткени алар жогорудагы сүрөттө көрсөтүлгөндөй өз ара байланышта.
Метаболомика менен Метабономиканын айырмасы эмнеде?
Metabolomics vs Metabonomics |
|
| Метаболомика – бул организмдин метаболиттеринин толук комплексин изилдөө | Метабономика – бул патофизиологиялык стимулдарга же генетикалык модификацияга убактылуу түрдө тирүү системалардын көп параметрлик метаболикалык жоопторун сандык изилдөө. |
| Негизги тынчсыздануу | |
| Metabolomics көбүрөөк метаболизм профилин түзүү жана клеткалардагы жеке метаболиттерди аныктоо менен алектенет. | Метабономика популяциялардын метаболиттерин же метаболизм профилдерин генетикалык модификацияларга, ооруларга, экологиялык стресстерге, патологиялык стимулдарга, дарыларга ж.б. салыштырууга көбүрөөк байланыштуу. |
| Маалымат | |
| Метаболомика негизинен эндогендик метаболизмге багытталган. | Метабономика эндогендик метаболизм менен чектелбейт. Ал ички жана тышкы факторлордон келип чыккан метаболизмдин бузулушу, мисалы, тамактануу, токсиндер, оору процесстери ж.б.у.с. жөнүндө маалыматты табуу үчүн колдонулат. |
| Аналитикалык куралдар | |
| Негизги аналитикалык платформа катары масс-спектрометрия колдонот | Metabonomics негизги аналитикалык платформа катары ЯМР спектроскопиясын колдонот. |
Кыскача – Metabolomics vs Metabonomics
Метаболома клеткада же организмде бар метаболиттер деп аталган майда молекулалардын толук жыйындысын билдирет. Метаболомика - бул метаболизм профилин түзүү үчүн бүт метаболоманы изилдөө. Метаболомика илимпоздорго клетканын же организмдин чыныгы физиологиялык абалын өлчөөгө мүмкүндүк берет. Метабономика - метаболомиканын бир бөлүгү, ал патофизиологиялык стимулдарга жана генетикалык модификацияларга тирүү системалардын көп параметрлик метаболизмдик жооптору жөнүндө маалымат алуу үчүн колдонулат. Метабономика метаболомика сыяктуу жеке метаболизм профилин түзүү менен гана чектелбейт; ал айлана-чөйрөнүн стресстери, оорулар, токсиндер ж.б. сыяктуу башка факторлорго карата метаболизм профилдерин салыштырат. Метаболомика да, метабономика да клеткалардын чыныгы физиологиялык абалын өлчөө үчүн организмдердин метаболиттерин изилдөөнү камтыйт. Демек, кээде бул экөө метаболомика менен метабономиканын айырмасын эске албастан, синонимдер катары каралат.
