Негизги айырма – VNTR менен STR
ДНК изилдөөлөрүнүн филогенетикалык байланыштарды түшүнүүдө жана аныктоодо, генетикалык ооруларды диагностикалоодо жана организмдин геномдорун картага түшүрүүдө зор пайдасы бар. Белгилүү бир генди же белгисиз ДНКнын бассейниндеги ДНК ырааттуулугун аныктоо үчүн ДНК анализи менен байланышкан бир нече ыкмалар колдонулат. Алар генетикалык маркерлер катары белгилүү. Генетикалык маркерлер молекулярдык биологияда индивиддердин жана түрлөрдүн ортосундагы генетикалык вариацияны аныктоо үчүн колдонулат. Өзгөрмө сандагы тандемдик кайталоо (VNTR) жана кыска тандемдик кайталоо (STR) - бул адамдар арасында полиморфизмди көрсөткөн генетикалык маркерлердин эки түрү. Эки түрү тең тандемдик кайталануучу коддолбогон кайталануучу ДНК болуп саналат. Алар хромосомаларда баштан куйрукка чейин тизилген. VNTR - кыска нуклеотиддердин ырааттуулугу бир нече жолу кайталанган геномдун бөлүмү. STR - геномдун ичиндеги ДНКнын дагы бир бөлүмү, ал экиден он үч нуклеотидден турган жүз жолу кайталануучу бирдиктер катары уюштурулат. VNTR жана STR ортосундагы негизги айырма кайталануучу ырааттуулугу нуклеотиддердин саны болуп саналат. VNTRнын кайталануучу бирдиктери 10дон 100гө чейин нуклеотиддерден турат, ал эми STRдин кайталануучу бирдиги 2ден 13кө чейин нуклеотиддерден турат. VNTR жана STR соттук изилдөөдө кеңири колдонулат.
VNTR деген эмне?
Тандемдик кайталоо – бул белгилүү бир хромосомалык локуста баштан куйрукка чейин кайталануучу ДНКнын кыска ырааттуулугу. Тандем кайталоосунда башка ырааттуулук же нуклеотид жок. Геномдо тандемдик кайталоолордун бир нече түрү бар. VNTR 10дон 100гө чейин нуклеотиддерден турган кайталануучу бирдиктерге ээ болгон тандемдик кайталоонун бир түрү. VNTR - мини спутниктин бир түрү. Бул тандемдик кайталоолорду көптөгөн хромосомалардан табууга болот. Алар адамдын геномунун ичинде кесилишкен жана негизинен хромосомалардын субтеломердик аймактарында жайгашкан.
VNTR жеке адамдар арасында тандемдик кайталануучу полиморфизмди көрсөтөт. Хромосоманын белгилүү бир жериндеги VNTR узундугу ошол ДНК бөлүмүндө уюштурулган кайталануучу бирдиктердин санынын өзгөрүшүнө байланыштуу адамдар арасында өтө өзгөрмөлүү. Ошондуктан, VNTR инсандарды аныктоодо күчтүү курал катары колдонулушу мүмкүн жана VNTR талдоо генетика, биология изилдөө, криминалистика жана ДНК манжа басып чыгаруу сыяктуу көптөгөн тармактарда колдонулат. VNTRs жилик чучугунун трансплантациясынын санын аныктоо үчүн колдонулган биринчи генетикалык маркерлер болгон. VNTRлер ошондой эле соттук экспертизада ДНК профилин түзүүдө колдонулган биринчи полиморфтук маркерлер болгон.
01-сүрөт: VNTRлердин алты адамдагы вариациясы
VNTR анализи чектөө фрагментинин узундугу полиморфизми, андан кийин түштүк гибриддештирүү аркылуу жүргүзүлөт. Демек, салыштырмалуу чоң ДНК үлгүсү керек. VNTR профилин чечмелөө да көйгөйлүү. Мындай чектөөлөрдөн улам соттук генетикада VNTR колдонуу чектелген жана ал STR анализи менен алмаштырылган.
STR деген эмне?
STR – тандемдик тартипте уюштурулган экиден он үчкө чейин нуклеотиддик кайталануучу бирдиктерден турган өтө кайталануучу ДНК бөлүмү. STR VNTRге окшош. Бирок ал VNTRден кайталануучу ырааттуулуктагы нуклеотиддердин санына жана кайталануулардын санына чейин өзгөрөт. STR - микроспутниктин бир түрү.
STR анализи кайталануучу бирдиктердин так санын өлчөө үчүн колдонулат. STRs VNTs окшош адамдар арасында өтө өзгөрүлмө болуп саналат. STR профилдери адамдан адамга айырмаланат. Ошондуктан, STR анализи молекулярдык биологияда эки же андан көп үлгүдөгү ДНКдагы белгилүү локустарды салыштыруу үчүн колдонулат. Демек, STRs молекулярдык биологияда күчтүү генетикалык маркерлер катары каралат. Бул адамдардын полиморфизминин жогорку даражасы жана узундугу салыштырмалуу кыска болгондуктан, аларды идентификациялоо үчүн эң сонун курал менен камсыз кылат.
Учурда STRs соттук генетикада эң көп колдонулган анализделген генетикалык полиморфизм куралы болуп саналат. Көпчүлүк соттук иш STR полиморфтук анализди камтыйт. STR локустары бүт геномдо таралган. Соттук анализде колдонулушу мүмкүн болгон хромосомаларда жайгашкан миңдеген STR бар. STR анализи VNTR анализи сыяктуу чектөө узундугу полиморфизмин камтыбайт. STR анализи чектөө ферменттери менен ДНКны кесип бербейт. Өзгөчө зонддор ДНКга керектүү аймактарды туташтыруу үчүн колдонулат жана ПТР ыкмасын колдонуу менен STR узундугу аныкталат.
02-сүрөт: Үлгүлөрдүн ортосундагы STR өзгөрүүсү
VNTR менен STRдин кандай окшоштуктары бар?
- VNTR жана STR коддолбогон ДНКлар.
- Экөө тең тандемдик кайталоо.
- ДНК бөлүгүнүн узундугунун айырмасынан улам экөө тең жеке адамдар арасында полиморфизмди көрсөтөт.
- Экөө тең ДНК манжаларын басып чыгарууда жана соттук изилдөөдө күчтүү генетикалык маркерлер катары колдонулат.
VNTR менен STRдин ортосунда кандай айырма бар?
VNTR крш STR |
|
| VNTR – тандем түрүндө кайталанган кыска нуклеотид ырааттуулугу бар коддолбогон кайталануучу ДНК. | STR – тандемдик тартипте уюштурулган экиден он үчкө чейин нуклеотиддик кайталануучу бирдиктерден турган өтө кайталануучу ДНК бөлүмү. |
| Размер | |
| VNTRлер STRден чоңураак. | STR VNTRлерден кичине. |
| Кайталануучу ырааттуулуктагы нуклеотиддердин саны | |
| VNTRдин кайталануучу бирдиги 10дон 100гө чейин нуклеотиддерден турат. | STRдин кайталануучу бирдиги 2ден 13кө чейин нуклеотидден турат. |
Корытынды – VNTR менен STR
VNTR жана STR - молекулярдык биологияда, өзгөчө соттук генетика тармагында колдонулган эки күчтүү генетикалык маркерлер. VNTR - мини-спутниктин бир түрү жана STR - микроспутник. VNTR жана STR коддолбогон, өтө кайталануучу ДНК. Алар тандемдик кайталоо болуп саналат. VNTR менен СТРдин жалпы түзүлүшү бирдей. Бирок кайталануучу катардагы нуклеотиддердин саны жана узундугу ар кандай. VNTR 10дон 100гө чейин нуклеотиддерден турган кайталануучу тизмекке ээ. STR 2ден 13кө чейин нуклеотиддерден турган кайталануучу тизмекке ээ. Бул VNTR менен STR ортосундагы айырма.
VNTR менен STRдин PDF версиясын жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, цитаталарга ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз VNTR жана STR ортосундагы айырма.
