Негизги айырмасы – Микроаррей менен Кийинки муундун ырааттуулугу
ДНК секвенирлөө процесстери биотехнология, вирусология, медициналык диагностика жана соттук-медициналык илимдер тармактарында кеңири колдонулат. Бул ДНК молекуласындагы нуклеотиддердин, адениндин, гуаниндин, тиминдин жана цитозиндин так тартибин аныктоочу процесс. ДНКнын секвенирлөө процедуралары медициналык жана биологиялык изилдөөлөрдөгү кереметтүү ачылыштардын тездетүүчүсү болуп калды. Бул секвенирлөө ыкмалары жеке организмдердин толук геномун, анын ичинде адамдарды жана башка тирүү түрлөрдү секвенирлөөгө чейин эволюцияланган. Microarrays жана Next Generation Sequencing - заманбап ДНК секвенирлөө процедуралары. Микроаррей техникасы белгилүү максаттардын топтомун камтыган гибриддештирүүгө негизделген. Кийинки муундун секвенциясы синтезге негизделет (ал ДНК-полимеразаны нуклеотиддерди кошуу үчүн колдонот) жана мурда тандалган максаттарга көз карандысыз бүт геномду секвенирлөө мүмкүнчүлүгүнө ээ. Бул Microarray менен Кийинки муундун ырааттуулугунун ортосундагы негизги айырма.
Микроаррей деген эмне?
ДНК микроаррей бир эле учурда миңдеген түрдүү ген экспрессияларын аныктоо үчүн лабораториялык курал катары колдонулат. Бул катуу бет, б.а., микроскоп слайды, анда басылган микроскопиялык ДНК тактарынын жыйнагы бар. Ар бир басылган так белгилүү ген тизмегин же генди камтыйт. Слайдга басылган бул белгилүү зонддор ген экспрессиясын аныктоо үчүн зонд катары кызмат кылат. Бул транскриптом деп аталат. Эки ДНК тилкесинин ортосундагы гибриддештирүү микроэлементтердин негизги принциби болуп саналат. Бул суутек байланыштарынын пайда болушу менен нуклеиндик кислота тизмегинин кошумча негиздер жупташы.
01-сүрөт: Микроаррей
Башында mRNA молекулалары эксперименталдык үлгүдөн жана дени сак адамдан алынган маалымдама үлгүсүнөн чогултулат. Эксперименттик үлгүлөр оорулуу адамдардан алынат; мисалы, рак менен ооруган адам. Алынгандан кийин эки мРНК үлгүсү тең cDNAга (комплементарлык ДНК) айланат. Андан кийин, ар бир үлгү флуоресценттүү зонддун жардамы менен белгиленет. Флуоресценттик зонддор cDNA үлгүсүн шилтеме cDNAдан айырмалоо үчүн ар кандай түстө. cDNA молекулаларынын микроаррей слайдына байланышын баштоо үчүн, эки үлгү аралаштырылат. Гибриддештирүү - бул кДНК молекулаларынын микроаррей слайдындагы ДНК зонддоруна туташтырылган процесс. Гибриддештирүү аяктагандан кийин ар бир гендин экспрессиясын гендин көлөмүнө жараша ар кандай түстөрдүн көрүнүшү менен аныктоо жана өлчөө үчүн бир катар реакциялар ишке ашат. Микроаррейден алынган натыйжалар ген экспрессия профилин түзүүдө колдонулат, ал ар кандай оору шарттарын аныктоо үчүн колдонулушу мүмкүн.
Кийинки муундун тизилиши деген эмне?
Next Generation Sequencing (NGS) – генетикалык секвенирлөөнүн өнүккөн ыкмасы. Анын принциби капиллярдык электрофорезге көз каранды болгон Sanger Sequencing принцибине окшош. NGSде геномдук жип фрагменттелген жана шаблондук жипке байланган. Ар бир жиптин негиздери анын лигация процессинде чыгарылган сигналдар менен аныкталат. Сэнгер секвенирлөө методунда үч өзүнчө кадам, секвенирлөө, бөлүү жана аныктоо кирет. Бул өзүнчө кадамдардан улам үлгүлөрдү даярдоону автоматташтыруу өткөрүү жөндөмдүүлүгү менен чектелет. NGSде техника Сэнгер секвенирлөө процедурасынын кадамдарынын айкалышы менен массивге негизделген секвенирлөөнүн жардамы менен иштелип чыккан, бул миллиондогон реакция серияларын бир эле учурда параллелдүү жүргүзүүгө алып келиши мүмкүн; бул жогорку ылдамдыкка жана арзан баада өткөрүүгө алып келет.
02-сүрөт: NGSдеги өнүгүүлөр
NGS үч кадамдан турат; китепкананы даярдоо (ДНКнын кокус фрагментациясын колдонуу менен китепканаларды түзүү), амплификациялоо (клондук күчөтүү жана ПТРди колдонуу менен китепкананы күчөтүү) жана секвенирлөө. Сэнгер секвенирлөө процедурасы аркылуу өтө узак убакытка аткарылуучу геномду секвенирлөө процесстери NGS аркылуу бир нече сааттын ичинде бүтүшү мүмкүн.
Микроаррей менен кийинки муундун секвенирлөөнүн ортосунда кандай окшоштук бар?
Микроаррей жана Кийинки муун тизмеги массивге негизделген секвенирлөө аркылуу иштелип чыккан
Микроаррей менен кийинки муундун секвенирлөөнүн ортосунда кандай айырма бар?
Микроаррей менен Кийинки муундун ырааттуулугу |
|
| Microarray – катуу бетке жабышкан микроскопиялык ДНК тактарынын жыйындысы, ал бир эле учурда көп сандагы гендердин экспрессия деңгээлин өлчөө үчүн колдонулат. | NGS (Кийинки муундун секвенциясы) - миллиондогон же миллиарддаган ДНК тилкелерин параллелдүү секвенирлөө үчүн Сэнджерге негизделбеген жогорку өтүмдүү ДНК секвенирлөө технологиясы. |
| Антиген менен өз ара аракеттенүү | |
| Microarray белгилүү максаттардын топтомунан турган гибриддештирүүгө негизделген. | NGS нуклеотиддерди кошуу үчүн ДНК-полимеразаны колдонгон синтезге негизделген жана мурда тандалган максаттарга көз каранды эмес. |
Кыскача маалымат – Микроаррей менен Кийинки муундун ырааттуулугу
Изилдөөлөрдүн контекстинде ДНКнын тизилиши маанилүү акселерант болуп калды. Ал биотехнологияда, медициналык диагностикада жана соттук экспертизада кеңири колдонулат. Ал өнүккөн жана кыйла натыйжалуу жана тез секвенирлөө процедураларына айланган. Microarrays жана NGS эки өнүккөн ДНК секвенирлөө ыкмалары болуп саналат. Экөө тең массивге негизделген секвенирлөө аркылуу иштелип чыккан. Микроаррей техникасы гибриддештирүүгө таянат, ал эми NGS нуклеотиддерди кошуу үчүн ДНК полимеразаны колдонгон синтезге негизделген. Бул Microarray менен Кийинки муун тизмегинин ортосундагы негизги айырма.
Микроаррейдин PDF версиясын жана кийинки муундун тизилишин жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, шилтеме эскертүүсүнө ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз Микроаррей менен кийинки муундун ырааттуулугунун ортосундагы айырма
