Талапкер гени менен GWAS ортосундагы негизги айырма, талапкер гендик мамиле кызыктырган аз сандагы алдын ала көрсөтүлгөн гендердин ичиндеги генетикалык вариацияны изилдейт, ал эми GWAS белгилүү бир оорунун артында жалпы генетикалык вариация үчүн бүт геномду изилдейт.
Талапкер ген мамилеси жана геномдук ассоциациялык изилдөөлөр (GWAS) ооруларга генетикалык ийкемдүүлүктү аныктоо үчүн маанилүү болгон эки ыкма. Талапкер ген мамилеси гендердин алдын ала көрсөтүлгөн аз санына негизделген, ал эми GWAS бүт геномду сыноого негизделген. Демек, талапкер ген мамиле GWAS айырмаланып, ооруга тиешеси бар гендер боюнча алдын ала билимди талап кылат.
Талапкер Ген деген эмне?
Талапкер ген мамилеси - алдын ала көрсөтүлгөн кызыкчылык гендердин ичиндеги генетикалык вариациянын жана фенотиптердин же оорунун абалынын ортосундагы байланышты изилдеген ыкмалардын бири. Бул ыкмада гендин каралып жаткан белгиге же ооруга биологиялык функционалдуу таасири жөнүндө алдын ала маалыматка ээ болуу зарыл. Бул билимдин негизинде аз сандагы гендер тандалып, генетикалык вариацияга талданат.
01-сүрөт: Талапкер ген мамилеси
Гендерди тандоо бул ыкмада каралып жаткан ооруга биологиялык, физиологиялык жана функционалдык тиешелүүлүгүнө жараша жүргүзүлөт. Бул ыкма көбүнчө кейс-контролдук изилдөө катары иштелип чыккан.
GWAS деген эмне?
GWAS – Геном боюнча Ассоциациянын Изилдөө дегенди билдирет. Ал ошондой эле бүтүндөй геномдук ассоциацияны изилдөөнү билдирет. Бул изилдөөлөр, негизинен, байкоо изилдөөлөргө багытталган. Алар адатта белгилүү бир өзгөчөлүк менен байланышкан ар кандай адамдардын генетикалык варианттарын талдайт. GWAS анализи үчүн бүт геном маанилүү.
GWAS ар кандай оорулар менен байланышкан бир нуклеотиддик полиморфизмдерди талдоодо маанилүү курал болуп саналат. Бул кеңири популяциядагы ар кандай жалгыз нуклеотиддик полиморфизмдердин салыштырма изилдөөсү. GWAS изилдөө үлгүсү абдан жогору; демек, ал кесилиштүү когорттук изилдөө форматын да алат.
02-сүрөт: GWAS
Биринчи GWAS изилдөөсү миокарддын инфарктысына байланыштуу жана миокард инфаркты менен байланышкан гендерди талдоо боюнча өттү. Учурда GWAS этиологиясы белгисиз татаал оорулардын генетикалык фонун аныктоодо маанилүү ролду ойнойт.
Талапкер Ген менен GWASтин кандай окшоштуктары бар?
- Талапкер ген мамилеси жана GWAS экөө тең оорунун генотипинин жана фенотипинин ортосундагы генетикалык байланышты талдоочу ыкмалар.
- Эки ыкма тең ооруга ийкемдүүлүктүн генетикалык негиздерин түшүнүүгө жардам берет.
Талапкер Ген менен GWASтин ортосунда кандай айырма бар?
Талапкер гендик мамиле талапкер гендерге же алдын ала көрсөтүлгөн гендерге негизделген, ал эми GWAS бүт геномго негизделген. Ошентип, бул талапкер ген менен GWAS ортосундагы негизги айырма. Ошондой эле, талапкер гендик мамиледе гендерди тандоо зарыл, ал эми GWASте талап кылынбайт.
Мындан тышкары, талапкер ген мамилеси ооруга тиешелүү гендер боюнча алдын ала билимди талап кылат, ал эми GWAS үчүн зарыл эмес.
Төмөндөгү инфографикада талапкер гени менен GWAS ортосундагы айырмачылыкка байланыштуу кененирээк салыштыруу берилген.
Кыскача маалымат – Талапкер Ген менен GWAS
Талапкер ген жана GWAS эки ген бирикмеси изилдөө болуп саналат. Талапкер ген мамилеси алдын ала көрсөтүлгөн гендердин аз сандагы оору менен байланышкан генетикалык вариацияга багытталган. Ал эми, GWAS бүт геномдун ичинде оору менен байланышкан генетикалык вариацияны изилдейт. Ошентип, бул талапкер ген менен GWAS ортосундагы негизги айырма. Бул эки ыкма тең ооруга ийкемдүүлүктүн генетикалык негиздерин түшүнүүдө маанилүү.
