Гомодимер менен гетеродимердин ортосундагы негизги айырма - бул гомодимер эки бирдей белоктордон жасалган белок, ал эми гетеродимер эки башка белоктордон жасалган белок.
Белок аминокислота чынжырларынан турган биомолекула. Протеин димери - эки протеин мономеринин же эки аминокислота чынжырынын кошулушунан пайда болгон төртүнчү белок структурасы. Негизинен алар бири-бири менен коваленттик эмес байланыштар аркылуу байланышат. Белок димерлери гомодимерлер же гетеродимерлер. Гомодимерде коваленттүү эмес эки бирдей протеин бар. Гетеродимерде бири-бирине байланышкан эки башка белоктор бар. Бул протеин димер өз ара жөнгө салуу жана катализ маанилүү болуп саналат.
Гомодимер деген эмне?
Гомодимер эки бирдей мономерден турган белок димеринин бир түрү. мономерлер коваленттүү эмес байланыштар менен байланышат. Жалпысынан алганда, гомодимерлерде H байланыштарынын 18 орточо саны бар. Мындан тышкары, H-байланыштары менен гомодимердеги интерфейс калдыктарынын ортосундагы корреляция коэффициенти 0,85. Андан тышкары, гомодимердин интерфейсинин калдыктарынын H байланыштарынын максималдуу саны 0,44. Ал гана эмес, гомодимерлерде дагы молекулалар аралык H байланыштары бар. Бирок, бир интерфейстин калдыктары үчүн H байланыштарынын тыгыздыгы гомодимерлерде төмөн.
01-сүрөт: Homodimer
Гомодимерлерге мисалдарды карап жатканда, 1-класстагы РНКлар гомодимерлер болуп саналат. Бул гомодимерде R1 протеини нуклеотиддердин кыскарышына жооп берет, ал эми R2 протеини дирон тирозил массивинин сакталышы үчүн жооптуу. Дагы бир протеин гомодимери - бул калкан бези тарабынан өндүрүлгөн тироглобулин. Ксантин оксидазасы жана этанерцепт да белок гомодимерлери.
Гетеродимер деген эмне?
Гетеродимер эки окшош эмес мономерден комплекстүү протеин димеринин бир түрү. Башка сөз менен айтканда, бир гетеродимер эки башка протеин мономерден турган белок болуп саналат. Жалпысынан алганда, гетеродимерлерде H байланыштарынын 12 орточо саны бар. Мындан тышкары, гетеродимердеги Н-байланыштары менен интерфейс калдыктарынын ортосундагы корреляция коэффициенти 0,83. Мындан тышкары, гетеродимердин интерфейсинин калдыктарынын H байланыштарынын максималдуу саны 0,65ти түзөт. Гомодимерлерге салыштырмалуу гетеродимерлерде молекулалар аралык Н байланыштары азыраак. Бирок, гетеродимерлерде интерфейстин калдыктары үчүн H байланыштарынын тыгыздыгы жогору.
02-сүрөт: Гетеродимер
Тескери транскриптаза ферменти – эки түрдүү аминокислота чынжырынан турган гетеродимер. Гетеродимердин дагы бир мисалы опиоиддик рецепторлор. Мындан тышкары, тубулин гетеродимер протеин болуп саналат.
Гомодимер менен Гетеродимердин кандай окшоштуктары бар?
- Гомодимер жана гетеродимер - белок диммерлеринин эки түрү.
- Экөөнүн тең эки мономери бар.
- Алар төртүнчү белок структуралары.
- Димерлер катализ жана жөнгө салууда кеңири таралган.
Гомодимер менен Гетеродимердин ортосунда кандай айырма бар?
Гомодимер эки бирдей протеин мономеринен турган белок димери, ал эми гетеродимер эки башка протеин мономеринен турган белок димери. Ошентип, бул гомодимер менен гетеродимердин ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, гомодимерлерде H байланыштарынын 18 орточо саны бар, ал эми гетеродимерлерде H байланыштарынын 12 орточо саны бар.
Мындан тышкары, гомодимер менен гетеродимердин дагы бир айырмасы, Н-байланыштары менен интерфейс калдыктарынын ортосундагы корреляция коэффициенти гомодимерлерде 0,85, ал эми гетеродимерлерде 0,83.
Төмөндө гомодимер менен гетеродимердин ортосундагы айырманын инфографикасында эки димердин тең салыштыруулары көрсөтүлгөн.
Кыскача – Гомодимерге каршы Heterodimer
Белок димерлери катализ жана жөнгө салууда кеңири таралган. Алар гомодимерлер же гетеродимерлер болушу мүмкүн. Гомодимерлер эки бирдей протеин мономеринен турат. Ал эми, гетеродимерлер эки окшош эмес протеин мономеринен турат. Ошентип, бул гомодимер менен гетеродимердин ортосундагы негизги айырма.
